MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_008258	TAG	2	6	4568036	4568041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93002	NC_008258	AGA	2	6	4568216	4568221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808185
93003	NC_008258	TTG	2	6	4568272	4568277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808185
93004	NC_008258	GGT	2	6	4568340	4568345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808185
93005	NC_008258	AGA	2	6	4568369	4568374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808185
93006	NC_008258	GTA	2	6	4568460	4568465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808185
93007	NC_008258	A	6	6	4568469	4568474	100 %	0 %	0 %	0 %	110808185
93008	NC_008258	CGCT	2	8	4568536	4568543	0 %	25 %	25 %	50 %	110808185
93009	NC_008258	GGC	2	6	4568617	4568622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808185
93010	NC_008258	GCA	2	6	4568708	4568713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
93011	NC_008258	CAG	2	6	4568772	4568777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
93012	NC_008258	GCC	2	6	4568836	4568841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808186
93013	NC_008258	GAC	2	6	4568934	4568939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808186
93014	NC_008258	GAA	2	6	4569005	4569010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808186
93015	NC_008258	TGAAT	2	10	4569050	4569059	40 %	40 %	20 %	0 %	110808186
93016	NC_008258	GC	3	6	4569257	4569262	0 %	0 %	50 %	50 %	110808186
93017	NC_008258	TGC	2	6	4569348	4569353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808187
93018	NC_008258	T	6	6	4569361	4569366	0 %	100 %	0 %	0 %	110808187
93019	NC_008258	TGG	2	6	4569369	4569374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
93020	NC_008258	GGC	2	6	4569379	4569384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
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93022	NC_008258	CT	3	6	4569500	4569505	0 %	50 %	0 %	50 %	110808187
93023	NC_008258	ACA	2	6	4569550	4569555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808187
93024	NC_008258	TGG	2	6	4569577	4569582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
93025	NC_008258	ATT	2	6	4569675	4569680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808187
93026	NC_008258	GC	3	6	4569725	4569730	0 %	0 %	50 %	50 %	110808187
93027	NC_008258	ATGT	2	8	4569770	4569777	25 %	50 %	25 %	0 %	110808187
93028	NC_008258	GGC	2	6	4569794	4569799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
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93030	NC_008258	TTG	2	6	4569899	4569904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808187
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93032	NC_008258	GTA	2	6	4570023	4570028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808187
93033	NC_008258	GGC	2	6	4570141	4570146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
93034	NC_008258	GCG	2	6	4570157	4570162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
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93038	NC_008258	TGG	2	6	4570248	4570253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808187
93039	NC_008258	TAC	2	6	4570260	4570265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808187
93040	NC_008258	CTG	2	6	4570305	4570310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808187
93041	NC_008258	GGC	2	6	4570318	4570323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808187
93042	NC_008258	ATT	2	6	4570324	4570329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808187
93043	NC_008258	CGC	2	6	4570331	4570336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808187
93044	NC_008258	GC	3	6	4570346	4570351	0 %	0 %	50 %	50 %	110808187
93045	NC_008258	A	7	7	4570368	4570374	100 %	0 %	0 %	0 %	110808187
93046	NC_008258	TGC	2	6	4570411	4570416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808187
93047	NC_008258	A	6	6	4570623	4570628	100 %	0 %	0 %	0 %	110808187
93048	NC_008258	GTTT	2	8	4570668	4570675	0 %	75 %	25 %	0 %	110808187
93049	NC_008258	TTC	2	6	4570761	4570766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93050	NC_008258	CTG	2	6	4570785	4570790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93051	NC_008258	C	6	6	4570821	4570826	0 %	0 %	0 %	100 %	110808188
93052	NC_008258	ACC	2	6	4570841	4570846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808188
93053	NC_008258	TGT	2	6	4570866	4570871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808188
93054	NC_008258	GAA	2	6	4571111	4571116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808188
93055	NC_008258	ATC	2	6	4571216	4571221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808188
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93057	NC_008258	AACGG	2	10	4571294	4571303	40 %	0 %	40 %	20 %	110808188
93058	NC_008258	TGCC	2	8	4571445	4571452	0 %	25 %	25 %	50 %	110808188
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93086	NC_008258	CAT	2	6	4572851	4572856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808189
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93088	NC_008258	ATGC	2	8	4573001	4573008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93089	NC_008258	CAA	2	6	4573081	4573086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93090	NC_008258	CAT	2	6	4573087	4573092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93091	NC_008258	AT	3	6	4573221	4573226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93092	NC_008258	TGA	2	6	4573255	4573260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93099	NC_008258	ATTT	2	8	4573358	4573365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93100	NC_008258	T	6	6	4573363	4573368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93101	NC_008258	T	6	6	4573406	4573411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93102	NC_008258	T	6	6	4573452	4573457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93103	NC_008258	TAA	2	6	4573517	4573522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93104	NC_008258	AAG	2	6	4573559	4573564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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