MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008258	CA	3	6	325995	326000	50 %	0 %	0 %	50 %	110804369
6502	NC_008258	CGGT	2	8	326025	326032	0 %	25 %	50 %	25 %	110804369
6503	NC_008258	TGC	2	6	326101	326106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
6504	NC_008258	TGA	2	6	326107	326112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804369
6505	NC_008258	GCT	2	6	326146	326151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
6506	NC_008258	TAGCGG	2	12	326187	326198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	110804369
6507	NC_008258	CAG	2	6	326255	326260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_008258	TAA	3	9	326277	326285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_008258	TGGTCA	2	12	326286	326297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6510	NC_008258	CAGC	2	8	326321	326328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_008258	GCC	2	6	326378	326383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_008258	CTG	2	6	326455	326460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6513	NC_008258	TGCG	2	8	326546	326553	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
6514	NC_008258	GTA	2	6	326638	326643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804370
6515	NC_008258	TGC	2	6	326657	326662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6516	NC_008258	CTT	2	6	326811	326816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804370
6517	NC_008258	TGC	2	6	326882	326887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6518	NC_008258	GCA	2	6	326898	326903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6519	NC_008258	GGC	2	6	326904	326909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804370
6520	NC_008258	CTG	2	6	326926	326931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6521	NC_008258	GAT	2	6	326968	326973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804370
6522	NC_008258	CCGT	2	8	327043	327050	0 %	25 %	25 %	50 %	110804370
6523	NC_008258	CGT	2	6	327054	327059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6524	NC_008258	CGTTGC	2	12	327081	327092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6525	NC_008258	GC	3	6	327160	327165	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
6526	NC_008258	CG	3	6	327174	327179	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
6527	NC_008258	GCT	2	6	327223	327228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6528	NC_008258	CTG	2	6	327262	327267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6529	NC_008258	CGTC	2	8	327339	327346	0 %	25 %	25 %	50 %	110804370
6530	NC_008258	CCG	2	6	327348	327353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
6531	NC_008258	CG	3	6	327426	327431	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
6532	NC_008258	CGC	2	6	327453	327458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
6533	NC_008258	TCA	2	6	327494	327499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
6534	NC_008258	GTC	2	6	327583	327588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6535	NC_008258	CAC	2	6	327670	327675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6536	NC_008258	CCG	2	6	327773	327778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804370
6537	NC_008258	TCA	2	6	327812	327817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
6538	NC_008258	ACC	2	6	327819	327824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6539	NC_008258	ACC	2	6	327854	327859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6540	NC_008258	GT	3	6	327914	327919	0 %	50 %	50 %	0 %	110804370
6541	NC_008258	CCA	2	6	327921	327926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6542	NC_008258	CG	3	6	327927	327932	0 %	0 %	50 %	50 %	110804370
6543	NC_008258	GGTA	2	8	327957	327964	25 %	25 %	50 %	0 %	110804370
6544	NC_008258	TCA	2	6	327996	328001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
6545	NC_008258	CAC	2	6	328048	328053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6546	NC_008258	CAGT	2	8	328056	328063	25 %	25 %	25 %	25 %	110804370
6547	NC_008258	TCG	2	6	328073	328078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6548	NC_008258	CGCC	2	8	328106	328113	0 %	0 %	25 %	75 %	110804370
6549	NC_008258	GCT	2	6	328186	328191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6550	NC_008258	TCA	2	6	328286	328291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
6551	NC_008258	TCA	2	6	328295	328300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804370
6552	NC_008258	CGGT	2	8	328316	328323	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
6553	NC_008258	GCA	2	6	328329	328334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6554	NC_008258	TGG	2	6	328391	328396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804370
6555	NC_008258	AT	3	6	328457	328462	50 %	50 %	0 %	0 %	110804370
6556	NC_008258	TGGC	2	8	328535	328542	0 %	25 %	50 %	25 %	110804370
6557	NC_008258	CAGG	2	8	328563	328570	25 %	0 %	50 %	25 %	110804370
6558	NC_008258	GCA	2	6	328599	328604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804370
6559	NC_008258	T	6	6	328608	328613	0 %	100 %	0 %	0 %	110804370
6560	NC_008258	GTG	2	6	328619	328624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804370
6561	NC_008258	CCA	2	6	328688	328693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804370
6562	NC_008258	GCC	2	6	328739	328744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_008258	GCCA	2	8	328756	328763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_008258	CCA	2	6	328800	328805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_008258	ACC	2	6	328858	328863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_008258	GCTG	2	8	328934	328941	0 %	25 %	50 %	25 %	110804371
6567	NC_008258	GGC	2	6	329025	329030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804371
6568	NC_008258	A	7	7	329187	329193	100 %	0 %	0 %	0 %	110804371
6569	NC_008258	AAT	2	6	329211	329216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804371
6570	NC_008258	ATG	2	6	329227	329232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804371
6571	NC_008258	T	8	8	329319	329326	0 %	100 %	0 %	0 %	110804372
6572	NC_008258	ATC	2	6	329382	329387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804372
6573	NC_008258	T	11	11	329575	329585	0 %	100 %	0 %	0 %	110804372
6574	NC_008258	GGC	2	6	329600	329605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804372
6575	NC_008258	GGT	2	6	329613	329618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804372
6576	NC_008258	CAGG	2	8	329726	329733	25 %	0 %	50 %	25 %	110804372
6577	NC_008258	AGC	2	6	329738	329743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804372
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6579	NC_008258	T	6	6	329790	329795	0 %	100 %	0 %	0 %	110804373
6580	NC_008258	GGTA	2	8	329812	329819	25 %	25 %	50 %	0 %	110804373
6581	NC_008258	ATC	2	6	329830	329835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804373
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6588	NC_008258	T	6	6	330164	330169	0 %	100 %	0 %	0 %	110804373
6589	NC_008258	ATC	2	6	330226	330231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804373
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6592	NC_008258	CGG	2	6	330319	330324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804373
6593	NC_008258	GAT	2	6	330355	330360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804373
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6597	NC_008258	TGG	2	6	330642	330647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804373
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6599	NC_008258	TGC	2	6	330698	330703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804373
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6602	NC_008258	GCTGC	2	10	330844	330853	0 %	20 %	40 %	40 %	110804373
6603	NC_008258	AGC	2	6	330974	330979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804373
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6612	NC_008258	ACC	2	6	331442	331447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804373
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6618	NC_008258	GCG	2	6	331665	331670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804373
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6998	NC_008258	ACC	2	6	349513	349518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804389
6999	NC_008258	CTG	2	6	349519	349524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804389
7000	NC_008258	GCA	2	6	349559	349564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804389

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