MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008258	GGCG	2	8	47496	47503	0 %	0 %	75 %	25 %	110804113
1002	NC_008258	CTG	2	6	47506	47511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804113
1003	NC_008258	TGC	2	6	47651	47656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804113
1004	NC_008258	TCA	3	9	47666	47674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804113
1005	NC_008258	GTT	2	6	47745	47750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804113
1006	NC_008258	AGGGC	2	10	47751	47760	20 %	0 %	60 %	20 %	110804113
1007	NC_008258	GCG	2	6	47788	47793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804113
1008	NC_008258	GCA	2	6	47860	47865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804113
1009	NC_008258	CTG	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804113
1010	NC_008258	TCT	2	6	47905	47910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804113
1011	NC_008258	GGA	2	6	47913	47918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804113
1012	NC_008258	GAA	2	6	47944	47949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804113
1013	NC_008258	CG	3	6	47954	47959	0 %	0 %	50 %	50 %	110804113
1014	NC_008258	TGG	2	6	48029	48034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804113
1015	NC_008258	GGAT	2	8	48110	48117	25 %	25 %	50 %	0 %	110804113
1016	NC_008258	GCG	2	6	48136	48141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804113
1017	NC_008258	AACC	2	8	48180	48187	50 %	0 %	0 %	50 %	110804113
1018	NC_008258	ATT	2	6	48232	48237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804113
1019	NC_008258	GCCCGC	2	12	48238	48249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804113
1020	NC_008258	CAGG	2	8	48277	48284	25 %	0 %	50 %	25 %	110804113
1021	NC_008258	CCG	2	6	48396	48401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804113
1022	NC_008258	TGG	2	6	48416	48421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804113
1023	NC_008258	CG	3	6	48457	48462	0 %	0 %	50 %	50 %	110804113
1024	NC_008258	ATC	2	6	48499	48504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804113
1025	NC_008258	TGGC	2	8	48543	48550	0 %	25 %	50 %	25 %	110804113
1026	NC_008258	AGA	2	6	48558	48563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804113
1027	NC_008258	GAAAC	2	10	48598	48607	60 %	0 %	20 %	20 %	110804113
1028	NC_008258	TAA	2	6	48616	48621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804113
1029	NC_008258	TGTT	2	8	48653	48660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008258	GCG	2	6	48677	48682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008258	CAG	2	6	48709	48714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008258	CAT	2	6	48734	48739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008258	CGA	2	6	48752	48757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008258	T	7	7	48788	48794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008258	GCG	2	6	48824	48829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804114
1036	NC_008258	CCTG	2	8	48877	48884	0 %	25 %	25 %	50 %	110804114
1037	NC_008258	TAAA	2	8	48915	48922	75 %	25 %	0 %	0 %	110804114
1038	NC_008258	GCC	2	6	48936	48941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804114
1039	NC_008258	AATC	2	8	48951	48958	50 %	25 %	0 %	25 %	110804114
1040	NC_008258	GTC	2	6	48960	48965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804114
1041	NC_008258	CAG	2	6	48994	48999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804114
1042	NC_008258	GCG	2	6	49055	49060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804114
1043	NC_008258	GGC	2	6	49091	49096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804114
1044	NC_008258	ACG	2	6	49230	49235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804114
1045	NC_008258	GCG	2	6	49279	49284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804114
1046	NC_008258	CGC	3	9	49372	49380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804115
1047	NC_008258	GCAG	2	8	49440	49447	25 %	0 %	50 %	25 %	110804115
1048	NC_008258	ACCC	2	8	49455	49462	25 %	0 %	0 %	75 %	110804115
1049	NC_008258	CAG	3	9	49463	49471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1050	NC_008258	TTC	2	6	49549	49554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804115
1051	NC_008258	CTT	2	6	49602	49607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804115
1052	NC_008258	AAGA	2	8	49753	49760	75 %	0 %	25 %	0 %	110804115
1053	NC_008258	CG	4	8	49797	49804	0 %	0 %	50 %	50 %	110804115
1054	NC_008258	GCG	2	6	49833	49838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804115
1055	NC_008258	TCG	2	6	49874	49879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1056	NC_008258	GCA	2	6	49884	49889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1057	NC_008258	AGC	2	6	49913	49918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1058	NC_008258	TCG	2	6	49919	49924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1059	NC_008258	CAG	2	6	49939	49944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1060	NC_008258	CAG	2	6	49996	50001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1061	NC_008258	CG	4	8	50085	50092	0 %	0 %	50 %	50 %	110804115
1062	NC_008258	GCA	2	6	50148	50153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804115
1063	NC_008258	AAC	2	6	50172	50177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804115
1064	NC_008258	AATG	2	8	50217	50224	50 %	25 %	25 %	0 %	110804116
1065	NC_008258	GCCATT	2	12	50422	50433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110804116
1066	NC_008258	CAA	2	6	50455	50460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804116
