MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008258	CCG	2	6	168482	168487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804212
3502	NC_008258	ATA	2	6	168488	168493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804212
3503	NC_008258	CGC	2	6	168564	168569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804212
3504	NC_008258	TGGC	2	8	168709	168716	0 %	25 %	50 %	25 %	110804212
3505	NC_008258	TGT	2	6	169023	169028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804213
3506	NC_008258	ATA	2	6	169038	169043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804213
3507	NC_008258	GGTCC	2	10	169135	169144	0 %	20 %	40 %	40 %	110804213
3508	NC_008258	T	6	6	169325	169330	0 %	100 %	0 %	0 %	110804213
3509	NC_008258	CAG	2	6	169373	169378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804213
3510	NC_008258	GGA	2	6	169629	169634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804213
3511	NC_008258	GCT	2	6	169646	169651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804213
3512	NC_008258	CGG	2	6	169672	169677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804213
3513	NC_008258	TGA	2	6	169711	169716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804213
3514	NC_008258	CG	3	6	169717	169722	0 %	0 %	50 %	50 %	110804213
3515	NC_008258	GCG	2	6	169725	169730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804213
3516	NC_008258	ACA	2	6	169912	169917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804214
3517	NC_008258	TGA	2	6	170027	170032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804214
3518	NC_008258	CGC	2	6	170039	170044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804214
3519	NC_008258	CGT	2	6	170186	170191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804214
3520	NC_008258	TAA	2	6	170267	170272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804214
3521	NC_008258	CAG	2	6	170298	170303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804214
3522	NC_008258	CCG	2	6	170395	170400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804214
3523	NC_008258	GCA	2	6	170435	170440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804214
3524	NC_008258	CTT	3	9	170447	170455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804214
3525	NC_008258	ATG	2	6	170467	170472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804214
3526	NC_008258	GATT	2	8	170575	170582	25 %	50 %	25 %	0 %	110804215
3527	NC_008258	A	8	8	170587	170594	100 %	0 %	0 %	0 %	110804215
3528	NC_008258	TCG	2	6	170605	170610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3529	NC_008258	ATC	2	6	170681	170686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804215
3530	NC_008258	TCG	2	6	170701	170706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3531	NC_008258	CAA	2	6	170711	170716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804215
3532	NC_008258	GCC	2	6	170747	170752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804215
3533	NC_008258	CAG	2	6	170786	170791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3534	NC_008258	TTG	2	6	170892	170897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804215
3535	NC_008258	CCG	2	6	170930	170935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804215
3536	NC_008258	AGC	2	6	170953	170958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3537	NC_008258	AGCC	2	8	171005	171012	25 %	0 %	25 %	50 %	110804215
3538	NC_008258	CTGA	2	8	171014	171021	25 %	25 %	25 %	25 %	110804215
3539	NC_008258	GGC	2	6	171037	171042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804215
3540	NC_008258	ACGGG	2	10	171052	171061	20 %	0 %	60 %	20 %	110804215
3541	NC_008258	GAA	2	6	171062	171067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804215
3542	NC_008258	GCG	2	6	171082	171087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804215
3543	NC_008258	GTG	2	6	171214	171219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804215
3544	NC_008258	TTA	2	6	171268	171273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804215
3545	NC_008258	GAA	2	6	171281	171286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804215
3546	NC_008258	CGA	2	6	171367	171372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3547	NC_008258	TG	3	6	171383	171388	0 %	50 %	50 %	0 %	110804215
3548	NC_008258	AGC	2	6	171432	171437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3549	NC_008258	ATC	2	6	171441	171446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804215
3550	NC_008258	TGG	2	6	171495	171500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804215
3551	NC_008258	T	6	6	171560	171565	0 %	100 %	0 %	0 %	110804215
3552	NC_008258	TAAA	2	8	171588	171595	75 %	25 %	0 %	0 %	110804215
3553	NC_008258	CTGC	2	8	171632	171639	0 %	25 %	25 %	50 %	110804215
3554	NC_008258	ATT	2	6	171667	171672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804215
3555	NC_008258	TCT	2	6	171697	171702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804215
3556	NC_008258	TA	3	6	171708	171713	50 %	50 %	0 %	0 %	110804215
3557	NC_008258	AGC	2	6	171756	171761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3558	NC_008258	ATT	2	6	171793	171798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804215
3559	NC_008258	TTA	2	6	171815	171820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804215
3560	NC_008258	ATT	2	6	171987	171992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804215
3561	NC_008258	GCC	2	6	171999	172004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804215
