MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008258	GTGG	2	8	23905	23912	0 %	25 %	75 %	0 %	110804093
502	NC_008258	GGC	2	6	23955	23960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804093
503	NC_008258	ACG	2	6	24032	24037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804093
504	NC_008258	CTG	2	6	24041	24046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804093
505	NC_008258	CAG	2	6	24052	24057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804093
506	NC_008258	GCT	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804093
507	NC_008258	CGGTGA	2	12	24198	24209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110804093
508	NC_008258	TGA	2	6	24226	24231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804093
509	NC_008258	GCTG	2	8	24259	24266	0 %	25 %	50 %	25 %	110804094
510	NC_008258	TGG	2	6	24271	24276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804094
511	NC_008258	GCA	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804094
512	NC_008258	TCC	2	6	24316	24321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804094
513	NC_008258	GCG	2	6	24393	24398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804094
514	NC_008258	GCG	2	6	24418	24423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804094
515	NC_008258	TGA	2	6	24481	24486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804094
516	NC_008258	ATT	2	6	24537	24542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804094
517	NC_008258	GGC	2	6	24543	24548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804094
518	NC_008258	GC	3	6	24547	24552	0 %	0 %	50 %	50 %	110804094
519	NC_008258	A	6	6	24711	24716	100 %	0 %	0 %	0 %	110804094
520	NC_008258	AAT	2	6	24718	24723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804094
521	NC_008258	CGA	2	6	24865	24870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804095
522	NC_008258	CAC	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804095
523	NC_008258	CAA	2	6	24895	24900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804095
524	NC_008258	CTG	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804095
525	NC_008258	ACC	2	6	24989	24994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804095
526	NC_008258	GCG	2	6	25013	25018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804095
527	NC_008258	CCG	2	6	25057	25062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804095
528	NC_008258	ATGG	2	8	25118	25125	25 %	25 %	50 %	0 %	110804095
529	NC_008258	TTG	2	6	25321	25326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804096
530	NC_008258	AT	3	6	25356	25361	50 %	50 %	0 %	0 %	110804096
531	NC_008258	GTG	2	6	25374	25379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804096
532	NC_008258	GAA	2	6	25599	25604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804096
533	NC_008258	TG	3	6	25706	25711	0 %	50 %	50 %	0 %	110804096
534	NC_008258	TGG	2	6	25912	25917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804096
535	NC_008258	CTC	2	6	25931	25936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804096
536	NC_008258	TTGA	2	8	25989	25996	25 %	50 %	25 %	0 %	110804096
537	NC_008258	TGG	2	6	26092	26097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804096
538	NC_008258	GCA	2	6	26105	26110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804096
539	NC_008258	GTG	3	9	26116	26124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804096
540	NC_008258	GAA	2	6	26148	26153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804096
541	NC_008258	AGC	2	6	26217	26222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008258	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008258	GAA	2	6	26267	26272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008258	GCC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804097
545	NC_008258	TGA	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804097
546	NC_008258	CTG	2	6	26429	26434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804097
547	NC_008258	GCA	2	6	26504	26509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804097
548	NC_008258	TGGC	2	8	26532	26539	0 %	25 %	50 %	25 %	110804097
549	NC_008258	TTG	2	6	26547	26552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804097
550	NC_008258	TGG	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804097
551	NC_008258	TCG	2	6	26704	26709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804097
552	NC_008258	CTG	2	6	26730	26735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804097
553	NC_008258	CTGG	2	8	26992	26999	0 %	25 %	50 %	25 %	110804097
554	NC_008258	ACG	2	6	27071	27076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804097
555	NC_008258	GTGG	2	8	27157	27164	0 %	25 %	75 %	0 %	110804097
556	NC_008258	TCAT	2	8	27216	27223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_008258	TCCC	2	8	27246	27253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
558	NC_008258	TGGC	2	8	27287	27294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_008258	ATG	2	6	27361	27366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229774944
560	NC_008258	G	6	6	27396	27401	0 %	0 %	100 %	0 %	229774944
561	NC_008258	GCC	2	6	27409	27414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229774944
562	NC_008258	GGC	2	6	27425	27430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229774944
563	NC_008258	GCG	2	6	27459	27464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229774944
564	NC_008258	TCT	2	6	27480	27485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229774944
565	NC_008258	GCTG	2	8	27509	27516	0 %	25 %	50 %	25 %	229774944
566	NC_008258	GAT	2	6	27567	27572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229774944
567	NC_008258	GCA	2	6	27635	27640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229774944
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569	NC_008258	GCC	2	6	27732	27737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229774944
570	NC_008258	GCT	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229774944
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572	NC_008258	ATT	2	6	27819	27824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229774944
573	NC_008258	CAT	2	6	27831	27836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229774944
574	NC_008258	CGTG	2	8	27986	27993	0 %	25 %	50 %	25 %	229774944
575	NC_008258	AAT	2	6	28167	28172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229774944
576	NC_008258	TAT	2	6	28191	28196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008258	ATTTA	2	10	28213	28222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008258	TCT	2	6	28312	28317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008258	TGT	2	6	28323	28328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008258	TCT	2	6	28388	28393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008258	TGC	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_008258	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008258	CATG	2	8	28456	28463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008258	ATA	2	6	28473	28478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008258	A	6	6	28480	28485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008258	GCC	2	6	28528	28533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_008258	TCG	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008258	TCA	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008258	AGTG	2	8	28606	28613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008258	CGG	2	6	28707	28712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804099
591	NC_008258	TCCT	2	8	28768	28775	0 %	50 %	0 %	50 %	110804099
592	NC_008258	CTTA	2	8	28796	28803	25 %	50 %	0 %	25 %	110804099
593	NC_008258	GAA	2	6	28841	28846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804099
594	NC_008258	TCT	2	6	28847	28852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804099
595	NC_008258	CT	3	6	28925	28930	0 %	50 %	0 %	50 %	110804099
596	NC_008258	GCG	2	6	29051	29056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804099
597	NC_008258	CG	3	6	29075	29080	0 %	0 %	50 %	50 %	110804099
598	NC_008258	ACC	2	6	29120	29125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804099
599	NC_008258	CGG	2	6	29167	29172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804099
600	NC_008258	A	6	6	29186	29191	100 %	0 %	0 %	0 %	110804099
601	NC_008258	CGT	2	6	29212	29217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804099
602	NC_008258	TGG	2	6	29259	29264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804099
603	NC_008258	TCA	2	6	29446	29451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804099
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608	NC_008258	CATCG	2	10	29654	29663	20 %	20 %	20 %	40 %	110804099
609	NC_008258	AGCC	2	8	29698	29705	25 %	0 %	25 %	50 %	110804099
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612	NC_008258	ACT	2	6	29879	29884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
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614	NC_008258	CAT	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804100
615	NC_008258	GACC	2	8	29964	29971	25 %	0 %	25 %	50 %	110804100
616	NC_008258	AGT	2	6	30015	30020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804100
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624	NC_008258	CA	3	6	30245	30250	50 %	0 %	0 %	50 %	110804100
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628	NC_008258	GCG	3	9	30329	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804100
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630	NC_008258	TC	4	8	30390	30397	0 %	50 %	0 %	50 %	110804100
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