MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008258	GCT	2	6	349632	349637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804389
7002	NC_008258	A	6	6	349732	349737	100 %	0 %	0 %	0 %	110804389
7003	NC_008258	CG	3	6	349813	349818	0 %	0 %	50 %	50 %	110804389
7004	NC_008258	GGC	2	6	349821	349826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804389
7005	NC_008258	TTA	2	6	349840	349845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804389
7006	NC_008258	CGA	2	6	349848	349853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804389
7007	NC_008258	CTG	3	9	349900	349908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804389
7008	NC_008258	AGA	2	6	349959	349964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804389
7009	NC_008258	GCGGCT	2	12	350025	350036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110804389
7010	NC_008258	CGC	2	6	350047	350052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804389
7011	NC_008258	TTG	2	6	350054	350059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804389
7012	NC_008258	GCA	2	6	350075	350080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804389
7013	NC_008258	CGG	2	6	350190	350195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804390
7014	NC_008258	TGG	2	6	350268	350273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804390
7015	NC_008258	GGC	2	6	350279	350284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804390
7016	NC_008258	GCC	3	9	350312	350320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804390
7017	NC_008258	CAA	2	6	350322	350327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804390
7018	NC_008258	GCA	2	6	350387	350392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804390
7019	NC_008258	CAGC	2	8	350398	350405	25 %	0 %	25 %	50 %	110804390
7020	NC_008258	CGG	2	6	350434	350439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804390
7021	NC_008258	GC	3	6	350656	350661	0 %	0 %	50 %	50 %	110804390
7022	NC_008258	GCC	2	6	350679	350684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804390
7023	NC_008258	GC	3	6	350737	350742	0 %	0 %	50 %	50 %	110804390
7024	NC_008258	GCG	2	6	350802	350807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804390
7025	NC_008258	TCAG	2	8	350846	350853	25 %	25 %	25 %	25 %	110804390
7026	NC_008258	CTTT	2	8	350915	350922	0 %	75 %	0 %	25 %	110804390
7027	NC_008258	GC	3	6	350936	350941	0 %	0 %	50 %	50 %	110804390
7028	NC_008258	TGC	2	6	351096	351101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804391
7029	NC_008258	GGT	2	6	351109	351114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804391
7030	NC_008258	CGC	2	6	351138	351143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804391
7031	NC_008258	AGC	2	6	351144	351149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804391
7032	NC_008258	CG	3	6	351152	351157	0 %	0 %	50 %	50 %	110804391
7033	NC_008258	ATC	2	6	351224	351229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804391
7034	NC_008258	CCG	2	6	351254	351259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804391
7035	NC_008258	CGG	2	6	351346	351351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804391
7036	NC_008258	CT	3	6	351392	351397	0 %	50 %	0 %	50 %	110804391
7037	NC_008258	GCT	2	6	351412	351417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804391
7038	NC_008258	GCTG	2	8	351420	351427	0 %	25 %	50 %	25 %	110804391
7039	NC_008258	GAG	2	6	351482	351487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804391
7040	NC_008258	TCC	2	6	351523	351528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804391
7041	NC_008258	GGT	2	6	351541	351546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804391
7042	NC_008258	TGAA	2	8	351585	351592	50 %	25 %	25 %	0 %	110804391
7043	NC_008258	TAC	2	6	351598	351603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804391
7044	NC_008258	AG	3	6	351628	351633	50 %	0 %	50 %	0 %	110804391
7045	NC_008258	GCG	2	6	351772	351777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804391
7046	NC_008258	CGA	2	6	351792	351797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804391
7047	NC_008258	CGGG	2	8	351821	351828	0 %	0 %	75 %	25 %	110804391
7048	NC_008258	A	7	7	351931	351937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_008258	TCT	3	9	351949	351957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804392
7050	NC_008258	CCGCAC	2	12	351994	352005	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	110804392
7051	NC_008258	GCG	2	6	352065	352070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804392
7052	NC_008258	ATC	2	6	352077	352082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804392
7053	NC_008258	CACG	2	8	352141	352148	25 %	0 %	25 %	50 %	110804392
7054	NC_008258	CAG	2	6	352165	352170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7055	NC_008258	CAG	2	6	352208	352213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7056	NC_008258	CGG	2	6	352414	352419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804392
7057	NC_008258	GCA	2	6	352443	352448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7058	NC_008258	GCTT	2	8	352461	352468	0 %	50 %	25 %	25 %	110804392
7059	NC_008258	CGT	2	6	352489	352494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7060	NC_008258	GCACA	2	10	352511	352520	40 %	0 %	20 %	40 %	110804392
