MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5625	NC_008319	TAA	2	6	279870	279875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953074
5626	NC_008319	CGC	2	6	279889	279894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953074
5627	NC_008319	CAG	2	6	280010	280015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5628	NC_008319	CAA	2	6	280042	280047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953074
5629	NC_008319	TGATG	2	10	280060	280069	20 %	40 %	40 %	0 %	113953074
5630	NC_008319	CGC	3	9	280087	280095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953074
5631	NC_008319	TGC	2	6	280108	280113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5632	NC_008319	TGG	2	6	280137	280142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953074
5633	NC_008319	CTG	2	6	280144	280149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5634	NC_008319	ATC	2	6	280301	280306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953074
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5636	NC_008319	GATC	2	8	280328	280335	25 %	25 %	25 %	25 %	113953074
5637	NC_008319	A	6	6	280369	280374	100 %	0 %	0 %	0 %	113953074
5638	NC_008319	GCT	2	6	280508	280513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953074
5639	NC_008319	AAG	2	6	280544	280549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953074
5640	NC_008319	GCGA	2	8	280575	280582	25 %	0 %	50 %	25 %	113953074
5641	NC_008319	GCC	2	6	280607	280612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953074
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5645	NC_008319	GA	3	6	280643	280648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_008319	GGC	2	6	280705	280710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954106
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5649	NC_008319	CTG	2	6	280810	280815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954106
5650	NC_008319	TCGA	2	8	280853	280860	25 %	25 %	25 %	25 %	113954106
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5658	NC_008319	GCTTC	2	10	281217	281226	0 %	40 %	20 %	40 %	113954106
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5686	NC_008319	GCT	2	6	282473	282478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954192
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5691	NC_008319	GTT	2	6	282792	282797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5692	NC_008319	GTT	2	6	282902	282907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953334
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5725	NC_008319	CGA	2	6	284299	284304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954476
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5733	NC_008319	TGG	2	6	284742	284747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954476
5734	NC_008319	GCT	2	6	284760	284765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954476
5735	NC_008319	ATCGG	2	10	284839	284848	20 %	20 %	40 %	20 %	113954476
5736	NC_008319	AGCGGG	2	12	284859	284870	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	113954476
5737	NC_008319	AGC	2	6	284907	284912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5738	NC_008319	GCC	2	6	284915	284920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5739	NC_008319	TGC	2	6	284977	284982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5740	NC_008319	AGG	2	6	285003	285008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954573
5741	NC_008319	GAT	2	6	285036	285041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954573
5742	NC_008319	GAT	2	6	285075	285080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954573
5743	NC_008319	CTG	2	6	285102	285107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5744	NC_008319	GTG	2	6	285159	285164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954573
5745	NC_008319	CTG	2	6	285186	285191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5746	NC_008319	GCC	2	6	285307	285312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954573
5747	NC_008319	CTGG	2	8	285345	285352	0 %	25 %	50 %	25 %	113954573
5748	NC_008319	TGGC	2	8	285403	285410	0 %	25 %	50 %	25 %	113954573
5749	NC_008319	GAGCGT	2	12	285426	285437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954573
5750	NC_008319	GCA	2	6	285448	285453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5751	NC_008319	GAA	2	6	285471	285476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954573
5752	NC_008319	CTG	2	6	285480	285485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5753	NC_008319	GGC	2	6	285527	285532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954573
5754	NC_008319	CGC	2	6	285537	285542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954573
5755	NC_008319	ACG	2	6	285577	285582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
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5757	NC_008319	AGTGA	2	10	285606	285615	40 %	20 %	40 %	0 %	113954573
5758	NC_008319	GGC	2	6	285746	285751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954573
5759	NC_008319	TGG	2	6	285757	285762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954573
5760	NC_008319	GAC	2	6	285936	285941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5761	NC_008319	GCT	2	6	285980	285985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5762	NC_008319	GTT	2	6	286012	286017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954573
5763	NC_008319	CT	3	6	286093	286098	0 %	50 %	0 %	50 %	113954573
5764	NC_008319	AGC	2	6	286135	286140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5765	NC_008319	TTGA	2	8	286158	286165	25 %	50 %	25 %	0 %	113954573
5766	NC_008319	CAG	2	6	286205	286210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5767	NC_008319	TGT	2	6	286285	286290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954573
5768	NC_008319	CTTA	2	8	286356	286363	25 %	50 %	0 %	25 %	113954573
5769	NC_008319	CGA	2	6	286370	286375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954573
5770	NC_008319	GTT	2	6	286406	286411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954573
5771	NC_008319	GTG	2	6	286414	286419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954573
5772	NC_008319	CAG	2	6	286576	286581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5773	NC_008319	GCA	2	6	286633	286638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5774	NC_008319	GTT	2	6	286699	286704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952781
5775	NC_008319	TTG	2	6	286764	286769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952781
5776	NC_008319	GA	3	6	286783	286788	50 %	0 %	50 %	0 %	113952781
5777	NC_008319	TGG	2	6	286807	286812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952781
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5780	NC_008319	GTC	2	6	286984	286989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5781	NC_008319	GTT	2	6	286990	286995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952781
