MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008258	GGA	2	6	300523	300528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008258	ATA	2	6	300698	300703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008258	GCT	2	6	300738	300743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_008258	TTTA	2	8	300875	300882	25 %	75 %	0 %	0 %	110804345
6005	NC_008258	CG	3	6	300953	300958	0 %	0 %	50 %	50 %	110804345
6006	NC_008258	TG	3	6	300968	300973	0 %	50 %	50 %	0 %	110804345
6007	NC_008258	GCC	2	6	301006	301011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804345
6008	NC_008258	TG	3	6	301118	301123	0 %	50 %	50 %	0 %	110804345
6009	NC_008258	CCA	2	6	301227	301232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804345
6010	NC_008258	GCCT	2	8	301243	301250	0 %	25 %	25 %	50 %	110804345
6011	NC_008258	CGC	2	6	301290	301295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804345
6012	NC_008258	TTTG	2	8	301305	301312	0 %	75 %	25 %	0 %	110804345
6013	NC_008258	TCA	2	6	301442	301447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804345
6014	NC_008258	ACC	2	6	301471	301476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804345
6015	NC_008258	CCA	2	6	301529	301534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804345
6016	NC_008258	GCA	2	6	301569	301574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804345
6017	NC_008258	CCG	2	6	301623	301628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804345
6018	NC_008258	ACC	2	6	301699	301704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804345
6019	NC_008258	AGCGA	2	10	301739	301748	40 %	0 %	40 %	20 %	110804345
6020	NC_008258	GC	3	6	301768	301773	0 %	0 %	50 %	50 %	110804345
6021	NC_008258	CGA	2	6	301808	301813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804345
6022	NC_008258	CGC	2	6	301842	301847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804345
6023	NC_008258	TCG	2	6	301898	301903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804345
6024	NC_008258	TCGCT	2	10	301950	301959	0 %	40 %	20 %	40 %	110804345
6025	NC_008258	CG	3	6	301973	301978	0 %	0 %	50 %	50 %	110804345
6026	NC_008258	GAT	2	6	302008	302013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804345
6027	NC_008258	T	6	6	302043	302048	0 %	100 %	0 %	0 %	110804345
6028	NC_008258	T	7	7	302060	302066	0 %	100 %	0 %	0 %	110804345
6029	NC_008258	GCTT	2	8	302099	302106	0 %	50 %	25 %	25 %	110804345
6030	NC_008258	TCA	2	6	302161	302166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804346
6031	NC_008258	GTG	2	6	302223	302228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804346
6032	NC_008258	TGT	2	6	302255	302260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804346
6033	NC_008258	CAC	2	6	302318	302323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804346
6034	NC_008258	GGC	2	6	302388	302393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804346
6035	NC_008258	CGG	2	6	302427	302432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804346
6036	NC_008258	CATCA	2	10	302511	302520	40 %	20 %	0 %	40 %	110804346
6037	NC_008258	TGC	2	6	302537	302542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804346
6038	NC_008258	AAT	2	6	302550	302555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804346
6039	NC_008258	GCC	2	6	302610	302615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804346
6040	NC_008258	CG	3	6	302649	302654	0 %	0 %	50 %	50 %	110804346
6041	NC_008258	TCA	2	6	302662	302667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804346
6042	NC_008258	CTGC	2	8	302693	302700	0 %	25 %	25 %	50 %	110804346
6043	NC_008258	TGC	2	6	302705	302710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804346
6044	NC_008258	CAG	2	6	302745	302750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804346
6045	NC_008258	CGC	2	6	302778	302783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804346
6046	NC_008258	GTTATC	2	12	302796	302807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	110804346
6047	NC_008258	ACGC	2	8	302879	302886	25 %	0 %	25 %	50 %	110804346
6048	NC_008258	CAG	2	6	302940	302945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804346
6049	NC_008258	CCG	2	6	303017	303022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804346
6050	NC_008258	CAG	2	6	303024	303029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804346
6051	NC_008258	CGG	2	6	303083	303088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804346
6052	NC_008258	CGG	2	6	303125	303130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804346
6053	NC_008258	GC	3	6	303140	303145	0 %	0 %	50 %	50 %	110804346
6054	NC_008258	ACC	2	6	303223	303228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804346
6055	NC_008258	AACG	2	8	303286	303293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_008258	GTC	2	6	303307	303312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008258	TTG	2	6	303347	303352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_008258	GTT	2	6	303378	303383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008258	TTA	2	6	303391	303396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_008258	TAA	2	6	303403	303408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008258	TGT	2	6	303539	303544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804347
6062	NC_008258	TCAGAT	2	12	303546	303557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110804347
6063	NC_008258	GCCA	2	8	303633	303640	25 %	0 %	25 %	50 %	110804347
6064	NC_008258	CAG	2	6	303673	303678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804347
6065	NC_008258	AGA	2	6	303683	303688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804347
6066	NC_008258	TCC	2	6	303738	303743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804347
6067	NC_008258	CAGC	2	8	303766	303773	25 %	0 %	25 %	50 %	110804347
6068	NC_008258	ATCAC	2	10	303830	303839	40 %	20 %	0 %	40 %	110804347
6069	NC_008258	T	6	6	303880	303885	0 %	100 %	0 %	0 %	110804347
6070	NC_008258	CAC	2	6	304083	304088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804348
