MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008258	GCGT	2	8	122200	122207	0 %	25 %	50 %	25 %	110804175
2502	NC_008258	GC	3	6	122398	122403	0 %	0 %	50 %	50 %	110804175
2503	NC_008258	AGAGC	2	10	122411	122420	40 %	0 %	40 %	20 %	110804175
2504	NC_008258	CT	3	6	122427	122432	0 %	50 %	0 %	50 %	110804175
2505	NC_008258	TCGT	2	8	122446	122453	0 %	50 %	25 %	25 %	110804175
2506	NC_008258	GAA	2	6	122471	122476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804175
2507	NC_008258	ATC	2	6	122505	122510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804175
2508	NC_008258	CGA	2	6	122513	122518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2509	NC_008258	CAG	2	6	122580	122585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2510	NC_008258	AGA	2	6	122624	122629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804175
2511	NC_008258	CTGG	2	8	122684	122691	0 %	25 %	50 %	25 %	110804175
2512	NC_008258	GCG	2	6	122694	122699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804175
2513	NC_008258	GAT	2	6	122726	122731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804175
2514	NC_008258	GGC	2	6	122789	122794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804175
2515	NC_008258	CGG	2	6	122825	122830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804175
2516	NC_008258	ACC	2	6	122844	122849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804175
2517	NC_008258	GCA	2	6	122867	122872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2518	NC_008258	GCTTAC	2	12	122934	122945	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110804175
2519	NC_008258	TAC	3	9	123009	123017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804175
2520	NC_008258	GCT	2	6	123134	123139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2521	NC_008258	CCT	2	6	123229	123234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804175
2522	NC_008258	TGC	2	6	123280	123285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2523	NC_008258	CG	3	6	123301	123306	0 %	0 %	50 %	50 %	110804175
2524	NC_008258	TGA	2	6	123325	123330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804175
2525	NC_008258	ACG	2	6	123331	123336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2526	NC_008258	GAC	2	6	123405	123410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2527	NC_008258	CAC	2	6	123468	123473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804175
2528	NC_008258	CTT	2	6	123487	123492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804175
2529	NC_008258	GCG	2	6	123504	123509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804175
2530	NC_008258	AAT	2	6	123625	123630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804176
2531	NC_008258	TGA	2	6	123664	123669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804176
2532	NC_008258	CCG	2	6	123855	123860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804176
2533	NC_008258	GCA	2	6	123866	123871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2534	NC_008258	AGA	2	6	123892	123897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2535	NC_008258	GAA	2	6	123898	123903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2536	NC_008258	AGC	2	6	123907	123912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2537	NC_008258	GCA	3	9	123917	123925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2538	NC_008258	GCG	2	6	123935	123940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2539	NC_008258	CGA	2	6	123973	123978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2540	NC_008258	CGG	2	6	124191	124196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2541	NC_008258	CAG	2	6	124233	124238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2542	NC_008258	AAG	2	6	124248	124253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2543	NC_008258	CGG	2	6	124270	124275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2544	NC_008258	CGT	2	6	124396	124401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2545	NC_008258	GCA	2	6	124526	124531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2546	NC_008258	ACG	2	6	124584	124589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2547	NC_008258	CCG	2	6	124615	124620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804176
2548	NC_008258	AAG	2	6	124713	124718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2549	NC_008258	AGC	2	6	124735	124740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2550	NC_008258	CGG	2	6	124743	124748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2551	NC_008258	GGT	2	6	124757	124762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804176
2552	NC_008258	TGC	2	6	124773	124778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2553	NC_008258	GAA	2	6	124817	124822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2554	NC_008258	TGA	2	6	124878	124883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804176
2555	NC_008258	CAG	2	6	124943	124948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2556	NC_008258	GAA	2	6	124952	124957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2557	NC_008258	GCG	2	6	124958	124963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2558	NC_008258	TCA	2	6	125001	125006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804176
2559	NC_008258	TGC	2	6	125017	125022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2560	NC_008258	GAA	2	6	125086	125091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804176
2561	NC_008258	GTT	2	6	125135	125140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804176
2562	NC_008258	CAA	2	6	125158	125163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804176
2563	NC_008258	CAT	2	6	125170	125175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804176
2564	NC_008258	TGA	2	6	125193	125198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804176
2565	NC_008258	CGG	2	6	125275	125280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804176
2566	NC_008258	TAC	2	6	125287	125292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804176
2567	NC_008258	TGC	2	6	125397	125402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804176
2568	NC_008258	TC	4	8	125408	125415	0 %	50 %	0 %	50 %	110804176
2569	NC_008258	ACC	2	6	125421	125426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804176
2570	NC_008258	CAT	2	6	125464	125469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804176
2571	NC_008258	AAC	2	6	125471	125476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804176
2572	NC_008258	GTAA	2	8	125506	125513	50 %	25 %	25 %	0 %	110804176
