MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
92501	NC_008258	CTG	2	6	4543164	4543169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808163
92502	NC_008258	TTC	2	6	4543224	4543229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808163
92503	NC_008258	AGC	2	6	4543244	4543249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808163
92504	NC_008258	C	7	7	4543273	4543279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92505	NC_008258	CAA	2	6	4543314	4543319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92506	NC_008258	GCGCG	2	10	4543320	4543329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92507	NC_008258	AAG	2	6	4543343	4543348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92508	NC_008258	ATT	2	6	4543408	4543413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110808164
92509	NC_008258	TGC	2	6	4543454	4543459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92510	NC_008258	CCG	2	6	4543481	4543486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808164
92511	NC_008258	TGGA	2	8	4543531	4543538	25 %	25 %	50 %	0 %	110808164
92512	NC_008258	AGC	2	6	4543547	4543552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92513	NC_008258	TAC	2	6	4543566	4543571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808164
92514	NC_008258	CGG	2	6	4543667	4543672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808164
92515	NC_008258	CTG	2	6	4543677	4543682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92516	NC_008258	CGC	2	6	4543698	4543703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808164
92517	NC_008258	ACC	2	6	4543904	4543909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808164
92518	NC_008258	TGC	2	6	4544004	4544009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92519	NC_008258	CAG	2	6	4544029	4544034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92520	NC_008258	GAACTG	2	12	4544044	4544055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110808164
92521	NC_008258	TTC	2	6	4544119	4544124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110808164
92522	NC_008258	TGG	2	6	4544171	4544176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808164
92523	NC_008258	AGCG	2	8	4544226	4544233	25 %	0 %	50 %	25 %	110808164
92524	NC_008258	ACCGCG	2	12	4544288	4544299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	110808164
92525	NC_008258	GTG	2	6	4544314	4544319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808164
92526	NC_008258	GAA	2	6	4544425	4544430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808164
92527	NC_008258	GAT	2	6	4544505	4544510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110808164
92528	NC_008258	CGT	2	6	4544551	4544556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92529	NC_008258	GCT	2	6	4544589	4544594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92530	NC_008258	CAA	2	6	4544652	4544657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808164
92531	NC_008258	TGC	2	6	4544684	4544689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808164
92532	NC_008258	TGG	2	6	4544699	4544704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808164
92533	NC_008258	GC	3	6	4544707	4544712	0 %	0 %	50 %	50 %	110808164
92534	NC_008258	AGTC	2	8	4544747	4544754	25 %	25 %	25 %	25 %	110808164
92535	NC_008258	GAA	2	6	4544793	4544798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808164
92536	NC_008258	GGC	2	6	4544845	4544850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808164
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92538	NC_008258	TTA	2	6	4544997	4545002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92539	NC_008258	TGA	2	6	4545097	4545102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92540	NC_008258	TAA	2	6	4545180	4545185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92541	NC_008258	TCA	2	6	4545214	4545219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92542	NC_008258	TC	3	6	4545267	4545272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92543	NC_008258	CTG	2	6	4545372	4545377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808165
92544	NC_008258	AAC	2	6	4545426	4545431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110808165
92545	NC_008258	GGC	2	6	4545530	4545535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808165
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92549	NC_008258	AAG	2	6	4545712	4545717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110808165
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92551	NC_008258	CTG	2	6	4545774	4545779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110808165
92552	NC_008258	ACC	2	6	4545819	4545824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110808165
92553	NC_008258	TCG	2	6	4545946	4545951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92554	NC_008258	TCC	2	6	4545959	4545964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92555	NC_008258	CAC	2	6	4545991	4545996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92556	NC_008258	CAT	2	6	4546085	4546090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92557	NC_008258	CGC	3	9	4546112	4546120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92558	NC_008258	TGG	2	6	4546130	4546135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92559	NC_008258	GTC	2	6	4546176	4546181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92560	NC_008258	ATT	2	6	4546185	4546190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92561	NC_008258	AAT	2	6	4546299	4546304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92562	NC_008258	TCTT	2	8	4546321	4546328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92563	NC_008258	CAA	2	6	4546332	4546337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92564	NC_008258	GGC	2	6	4546444	4546449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110808166
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92566	NC_008258	CG	3	6	4546584	4546589	0 %	0 %	50 %	50 %	110808166
92567	NC_008258	TCA	2	6	4546595	4546600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110808166
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92572	NC_008258	GTT	2	6	4546731	4546736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110808166
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92575	NC_008258	CTGG	2	8	4546818	4546825	0 %	25 %	50 %	25 %	110808166
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92584	NC_008258	GTG	2	6	4547305	4547310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110808166
92585	NC_008258	CG	3	6	4547502	4547507	0 %	0 %	50 %	50 %	110808167
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92590	NC_008258	GCA	2	6	4547756	4547761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110808167
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92599	NC_008258	CGC	2	6	4548594	4548599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110808168
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92602	NC_008258	CCTGG	2	10	4548629	4548638	0 %	20 %	40 %	40 %	110808168
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