5782	NC_008319	CGG	2	6	287023	287028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952781
5783	NC_008319	CAG	2	6	287154	287159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5784	NC_008319	AGA	2	6	287166	287171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952781
5785	NC_008319	CTG	2	6	287186	287191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5786	NC_008319	GCA	2	6	287248	287253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952781
5787	NC_008319	CT	3	6	287296	287301	0 %	50 %	0 %	50 %	113953597
5788	NC_008319	GGC	2	6	287308	287313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953597
5789	NC_008319	GCA	2	6	287366	287371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953597
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5797	NC_008319	CCAG	2	8	287526	287533	25 %	0 %	25 %	50 %	113953597
5798	NC_008319	AG	3	6	287582	287587	50 %	0 %	50 %	0 %	113953597
5799	NC_008319	GCA	2	6	287603	287608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953597
5800	NC_008319	GCC	2	6	287650	287655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953597
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5803	NC_008319	GC	3	6	287889	287894	0 %	0 %	50 %	50 %	113955021
5804	NC_008319	GGT	2	6	287991	287996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955021
5805	NC_008319	AGT	2	6	288031	288036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955021
5806	NC_008319	GGT	2	6	288037	288042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955021
5807	NC_008319	GTG	2	6	288143	288148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955021
5808	NC_008319	CAA	2	6	288207	288212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955021
5809	NC_008319	CTG	2	6	288260	288265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955021
5810	NC_008319	AGC	2	6	288349	288354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955021
5811	NC_008319	GGA	2	6	288360	288365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955021
5812	NC_008319	AGGTC	2	10	288366	288375	20 %	20 %	40 %	20 %	113955021
5813	NC_008319	GAATG	2	10	288388	288397	40 %	20 %	40 %	0 %	113955021
5814	NC_008319	CCAT	2	8	288517	288524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5815	NC_008319	CTG	3	9	288543	288551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5816	NC_008319	T	6	6	288576	288581	0 %	100 %	0 %	0 %	113954198
5817	NC_008319	TGC	2	6	288601	288606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5818	NC_008319	GAG	2	6	288639	288644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954198
5819	NC_008319	CTG	2	6	288699	288704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5820	NC_008319	ACC	2	6	288720	288725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954198
5821	NC_008319	TGG	2	6	288733	288738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5822	NC_008319	TGG	2	6	288774	288779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5823	NC_008319	TGG	2	6	288804	288809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5824	NC_008319	GCT	2	6	288848	288853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5825	NC_008319	CTG	2	6	288898	288903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5826	NC_008319	ACC	2	6	288930	288935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954198
5827	NC_008319	TGT	2	6	288955	288960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954198
5828	NC_008319	TGG	2	6	289063	289068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5829	NC_008319	GTG	2	6	289072	289077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5830	NC_008319	GA	3	6	289148	289153	50 %	0 %	50 %	0 %	113954198
5831	NC_008319	GAT	2	6	289272	289277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954198
5832	NC_008319	TTGC	2	8	289407	289414	0 %	50 %	25 %	25 %	113954198
5833	NC_008319	ATT	2	6	289416	289421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954198
5834	NC_008319	TGG	3	9	289444	289452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954198
5835	NC_008319	CTG	2	6	289483	289488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954198
5836	NC_008319	TTG	2	6	289507	289512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954198
5837	NC_008319	GAG	2	6	289566	289571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954198
5838	NC_008319	CTGG	2	8	289577	289584	0 %	25 %	50 %	25 %	113954198
5839	NC_008319	CCTG	2	8	289634	289641	0 %	25 %	25 %	50 %	113954198
5840	NC_008319	CTT	2	6	289670	289675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954198
5841	NC_008319	ATC	2	6	289743	289748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954198
5842	NC_008319	GACC	2	8	289867	289874	25 %	0 %	25 %	50 %	113953784
5843	NC_008319	CAT	2	6	289925	289930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953784
5844	NC_008319	TGGT	2	8	289965	289972	0 %	50 %	50 %	0 %	113953784
5845	NC_008319	AGG	2	6	290172	290177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953784
5846	NC_008319	GGT	2	6	290275	290280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953784
5847	NC_008319	ATG	2	6	290343	290348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953784
5848	NC_008319	GGT	2	6	290353	290358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953784
5849	NC_008319	TTGAT	2	10	290361	290370	20 %	60 %	20 %	0 %	113953784
5850	NC_008319	TGT	2	6	290413	290418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953784
5851	NC_008319	CGG	2	6	290427	290432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953784
5852	NC_008319	CGG	2	6	290434	290439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953784
5853	NC_008319	GTG	2	6	290498	290503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953784
5854	NC_008319	TGG	2	6	290574	290579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953784
5855	NC_008319	GC	3	6	290617	290622	0 %	0 %	50 %	50 %	113953784
5856	NC_008319	TGT	2	6	290655	290660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953784
5857	NC_008319	CAC	2	6	290692	290697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953784
5858	NC_008319	CAG	2	6	290777	290782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953784
5859	NC_008319	GATTT	2	10	290863	290872	20 %	60 %	20 %	0 %	113953784
5860	NC_008319	GCG	2	6	290922	290927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952961
5861	NC_008319	GCT	2	6	290968	290973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5862	NC_008319	GCTG	2	8	290978	290985	0 %	25 %	50 %	25 %	113952961
5863	NC_008319	GAC	2	6	291048	291053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5864	NC_008319	GTC	2	6	291066	291071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952961
5865	NC_008319	CGG	2	6	291149	291154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952961
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