MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008258	GGT	2	6	97828	97833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804153
2003	NC_008258	CAT	2	6	97860	97865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804153
2004	NC_008258	GCTG	2	8	98041	98048	0 %	25 %	50 %	25 %	110804154
2005	NC_008258	GGC	2	6	98238	98243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804154
2006	NC_008258	GGT	2	6	98259	98264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804154
2007	NC_008258	TGGC	2	8	98337	98344	0 %	25 %	50 %	25 %	110804154
2008	NC_008258	GTG	2	6	98400	98405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804154
2009	NC_008258	GCA	2	6	98447	98452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804154
2010	NC_008258	GT	3	6	98482	98487	0 %	50 %	50 %	0 %	110804154
2011	NC_008258	GTGG	2	8	98493	98500	0 %	25 %	75 %	0 %	110804154
2012	NC_008258	TGC	2	6	98543	98548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804154
2013	NC_008258	CAA	2	6	98598	98603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804154
2014	NC_008258	GCA	2	6	98639	98644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804154
2015	NC_008258	TGA	2	6	98663	98668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804154
2016	NC_008258	GGC	3	9	98672	98680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804154
2017	NC_008258	GTC	2	6	98697	98702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804154
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2021	NC_008258	GGT	2	6	98890	98895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804154
2022	NC_008258	TTA	2	6	98907	98912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804154
2023	NC_008258	CGAG	2	8	98957	98964	25 %	0 %	50 %	25 %	110804154
2024	NC_008258	AAG	2	6	99032	99037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_008258	GAAT	2	8	99051	99058	50 %	25 %	25 %	0 %	110804155
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2035	NC_008258	CGG	2	6	99508	99513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804155
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2041	NC_008258	TGA	2	6	99745	99750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804155
2042	NC_008258	CGTG	2	8	99823	99830	0 %	25 %	50 %	25 %	110804155
2043	NC_008258	AGA	2	6	99832	99837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804155
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2047	NC_008258	TGCGGT	2	12	99949	99960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110804155
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2054	NC_008258	CG	3	6	100212	100217	0 %	0 %	50 %	50 %	110804155
2055	NC_008258	ATG	2	6	100224	100229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804155
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2062	NC_008258	AGT	2	6	100988	100993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804156
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2094	NC_008258	TAG	2	6	102337	102342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2108	NC_008258	GCGCA	2	10	103279	103288	20 %	0 %	40 %	40 %	110804158
2109	NC_008258	GC	3	6	103345	103350	0 %	0 %	50 %	50 %	110804158
2110	NC_008258	TAT	2	6	103392	103397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804158
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2113	NC_008258	GA	3	6	103583	103588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_008258	TCGGCG	2	12	103639	103650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804159
2115	NC_008258	GCG	4	12	103648	103659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804159
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2117	NC_008258	GGCGCT	2	12	103797	103808	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804159
2118	NC_008258	TGA	2	6	103835	103840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804159
2119	NC_008258	TGCG	2	8	103855	103862	0 %	25 %	50 %	25 %	110804159
2120	NC_008258	TGC	2	6	103892	103897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2121	NC_008258	GTG	2	6	103906	103911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804159
2122	NC_008258	GCA	2	6	103926	103931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2123	NC_008258	GTC	2	6	103935	103940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2124	NC_008258	GTC	2	6	103980	103985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2125	NC_008258	AAG	2	6	104010	104015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804159
2126	NC_008258	CT	3	6	104066	104071	0 %	50 %	0 %	50 %	110804159
2127	NC_008258	CTG	2	6	104094	104099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2128	NC_008258	CTG	2	6	104124	104129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2129	NC_008258	TGA	2	6	104206	104211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804159
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2131	NC_008258	TGGCG	2	10	104273	104282	0 %	20 %	60 %	20 %	110804159
2132	NC_008258	GAA	2	6	104301	104306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804159
2133	NC_008258	GCT	2	6	104307	104312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2134	NC_008258	TCT	2	6	104325	104330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804159
2135	NC_008258	GCT	2	6	104333	104338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804159
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2137	NC_008258	CGG	2	6	104386	104391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804159
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2139	NC_008258	ATGA	2	8	104496	104503	50 %	25 %	25 %	0 %	110804159
2140	NC_008258	GTT	2	6	104520	104525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804159
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2142	NC_008258	CAG	2	6	104610	104615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804159