7061	NC_008258	CCA	2	6	352615	352620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804392
7062	NC_008258	GA	3	6	352666	352671	50 %	0 %	50 %	0 %	110804392
7063	NC_008258	ACGGA	2	10	352686	352695	40 %	0 %	40 %	20 %	110804392
7064	NC_008258	GTC	2	6	352784	352789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7065	NC_008258	TCT	2	6	352794	352799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804392
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7068	NC_008258	CGA	2	6	352884	352889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804392
7069	NC_008258	AAG	2	6	352999	353004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_008258	AG	3	6	353013	353018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_008258	AAT	2	6	353047	353052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_008258	TTTA	2	8	353081	353088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_008258	TTA	2	6	353099	353104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_008258	T	9	9	353105	353113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_008258	TGC	2	6	353126	353131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_008258	AAT	2	6	353141	353146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_008258	TGT	2	6	353155	353160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_008258	TA	3	6	353291	353296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_008258	AAT	2	6	353323	353328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_008258	GCA	2	6	353348	353353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_008258	ATA	2	6	353372	353377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_008258	TTA	2	6	353411	353416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_008258	GAG	2	6	353424	353429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_008258	GTA	2	6	353463	353468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_008258	ACG	2	6	353569	353574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_008258	TGA	2	6	353585	353590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_008258	ATG	2	6	353599	353604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_008258	AAC	2	6	353619	353624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_008258	TAA	2	6	353669	353674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_008258	CTAC	2	8	353698	353705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7091	NC_008258	GAC	2	6	353712	353717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_008258	TACCAA	2	12	353726	353737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_008258	GAT	2	6	353898	353903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804393
7094	NC_008258	CA	3	6	353940	353945	50 %	0 %	0 %	50 %	110804393
7095	NC_008258	CAG	2	6	353965	353970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804393
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7097	NC_008258	AGGA	2	8	354059	354066	50 %	0 %	50 %	0 %	110804393
7098	NC_008258	CTG	2	6	354074	354079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804393
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7101	NC_008258	TGC	2	6	354117	354122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804393
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7104	NC_008258	A	6	6	354216	354221	100 %	0 %	0 %	0 %	110804393
7105	NC_008258	TGGA	2	8	354333	354340	25 %	25 %	50 %	0 %	110804394
7106	NC_008258	GCC	2	6	354343	354348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804394
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7109	NC_008258	TCG	2	6	354425	354430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
7110	NC_008258	GCT	2	6	354440	354445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
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7112	NC_008258	GAAA	2	8	354587	354594	75 %	0 %	25 %	0 %	110804394
7113	NC_008258	CTG	2	6	354629	354634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
7114	NC_008258	GA	4	8	354643	354650	50 %	0 %	50 %	0 %	110804394
7115	NC_008258	CTG	2	6	354674	354679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
7116	NC_008258	GCACT	2	10	354690	354699	20 %	20 %	20 %	40 %	110804394
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7119	NC_008258	CGT	2	6	354787	354792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804394
7120	NC_008258	AGTGG	2	10	354797	354806	20 %	20 %	60 %	0 %	110804394
7121	NC_008258	GAA	2	6	354878	354883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804394
7122	NC_008258	CGG	2	6	354886	354891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804394
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7124	NC_008258	AAG	2	6	355001	355006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804394
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7495	NC_008258	TGA	2	6	373956	373961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804417
7496	NC_008258	GTTG	2	8	373992	373999	0 %	50 %	50 %	0 %	110804417
7497	NC_008258	GGTA	2	8	374034	374041	25 %	25 %	50 %	0 %	110804417
7498	NC_008258	GTG	2	6	374077	374082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804417
7499	NC_008258	ATG	2	6	374168	374173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804417
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