3562	NC_008258	TGC	2	6	172005	172010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804215
3563	NC_008258	GACC	2	8	172030	172037	25 %	0 %	25 %	50 %	110804215
3564	NC_008258	GAA	2	6	172167	172172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008258	A	8	8	172217	172224	100 %	0 %	0 %	0 %	110804216
3566	NC_008258	CT	3	6	172277	172282	0 %	50 %	0 %	50 %	110804216
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3568	NC_008258	CTT	2	6	172299	172304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804216
3569	NC_008258	CAG	2	6	172319	172324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804216
3570	NC_008258	CGC	2	6	172407	172412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804216
3571	NC_008258	CAG	2	6	172430	172435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804216
3572	NC_008258	TTC	2	6	172436	172441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804216
3573	NC_008258	TGA	2	6	172444	172449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804216
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3575	NC_008258	GGC	3	9	172520	172528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804216
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3581	NC_008258	GGT	2	6	172922	172927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804216
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3583	NC_008258	ATCGGT	2	12	172997	173008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110804216
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3585	NC_008258	TAT	2	6	173089	173094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804216
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3587	NC_008258	GTGAT	2	10	173211	173220	20 %	40 %	40 %	0 %	110804216
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3589	NC_008258	GCA	2	6	173292	173297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804216
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3593	NC_008258	AAC	2	6	173453	173458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804216
3594	NC_008258	GAA	2	6	173494	173499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804216
3595	NC_008258	GTGAT	2	10	173502	173511	20 %	40 %	40 %	0 %	110804216
3596	NC_008258	CAG	2	6	173525	173530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804216
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3598	NC_008258	TCA	2	6	173716	173721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008258	TACGT	2	10	173747	173756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_008258	GGA	2	6	173784	173789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008258	TGGC	3	12	173794	173805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_008258	CAT	2	6	173852	173857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_008258	GCG	2	6	173905	173910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008258	GTC	2	6	173970	173975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008258	ATG	2	6	174132	174137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008258	TTG	2	6	174162	174167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008258	GAA	2	6	174189	174194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_008258	TGA	2	6	174199	174204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008258	GATC	2	8	174262	174269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_008258	TCAA	2	8	174270	174277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_008258	GTG	2	6	174284	174289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_008258	TTG	2	6	174294	174299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_008258	ACA	2	6	174346	174351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_008258	TAA	2	6	174382	174387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_008258	TGG	2	6	174390	174395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_008258	TGG	2	6	174417	174422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008258	AGA	2	6	174463	174468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008258	AAC	2	6	174486	174491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_008258	ACG	2	6	174596	174601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008258	TGG	3	9	174603	174611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_008258	GCT	2	6	174636	174641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3623	NC_008258	GGC	2	6	174760	174765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008258	GTT	2	6	174808	174813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3742	NC_008258	AAGA	2	8	180867	180874	75 %	0 %	25 %	0 %	394894203
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3991	NC_008258	ATGCC	2	10	194459	194468	20 %	20 %	20 %	40 %	110804234
3992	NC_008258	TTG	2	6	194536	194541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804234
3993	NC_008258	GTG	2	6	194552	194557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804234
3994	NC_008258	GTG	2	6	194635	194640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804234
3995	NC_008258	CGC	2	6	194659	194664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804234
3996	NC_008258	TGGA	2	8	194720	194727	25 %	25 %	50 %	0 %	110804234
3997	NC_008258	ACT	2	6	194763	194768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804234
3998	NC_008258	TGG	3	9	194816	194824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804234
3999	NC_008258	CTG	2	6	194899	194904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804234
4000	NC_008258	AG	3	6	194911	194916	50 %	0 %	50 %	0 %	110804234

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