2143	NC_008258	AGT	2	6	104660	104665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804159
2144	NC_008258	CGTA	2	8	104723	104730	25 %	25 %	25 %	25 %	110804159
2145	NC_008258	CCG	2	6	104791	104796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2146	NC_008258	ATA	2	6	104837	104842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_008258	GAT	2	6	104844	104849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804160
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2149	NC_008258	TCG	2	6	104961	104966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804160
2150	NC_008258	ATG	2	6	105053	105058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804160
2151	NC_008258	TGC	2	6	105087	105092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804160
2152	NC_008258	CTG	2	6	105184	105189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804160
2153	NC_008258	CGA	2	6	105204	105209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804160
2154	NC_008258	A	6	6	105223	105228	100 %	0 %	0 %	0 %	110804160
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2162	NC_008258	T	9	9	105833	105841	0 %	100 %	0 %	0 %	110804161
2163	NC_008258	A	6	6	105860	105865	100 %	0 %	0 %	0 %	110804161
2164	NC_008258	TTA	2	6	106053	106058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804161
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2172	NC_008258	TAT	2	6	106563	106568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804162
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2178	NC_008258	CTGC	2	8	106906	106913	0 %	25 %	25 %	50 %	110804162
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2189	NC_008258	CTG	2	6	107419	107424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804162
2190	NC_008258	CAT	2	6	107436	107441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804162
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2195	NC_008258	ATC	2	6	107566	107571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804162
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2200	NC_008258	CGT	2	6	107793	107798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804162
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2213	NC_008258	ATG	2	6	108382	108387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804162
2214	NC_008258	CTG	2	6	108499	108504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804162
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2222	NC_008258	GAT	2	6	108837	108842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804162
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2230	NC_008258	A	6	6	109237	109242	100 %	0 %	0 %	0 %	110804162
2231	NC_008258	T	6	6	109312	109317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_008258	GGTA	2	8	109352	109359	25 %	25 %	50 %	0 %	110804163
2233	NC_008258	GCA	2	6	109401	109406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804163
2234	NC_008258	CGG	2	6	109439	109444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804163
2235	NC_008258	GGT	2	6	109478	109483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804163
2236	NC_008258	CTGG	2	8	109583	109590	0 %	25 %	50 %	25 %	110804163
2237	NC_008258	AAG	2	6	109621	109626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804163
2238	NC_008258	GGTC	2	8	109652	109659	0 %	25 %	50 %	25 %	110804163
2239	NC_008258	GAT	2	6	109668	109673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804163
2240	NC_008258	GCCA	2	8	109679	109686	25 %	0 %	25 %	50 %	110804163
2241	NC_008258	CGC	2	6	109739	109744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2242	NC_008258	CTG	2	6	109870	109875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804164
2243	NC_008258	CAG	2	6	109892	109897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804164
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2245	NC_008258	GCA	2	6	110168	110173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804165
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2369	NC_008258	CAG	2	6	116532	116537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804170
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2373	NC_008258	TGT	2	6	116668	116673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804171
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2442	NC_008258	A	6	6	119818	119823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2443	NC_008258	TA	3	6	119876	119881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2475	NC_008258	TTA	2	6	120926	120931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2476	NC_008258	GATA	2	8	120932	120939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2477	NC_008258	GAA	2	6	121029	121034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804175
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2490	NC_008258	AGC	2	6	121432	121437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2491	NC_008258	CT	3	6	121473	121478	0 %	50 %	0 %	50 %	110804175
2492	NC_008258	ATC	2	6	121773	121778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804175
2493	NC_008258	GCTG	2	8	121806	121813	0 %	25 %	50 %	25 %	110804175
2494	NC_008258	CTG	2	6	121854	121859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2495	NC_008258	TGA	2	6	121891	121896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804175
2496	NC_008258	CTT	2	6	121961	121966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804175
2497	NC_008258	GCA	2	6	121986	121991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804175
2498	NC_008258	GACTG	2	10	122001	122010	20 %	20 %	40 %	20 %	110804175
2499	NC_008258	GTG	2	6	122035	122040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804175
2500	NC_008258	GAA	2	6	122051	122056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804175

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