6071	NC_008258	AGGA	2	8	304106	304113	50 %	0 %	50 %	0 %	110804348
6072	NC_008258	ATGGAA	2	12	304120	304131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	110804348
6073	NC_008258	CAT	2	6	304156	304161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804348
6074	NC_008258	GCA	2	6	304181	304186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804348
6075	NC_008258	AT	3	6	304218	304223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008258	CG	3	6	304284	304289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_008258	TTAA	2	8	304290	304297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_008258	AATGAA	2	12	304305	304316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	110804349
6079	NC_008258	GTG	2	6	304336	304341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804349
6080	NC_008258	GCATCT	2	12	304354	304365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110804349
6081	NC_008258	AT	3	6	304381	304386	50 %	50 %	0 %	0 %	110804349
6082	NC_008258	TAA	2	6	304398	304403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804349
6083	NC_008258	ACTG	2	8	304521	304528	25 %	25 %	25 %	25 %	110804349
6084	NC_008258	A	6	6	304589	304594	100 %	0 %	0 %	0 %	110804349
6085	NC_008258	TGG	2	6	304707	304712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804349
6086	NC_008258	CTT	2	6	304785	304790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804349
6087	NC_008258	GGC	2	6	304903	304908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804349
6088	NC_008258	AAT	2	6	305029	305034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804349
6089	NC_008258	GGC	2	6	305086	305091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804349
6090	NC_008258	TGA	2	6	305205	305210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804349
6091	NC_008258	TAT	2	6	305245	305250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804349
6092	NC_008258	CAA	2	6	305253	305258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804349
6093	NC_008258	TTG	2	6	305273	305278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804349
6094	NC_008258	CAAC	2	8	305289	305296	50 %	0 %	0 %	50 %	110804349
6095	NC_008258	ATA	2	6	305306	305311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804349
6096	NC_008258	TAA	2	6	305322	305327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804349
6097	NC_008258	TGA	2	6	305328	305333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804349
6098	NC_008258	TCAC	2	8	305402	305409	25 %	25 %	0 %	50 %	110804350
6099	NC_008258	TCA	2	6	305428	305433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804350
6100	NC_008258	ATC	2	6	305439	305444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804350
6101	NC_008258	CGT	2	6	305469	305474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804350
6102	NC_008258	CAG	2	6	305475	305480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804350
6103	NC_008258	TCCA	2	8	305632	305639	25 %	25 %	0 %	50 %	110804350
6104	NC_008258	T	6	6	305763	305768	0 %	100 %	0 %	0 %	110804350
6105	NC_008258	TGT	2	6	305818	305823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008258	TAA	2	6	305949	305954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804351
6107	NC_008258	CAG	2	6	305963	305968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804351
6108	NC_008258	ATG	2	6	305969	305974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804351
6109	NC_008258	TTC	2	6	306016	306021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804351
6110	NC_008258	TCG	2	6	306112	306117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804351
6111	NC_008258	CAT	2	6	306122	306127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804351
6112	NC_008258	CGCGA	2	10	306306	306315	20 %	0 %	40 %	40 %	110804351
6113	NC_008258	CCAC	2	8	306323	306330	25 %	0 %	0 %	75 %	110804351
6114	NC_008258	GAA	2	6	306400	306405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804351
6115	NC_008258	CG	3	6	306446	306451	0 %	0 %	50 %	50 %	110804351
6116	NC_008258	GCATC	2	10	306491	306500	20 %	20 %	20 %	40 %	110804351
6117	NC_008258	ACC	2	6	306504	306509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804351
6118	NC_008258	CCG	2	6	306577	306582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804351
6119	NC_008258	GGC	2	6	306627	306632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804351
6120	NC_008258	GGC	2	6	306702	306707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804351
6121	NC_008258	TGT	2	6	306710	306715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804351
6122	NC_008258	TCT	2	6	306760	306765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804351
6123	NC_008258	TTG	2	6	306780	306785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804351
6124	NC_008258	CCA	2	6	306826	306831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804351
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6238	NC_008258	AGCA	2	8	312395	312402	50 %	0 %	25 %	25 %	110804357
6239	NC_008258	ATT	2	6	312455	312460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804357
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6241	NC_008258	ATA	2	6	312571	312576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_008258	ATA	2	6	312595	312600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_008258	CAT	2	6	312606	312611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804358
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6493	NC_008258	AT	3	6	325525	325530	50 %	50 %	0 %	0 %	110804369
6494	NC_008258	GATC	2	8	325567	325574	25 %	25 %	25 %	25 %	110804369
6495	NC_008258	ATA	2	6	325667	325672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804369
6496	NC_008258	TTC	2	6	325700	325705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804369
6497	NC_008258	GCT	2	6	325735	325740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804369
6498	NC_008258	GCCC	2	8	325799	325806	0 %	0 %	25 %	75 %	110804369
6499	NC_008258	CGTCC	2	10	325814	325823	0 %	20 %	20 %	60 %	110804369
6500	NC_008258	CT	3	6	325884	325889	0 %	50 %	0 %	50 %	110804369

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