MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008319	A	6	6	248562	248567	100 %	0 %	0 %	0 %	113954467
5002	NC_008319	T	6	6	248570	248575	0 %	100 %	0 %	0 %	113954467
5003	NC_008319	AAT	2	6	248588	248593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954467
5004	NC_008319	TGG	2	6	248601	248606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954467
5005	NC_008319	TTC	2	6	248699	248704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_008319	GCC	2	6	248815	248820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_008319	TAA	2	6	248847	248852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008319	A	6	6	248851	248856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008319	ATA	2	6	248864	248869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008319	GAA	2	6	248901	248906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008319	ATT	2	6	248907	248912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953340
5012	NC_008319	AGA	2	6	248947	248952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953340
5013	NC_008319	CAA	3	9	248956	248964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953340
5014	NC_008319	CCCG	2	8	248978	248985	0 %	0 %	25 %	75 %	113953340
5015	NC_008319	CAA	2	6	248992	248997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953340
5016	NC_008319	GAA	2	6	249130	249135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954998
5017	NC_008319	A	6	6	249144	249149	100 %	0 %	0 %	0 %	113954998
5018	NC_008319	TTG	2	6	249218	249223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954998
5019	NC_008319	GCG	2	6	249265	249270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954579
5020	NC_008319	AAG	2	6	249299	249304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954579
5021	NC_008319	AAGC	2	8	249333	249340	50 %	0 %	25 %	25 %	113954579
5022	NC_008319	CGT	2	6	249513	249518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954088
5023	NC_008319	ATGG	2	8	249560	249567	25 %	25 %	50 %	0 %	113954088
5024	NC_008319	TGA	2	6	249606	249611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954088
5025	NC_008319	A	6	6	249616	249621	100 %	0 %	0 %	0 %	113954088
5026	NC_008319	GCT	2	6	249703	249708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_008319	TCG	2	6	249766	249771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954859
5028	NC_008319	GAAG	2	8	249805	249812	50 %	0 %	50 %	0 %	113954859
5029	NC_008319	CCA	2	6	249936	249941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954859
5030	NC_008319	CCATGT	2	12	249973	249984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113954859
5031	NC_008319	GAT	2	6	250007	250012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954859
5032	NC_008319	CCA	2	6	250075	250080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954859
5033	NC_008319	GCT	2	6	250196	250201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954859
5034	NC_008319	TCAC	2	8	250260	250267	25 %	25 %	0 %	50 %	113954859
5035	NC_008319	CCA	2	6	250416	250421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954859
5036	NC_008319	TCT	3	9	250506	250514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954859
5037	NC_008319	GCC	2	6	250547	250552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954859
5038	NC_008319	GTG	2	6	250692	250697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954859
5039	NC_008319	CACC	2	8	250701	250708	25 %	0 %	0 %	75 %	113954859
5040	NC_008319	A	7	7	250734	250740	100 %	0 %	0 %	0 %	113954859
5041	NC_008319	A	6	6	250746	250751	100 %	0 %	0 %	0 %	113954859
5042	NC_008319	GGT	2	6	250782	250787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008319	GAA	2	6	250813	250818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954739
5044	NC_008319	GCC	2	6	250837	250842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954739
5045	NC_008319	T	7	7	250856	250862	0 %	100 %	0 %	0 %	113954739
5046	NC_008319	CTG	2	6	250961	250966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954739
5047	NC_008319	TGCG	2	8	251093	251100	0 %	25 %	50 %	25 %	113954739
5048	NC_008319	TGCT	2	8	251130	251137	0 %	50 %	25 %	25 %	113954739
5049	NC_008319	CTC	2	6	251167	251172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954739
5050	NC_008319	CGG	2	6	251190	251195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954739
5051	NC_008319	GCT	2	6	251204	251209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954739
5052	NC_008319	TCG	2	6	251219	251224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954739
5053	NC_008319	CTC	2	6	251232	251237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_008319	GGT	2	6	251284	251289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955198
5055	NC_008319	TGC	2	6	251337	251342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955198
5056	NC_008319	CTG	2	6	251369	251374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955198
5057	NC_008319	GCA	3	9	251378	251386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955198
5058	NC_008319	CAA	2	6	251410	251415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955198
5059	NC_008319	CTC	2	6	251424	251429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955198
5060	NC_008319	ATTCA	2	10	251495	251504	40 %	40 %	0 %	20 %	113955198
5061	NC_008319	TTA	2	6	251628	251633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955198
5062	NC_008319	TGAT	2	8	251690	251697	25 %	50 %	25 %	0 %	113955198
5063	NC_008319	GACC	2	8	251698	251705	25 %	0 %	25 %	50 %	113954408
5064	NC_008319	TGG	2	6	251785	251790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954408