2573	NC_008258	CGGC	2	8	125528	125535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_008258	T	6	6	125536	125541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_008258	TTA	2	6	125568	125573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_008258	TGT	2	6	125599	125604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_008258	GGT	3	9	125653	125661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_008258	GCA	2	6	125699	125704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_008258	TAAG	2	8	125739	125746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008258	CGC	2	6	125773	125778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_008258	GAC	2	6	125791	125796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_008258	CCG	2	6	125805	125810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_008258	AT	3	6	125818	125823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_008258	ATG	2	6	125831	125836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804177
2585	NC_008258	ACA	2	6	125946	125951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804177
2586	NC_008258	CTG	2	6	125999	126004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2587	NC_008258	GAA	2	6	126023	126028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804177
2588	NC_008258	GCTG	2	8	126037	126044	0 %	25 %	50 %	25 %	110804177
2589	NC_008258	ATCA	2	8	126113	126120	50 %	25 %	0 %	25 %	110804177
2590	NC_008258	GGT	2	6	126128	126133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804177
2591	NC_008258	CTGG	2	8	126134	126141	0 %	25 %	50 %	25 %	110804177
2592	NC_008258	CAAAGT	2	12	126157	126168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110804177
2593	NC_008258	AAG	2	6	126348	126353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804177
2594	NC_008258	CTG	2	6	126365	126370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2595	NC_008258	ATC	2	6	126386	126391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804177
2596	NC_008258	CCG	2	6	126549	126554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804177
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2598	NC_008258	A	6	6	126596	126601	100 %	0 %	0 %	0 %	110804177
2599	NC_008258	ACG	2	6	126624	126629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2600	NC_008258	GAC	2	6	126701	126706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2601	NC_008258	TCG	2	6	126774	126779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2602	NC_008258	CA	3	6	126795	126800	50 %	0 %	0 %	50 %	110804177
2603	NC_008258	ACT	2	6	126852	126857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804177
2604	NC_008258	CTGA	2	8	126917	126924	25 %	25 %	25 %	25 %	110804177
2605	NC_008258	AAG	2	6	126927	126932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804177
2606	NC_008258	GCT	2	6	126977	126982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2607	NC_008258	GGT	2	6	127061	127066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804177
2608	NC_008258	TTG	2	6	127071	127076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804177
2609	NC_008258	CGG	2	6	127084	127089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804177
2610	NC_008258	GCT	2	6	127093	127098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804177
2611	NC_008258	GGC	2	6	127195	127200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804177
2612	NC_008258	GAA	3	9	127246	127254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804177
2613	NC_008258	A	6	6	127288	127293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_008258	CGC	2	6	127305	127310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_008258	T	7	7	127311	127317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_008258	TCT	2	6	127341	127346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804178
2617	NC_008258	AG	3	6	127359	127364	50 %	0 %	50 %	0 %	110804178
2618	NC_008258	CTG	2	6	127376	127381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804178
2619	NC_008258	GGC	2	6	127436	127441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804178
2620	NC_008258	GTT	2	6	127472	127477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804178
2621	NC_008258	GGCG	2	8	127502	127509	0 %	0 %	75 %	25 %	110804178
2622	NC_008258	GCT	2	6	127538	127543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804178
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2624	NC_008258	GCT	2	6	127616	127621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804178
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2627	NC_008258	GCT	2	6	127712	127717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804178
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2650	NC_008258	GTT	2	6	128485	128490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804178
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2660	NC_008258	GCA	2	6	129115	129120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804178
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2662	NC_008258	T	6	6	129391	129396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_008258	CGT	2	6	129412	129417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2723	NC_008258	T	6	6	132196	132201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2724	NC_008258	GCGAT	2	10	132266	132275	20 %	20 %	40 %	20 %	110804180
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2726	NC_008258	GAAA	2	8	132404	132411	75 %	0 %	25 %	0 %	110804180
2727	NC_008258	CTTG	2	8	132419	132426	0 %	50 %	25 %	25 %	110804180
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2730	NC_008258	GGGCA	2	10	132481	132490	20 %	0 %	60 %	20 %	110804180
2731	NC_008258	TGGA	2	8	132504	132511	25 %	25 %	50 %	0 %	110804180
2732	NC_008258	ACT	2	6	132580	132585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804180
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2734	NC_008258	GCG	2	6	132610	132615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804180
2735	NC_008258	GGC	2	6	132638	132643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804180
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2737	NC_008258	TAAA	2	8	132669	132676	75 %	25 %	0 %	0 %	110804180
2738	NC_008258	TAA	2	6	132734	132739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804181
2739	NC_008258	TTTC	2	8	132750	132757	0 %	75 %	0 %	25 %	110804181
2740	NC_008258	CAGCG	2	10	132760	132769	20 %	0 %	40 %	40 %	110804181
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2858	NC_008258	GTA	2	6	138863	138868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804185
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2863	NC_008258	AATT	2	8	139030	139037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2988	NC_008258	CGG	2	6	145241	145246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804192
2989	NC_008258	ACT	2	6	145261	145266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804192
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2991	NC_008258	TGC	2	6	145377	145382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804192
2992	NC_008258	GA	3	6	145426	145431	50 %	0 %	50 %	0 %	110804192
2993	NC_008258	GGGA	2	8	145441	145448	25 %	0 %	75 %	0 %	110804192
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2998	NC_008258	TAA	2	6	145672	145677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_008258	TGT	2	6	145730	145735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804193
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