MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008319	GAA	2	6	223117	223122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955469
4502	NC_008319	TTG	2	6	223231	223236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955469
4503	NC_008319	TCA	2	6	223242	223247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955469
4504	NC_008319	TC	3	6	223269	223274	0 %	50 %	0 %	50 %	113955469
4505	NC_008319	GAA	2	6	223290	223295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955469
4506	NC_008319	AAC	2	6	223315	223320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955469
4507	NC_008319	ACC	2	6	223384	223389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955469
4508	NC_008319	GGA	2	6	223446	223451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955469
4509	NC_008319	TTG	2	6	223508	223513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955469
4510	NC_008319	TGG	2	6	223680	223685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953674
4511	NC_008319	ATC	2	6	223769	223774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953674
4512	NC_008319	GAT	2	6	223783	223788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953674
4513	NC_008319	CT	3	6	224000	224005	0 %	50 %	0 %	50 %	113953674
4514	NC_008319	CGC	2	6	224068	224073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953674
4515	NC_008319	GGTTG	2	10	224176	224185	0 %	40 %	60 %	0 %	113953674
4516	NC_008319	CG	3	6	224209	224214	0 %	0 %	50 %	50 %	113953674
4517	NC_008319	GTT	2	6	224311	224316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953674
4518	NC_008319	CAG	2	6	224319	224324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953674
4519	NC_008319	CTG	2	6	224347	224352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953674
4520	NC_008319	AGG	2	6	224358	224363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953674
4521	NC_008319	TCA	2	6	224370	224375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953674
4522	NC_008319	GCA	2	6	224419	224424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953674
4523	NC_008319	GTT	2	6	224528	224533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953674
4524	NC_008319	TGG	2	6	224561	224566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953674
4525	NC_008319	GCT	2	6	224797	224802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954191
4526	NC_008319	GTTG	2	8	224833	224840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_008319	T	7	7	224880	224886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_008319	TTG	2	6	224907	224912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955002
4529	NC_008319	GGT	2	6	224969	224974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955002
4530	NC_008319	ATT	2	6	224996	225001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955002
4531	NC_008319	CTG	2	6	225033	225038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955002
4532	NC_008319	T	6	6	225140	225145	0 %	100 %	0 %	0 %	113955002
4533	NC_008319	TTG	2	6	225213	225218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955002
4534	NC_008319	CTC	2	6	225219	225224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955002
4535	NC_008319	TCA	2	6	225225	225230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955002
4536	NC_008319	TGA	2	6	225303	225308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955002
4537	NC_008319	A	7	7	225401	225407	100 %	0 %	0 %	0 %	113955002
4538	NC_008319	GAGG	2	8	225442	225449	25 %	0 %	75 %	0 %	113955002
4539	NC_008319	T	8	8	225472	225479	0 %	100 %	0 %	0 %	113955002
4540	NC_008319	GATT	2	8	225555	225562	25 %	50 %	25 %	0 %	113955002
4541	NC_008319	CTG	2	6	225570	225575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955002
4542	NC_008319	CTATT	2	10	225582	225591	20 %	60 %	0 %	20 %	113955002
4543	NC_008319	GTG	2	6	225735	225740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955002
4544	NC_008319	GAAG	2	8	225754	225761	50 %	0 %	50 %	0 %	113955002
4545	NC_008319	TCCGTC	2	12	225817	225828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113955002
4546	NC_008319	AGA	2	6	225842	225847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955002
4547	NC_008319	TTCA	2	8	225848	225855	25 %	50 %	0 %	25 %	113955002
4548	NC_008319	TGAGC	2	10	225880	225889	20 %	20 %	40 %	20 %	113955002
4549	NC_008319	AAC	2	6	225973	225978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955002
4550	NC_008319	AG	3	6	226148	226153	50 %	0 %	50 %	0 %	113955002
4551	NC_008319	GAT	3	9	226166	226174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955002
4552	NC_008319	TGA	2	6	226207	226212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955002
4553	NC_008319	TGGT	2	8	226248	226255	0 %	50 %	50 %	0 %	113955002
4554	NC_008319	GAT	2	6	226256	226261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955002
4555	NC_008319	TGG	2	6	226276	226281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955002
4556	NC_008319	TTGGCA	2	12	226295	226306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113955002
4557	NC_008319	ATA	2	6	226365	226370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955002
4558	NC_008319	ATG	2	6	226380	226385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955002
4559	NC_008319	TAC	2	6	226420	226425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955002
4560	NC_008319	A	6	6	226457	226462	100 %	0 %	0 %	0 %	113955002
4561	NC_008319	ATT	2	6	226496	226501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955002
4562	NC_008319	ATGA	2	8	226619	226626	50 %	25 %	25 %	0 %	113952977
4563	NC_008319	TGT	2	6	226627	226632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952977
4564	NC_008319	CTG	2	6	226644	226649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4565	NC_008319	CCATC	2	10	226657	226666	20 %	20 %	0 %	60 %	113952977
4566	NC_008319	AGC	2	6	226677	226682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4567	NC_008319	TTC	2	6	226765	226770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952977
4568	NC_008319	GCG	2	6	226789	226794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952977
4569	NC_008319	GTC	2	6	226887	226892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4570	NC_008319	TCG	2	6	226987	226992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4571	NC_008319	TTCG	2	8	227013	227020	0 %	50 %	25 %	25 %	113952977
4572	NC_008319	GGA	2	6	227086	227091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952977
4573	NC_008319	GTT	2	6	227117	227122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952977
4574	NC_008319	TAC	2	6	227125	227130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952977
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4576	NC_008319	GTC	2	6	227448	227453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
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4579	NC_008319	TGT	2	6	227578	227583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952977
4580	NC_008319	GCA	2	6	227701	227706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4581	NC_008319	CTG	3	9	227783	227791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
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4585	NC_008319	TTG	2	6	228086	228091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952977
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4587	NC_008319	ACG	2	6	228257	228262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952977
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4589	NC_008319	CTG	2	6	228368	228373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4590	NC_008319	CTGG	2	8	228388	228395	0 %	25 %	50 %	25 %	113952977
4591	NC_008319	GCA	2	6	228426	228431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952977
4592	NC_008319	GATC	2	8	228454	228461	25 %	25 %	25 %	25 %	113952977
4593	NC_008319	GAC	2	6	228481	228486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952977
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4600	NC_008319	AGG	2	6	228625	228630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952977
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4604	NC_008319	TGT	2	6	228744	228749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952977
4605	NC_008319	AAT	2	6	228758	228763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952977
4606	NC_008319	CAAAC	2	10	228818	228827	60 %	0 %	0 %	40 %	113952977
4607	NC_008319	TGA	2	6	228833	228838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952977
4608	NC_008319	TGG	2	6	228883	228888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954010
4609	NC_008319	TGGT	2	8	228916	228923	0 %	50 %	50 %	0 %	113954010
4610	NC_008319	GT	3	6	228922	228927	0 %	50 %	50 %	0 %	113954010
4611	NC_008319	AAC	2	6	228932	228937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954010
4612	NC_008319	TGGT	2	8	229048	229055	0 %	50 %	50 %	0 %	113954010
4613	NC_008319	TCT	2	6	229087	229092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954010
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4619	NC_008319	C	6	6	229210	229215	0 %	0 %	0 %	100 %	113954010
4620	NC_008319	TGC	2	6	229245	229250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954010
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4867	NC_008319	CTA	2	6	242317	242322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955094
4868	NC_008319	GCATG	2	10	242326	242335	20 %	20 %	40 %	20 %	113955094
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4887	NC_008319	GCC	2	6	243347	243352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954542
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