5065	NC_008319	CGC	2	6	251791	251796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954408
5066	NC_008319	ACGA	2	8	251816	251823	50 %	0 %	25 %	25 %	113954408
5067	NC_008319	TGAG	2	8	251826	251833	25 %	25 %	50 %	0 %	113954408
5068	NC_008319	AGC	2	6	251882	251887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954408
5069	NC_008319	TGT	2	6	251898	251903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954408
5070	NC_008319	CTC	2	6	251939	251944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954408
5071	NC_008319	CCGAA	2	10	252078	252087	40 %	0 %	20 %	40 %	113954408
5072	NC_008319	GTG	2	6	252159	252164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954408
5073	NC_008319	CCG	2	6	252206	252211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954408
5074	NC_008319	GTGA	2	8	252272	252279	25 %	25 %	50 %	0 %	113954408
5075	NC_008319	GC	3	6	252367	252372	0 %	0 %	50 %	50 %	113954408
5076	NC_008319	CT	3	6	252390	252395	0 %	50 %	0 %	50 %	113954408
5077	NC_008319	CTG	2	6	252441	252446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954408
5078	NC_008319	CGT	2	6	252465	252470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954408
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5080	NC_008319	GTC	2	6	252498	252503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953526
5081	NC_008319	GCG	2	6	252520	252525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953526
5082	NC_008319	ACT	2	6	252677	252682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953526
5083	NC_008319	GTG	2	6	252860	252865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953526
5084	NC_008319	CATCCC	2	12	252919	252930	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	113953526
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5087	NC_008319	GCT	2	6	253172	253177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952872
5088	NC_008319	AGA	2	6	253221	253226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952872
5089	NC_008319	GA	3	6	253286	253291	50 %	0 %	50 %	0 %	113952872
5090	NC_008319	ATCCA	2	10	253331	253340	40 %	20 %	0 %	40 %	113952872
5091	NC_008319	TCA	2	6	253360	253365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952872
5092	NC_008319	GC	3	6	253387	253392	0 %	0 %	50 %	50 %	113952872
5093	NC_008319	GAG	2	6	253439	253444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952872
5094	NC_008319	AAATC	2	10	253474	253483	60 %	20 %	0 %	20 %	113952872
5095	NC_008319	GGCA	2	8	253533	253540	25 %	0 %	50 %	25 %	113952872
5096	NC_008319	GACG	2	8	253624	253631	25 %	0 %	50 %	25 %	113952872
5097	NC_008319	TGG	2	6	253639	253644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952872
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5099	NC_008319	TTC	2	6	253814	253819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952872
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5101	NC_008319	AC	3	6	253864	253869	50 %	0 %	0 %	50 %	113952872
5102	NC_008319	GCA	2	6	253882	253887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952872
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5104	NC_008319	GCC	2	6	253898	253903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952872
5105	NC_008319	GCT	2	6	253937	253942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952872
5106	NC_008319	CCA	3	9	253983	253991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952872
5107	NC_008319	ACGCA	2	10	254033	254042	40 %	0 %	20 %	40 %	113952872
5108	NC_008319	TTG	2	6	254078	254083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952872
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5110	NC_008319	CAG	2	6	254132	254137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952872
5111	NC_008319	ATCC	2	8	254181	254188	25 %	25 %	0 %	50 %	113952872
5112	NC_008319	GCA	2	6	254347	254352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_008319	GCT	2	6	254417	254422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_008319	TGA	2	6	254488	254493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008319	CAGG	2	8	254513	254520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_008319	CG	3	6	254556	254561	0 %	0 %	50 %	50 %	113953288
5117	NC_008319	GTT	2	6	254581	254586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953288
5118	NC_008319	GA	3	6	254592	254597	50 %	0 %	50 %	0 %	113953288
5119	NC_008319	TGA	2	6	254648	254653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953288
5120	NC_008319	GTG	2	6	254674	254679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953288
5121	NC_008319	TTG	2	6	254716	254721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953288
5122	NC_008319	GTT	2	6	254757	254762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953288
5123	NC_008319	GCCC	2	8	254801	254808	0 %	0 %	25 %	75 %	113953288
5124	NC_008319	GTCTT	2	10	254816	254825	0 %	60 %	20 %	20 %	113953288
5125	NC_008319	CTG	2	6	254839	254844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953288
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5145	NC_008319	TTGG	2	8	255868	255875	0 %	50 %	50 %	0 %	113955051
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5231	NC_008319	TGA	2	6	259521	259526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953132
5232	NC_008319	GTTTT	2	10	259538	259547	0 %	80 %	20 %	0 %	113954039
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5240	NC_008319	GCT	2	6	259783	259788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