1067	NC_008258	AACGT	2	10	50509	50518	40 %	20 %	20 %	20 %	110804116
1068	NC_008258	AC	3	6	50569	50574	50 %	0 %	0 %	50 %	110804116
1069	NC_008258	ATC	2	6	50588	50593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804116
1070	NC_008258	ACG	2	6	50751	50756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804117
1071	NC_008258	GGT	2	6	50772	50777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804117
1072	NC_008258	ACG	2	6	50842	50847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804117
1073	NC_008258	GTG	3	9	50864	50872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804117
1074	NC_008258	CGG	2	6	50883	50888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804117
1075	NC_008258	CAC	2	6	50982	50987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804117
1076	NC_008258	CTG	2	6	51147	51152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804117
1077	NC_008258	GCC	2	6	51199	51204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804117
1078	NC_008258	GCC	2	6	51268	51273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804117
1079	NC_008258	TGG	2	6	51397	51402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804117
1080	NC_008258	ATT	2	6	51408	51413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804117
1081	NC_008258	TAA	2	6	51457	51462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804118
1082	NC_008258	CGGCGT	2	12	51622	51633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804118
1083	NC_008258	GGCA	2	8	51665	51672	25 %	0 %	50 %	25 %	110804118
1084	NC_008258	TCG	2	6	51708	51713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804118
1085	NC_008258	AAT	2	6	51722	51727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804118
1086	NC_008258	CGT	2	6	51908	51913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804118
1087	NC_008258	TTC	2	6	51932	51937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804118
1088	NC_008258	CAT	2	6	51947	51952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804118
1089	NC_008258	CAC	2	6	51953	51958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804118
1090	NC_008258	T	6	6	51959	51964	0 %	100 %	0 %	0 %	110804118
1091	NC_008258	CGT	2	6	52018	52023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804118
1092	NC_008258	GCA	2	6	52059	52064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804118
1093	NC_008258	CCA	2	6	52108	52113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804118
1094	NC_008258	CGGT	2	8	52266	52273	0 %	25 %	50 %	25 %	110804118
1095	NC_008258	AAC	2	6	52295	52300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804118
1096	NC_008258	CGG	2	6	52357	52362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804118
1097	NC_008258	GTT	2	6	52437	52442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804119
1098	NC_008258	TGC	2	6	52456	52461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1099	NC_008258	TTC	2	6	52462	52467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804119
1100	NC_008258	TCA	2	6	52482	52487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804119
1101	NC_008258	CAG	2	6	52546	52551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1102	NC_008258	GCA	2	6	52721	52726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1103	NC_008258	CAG	2	6	52752	52757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1104	NC_008258	GTCA	2	8	52789	52796	25 %	25 %	25 %	25 %	110804119
1105	NC_008258	CAG	2	6	52813	52818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1106	NC_008258	CGC	2	6	52863	52868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804119
1107	NC_008258	CAA	2	6	52920	52925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804119
1108	NC_008258	TTC	2	6	52934	52939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804119
1109	NC_008258	CCCCA	2	10	52988	52997	20 %	0 %	0 %	80 %	110804119
1110	NC_008258	GCC	2	6	53002	53007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804119
1111	NC_008258	CTG	2	6	53017	53022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1112	NC_008258	GC	4	8	53087	53094	0 %	0 %	50 %	50 %	110804119
1113	NC_008258	CGT	2	6	53181	53186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1114	NC_008258	CTG	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1115	NC_008258	CGA	2	6	53243	53248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1116	NC_008258	GTT	2	6	53257	53262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804119
1117	NC_008258	ATC	2	6	53279	53284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804119
1118	NC_008258	TGT	2	6	53364	53369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804119
1119	NC_008258	GCT	2	6	53403	53408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1120	NC_008258	GAT	2	6	53449	53454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804119
1121	NC_008258	TGG	2	6	53483	53488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804119
1122	NC_008258	GCGTC	2	10	53493	53502	0 %	20 %	40 %	40 %	110804119
1123	NC_008258	GCT	2	6	53511	53516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1124	NC_008258	ACG	2	6	53579	53584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
1125	NC_008258	TTA	2	6	53588	53593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804119
1126	NC_008258	ACG	2	6	53594	53599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804119
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1131	NC_008258	GCA	2	6	53776	53781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804120
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