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5242	NC_008319	CGG	2	6	259818	259823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954039
5243	NC_008319	GCT	3	9	259927	259935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
5244	NC_008319	CGG	2	6	259957	259962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954039
5245	NC_008319	GATC	2	8	260059	260066	25 %	25 %	25 %	25 %	113954039
5246	NC_008319	GTC	2	6	260196	260201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
5247	NC_008319	GCT	2	6	260216	260221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
5248	NC_008319	GCC	2	6	260231	260236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954039
5249	NC_008319	TGC	2	6	260356	260361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
5250	NC_008319	TGA	2	6	260389	260394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954039
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5252	NC_008319	CTG	2	6	260431	260436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954039
5253	NC_008319	CAG	2	6	260450	260455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954039
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5281	NC_008319	GC	3	6	261717	261722	0 %	0 %	50 %	50 %	113953247
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5288	NC_008319	TCCGA	2	10	262142	262151	20 %	20 %	20 %	40 %	113953247
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5292	NC_008319	TGG	2	6	262835	262840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_008319	AAG	2	6	262878	262883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5294	NC_008319	TGG	2	6	262913	262918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955011
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5300	NC_008319	GC	3	6	263257	263262	0 %	0 %	50 %	50 %	113955011
5301	NC_008319	ACC	2	6	263277	263282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955011
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5317	NC_008319	CCAT	2	8	264255	264262	25 %	25 %	0 %	50 %	113954353
5318	NC_008319	TCCC	2	8	264281	264288	0 %	25 %	0 %	75 %	113954353
5319	NC_008319	GGC	2	6	264323	264328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954353
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5323	NC_008319	GGT	2	6	264553	264558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954353
5324	NC_008319	CATC	2	8	264583	264590	25 %	25 %	0 %	50 %	113954353
5325	NC_008319	CAG	2	6	264607	264612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954353
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5328	NC_008319	GA	3	6	264840	264845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5329	NC_008319	CTT	2	6	264883	264888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955167
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5334	NC_008319	TGA	2	6	265005	265010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955167
5335	NC_008319	GTT	2	6	265065	265070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955167
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5351	NC_008319	TGGTG	2	10	266011	266020	0 %	40 %	60 %	0 %	113955582
5352	NC_008319	GCT	2	6	266126	266131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5353	NC_008319	AGC	2	6	266149	266154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955582
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5355	NC_008319	GCA	2	6	266213	266218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5356	NC_008319	TCA	2	6	266277	266282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955582
5357	NC_008319	CTT	2	6	266285	266290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5358	NC_008319	GCT	2	6	266366	266371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955582
5359	NC_008319	TTG	2	6	266437	266442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955582
5360	NC_008319	TCT	2	6	266495	266500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5361	NC_008319	TCC	2	6	266508	266513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955582
5362	NC_008319	CTT	2	6	266527	266532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955582
5363	NC_008319	GAT	2	6	266570	266575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_008319	AGTC	2	8	266578	266585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5365	NC_008319	GCG	2	6	266598	266603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5488	NC_008319	TCT	2	6	273254	273259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954465
5489	NC_008319	TGT	2	6	273315	273320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5490	NC_008319	CCT	2	6	273349	273354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5491	NC_008319	TTG	2	6	273462	273467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_008319	TGA	2	6	273492	273497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_008319	ATA	2	6	273513	273518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_008319	T	7	7	273558	273564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_008319	AGT	2	6	273585	273590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_008319	TC	3	6	273601	273606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5497	NC_008319	ACT	2	6	273609	273614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_008319	ATCTGG	2	12	273650	273661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113954918
5499	NC_008319	AGCTTG	2	12	273673	273684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113954918
5500	NC_008319	AGA	3	9	273734	273742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954918

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