MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008258	CTG	2	6	274098	274103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804316
5502	NC_008258	TGA	2	6	274205	274210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804316
5503	NC_008258	TTG	2	6	274306	274311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804316
5504	NC_008258	TAA	2	6	274345	274350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804316
5505	NC_008258	GAT	2	6	274437	274442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804316
5506	NC_008258	GAAAC	2	10	274443	274452	60 %	0 %	20 %	20 %	110804316
5507	NC_008258	A	6	6	274467	274472	100 %	0 %	0 %	0 %	110804316
5508	NC_008258	A	6	6	274502	274507	100 %	0 %	0 %	0 %	110804316
5509	NC_008258	A	6	6	274521	274526	100 %	0 %	0 %	0 %	110804316
5510	NC_008258	ATAA	2	8	274537	274544	75 %	25 %	0 %	0 %	110804316
5511	NC_008258	GAA	2	6	274561	274566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008258	C	6	6	274594	274599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5513	NC_008258	G	7	7	274608	274614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_008258	T	7	7	274676	274682	0 %	100 %	0 %	0 %	110804317
5515	NC_008258	T	6	6	274754	274759	0 %	100 %	0 %	0 %	110804317
5516	NC_008258	A	6	6	274803	274808	100 %	0 %	0 %	0 %	110804317
5517	NC_008258	TGT	2	6	274829	274834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804317
5518	NC_008258	AAG	2	6	274884	274889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804317
5519	NC_008258	TTG	2	6	274915	274920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804317
5520	NC_008258	TCC	2	6	274937	274942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804317
5521	NC_008258	TAA	2	6	274952	274957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804317
5522	NC_008258	TGCAA	2	10	275102	275111	40 %	20 %	20 %	20 %	110804317
5523	NC_008258	TGT	2	6	275177	275182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804317
5524	NC_008258	ATA	2	6	275253	275258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804317
5525	NC_008258	AAAT	2	8	275260	275267	75 %	25 %	0 %	0 %	110804317
5526	NC_008258	T	8	8	275311	275318	0 %	100 %	0 %	0 %	110804317
5527	NC_008258	TA	3	6	275411	275416	50 %	50 %	0 %	0 %	110804317
5528	NC_008258	ATT	2	6	275435	275440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804317
5529	NC_008258	TAACA	2	10	275456	275465	60 %	20 %	0 %	20 %	110804317
5530	NC_008258	ATT	2	6	275535	275540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804317
5531	NC_008258	ATA	2	6	275541	275546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804317
5532	NC_008258	AG	3	6	275597	275602	50 %	0 %	50 %	0 %	110804317
5533	NC_008258	AAT	2	6	275630	275635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804317
5534	NC_008258	ATTAA	2	10	275667	275676	60 %	40 %	0 %	0 %	110804317
5535	NC_008258	ATA	2	6	275717	275722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804317
5536	NC_008258	ATT	2	6	275759	275764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804317
5537	NC_008258	CATAC	2	10	275776	275785	40 %	20 %	0 %	40 %	110804317
5538	NC_008258	TCT	2	6	275793	275798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804317
5539	NC_008258	T	7	7	275888	275894	0 %	100 %	0 %	0 %	110804317
5540	NC_008258	ATG	2	6	275899	275904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804317
5541	NC_008258	TGA	2	6	275937	275942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804318
5542	NC_008258	TA	3	6	275983	275988	50 %	50 %	0 %	0 %	110804318
5543	NC_008258	AGGG	2	8	276050	276057	25 %	0 %	75 %	0 %	110804318
5544	NC_008258	ATC	2	6	276098	276103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804318
5545	NC_008258	CAA	2	6	276132	276137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804318
5546	NC_008258	TA	3	6	276145	276150	50 %	50 %	0 %	0 %	110804318
5547	NC_008258	ACC	2	6	276283	276288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804318
5548	NC_008258	TGT	2	6	276414	276419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804318
5549	NC_008258	GTC	2	6	276456	276461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804318
5550	NC_008258	AGCA	2	8	276487	276494	50 %	0 %	25 %	25 %	110804318
5551	NC_008258	CCTG	2	8	276506	276513	0 %	25 %	25 %	50 %	110804318
5552	NC_008258	CGC	2	6	276585	276590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804318
5553	NC_008258	AAC	2	6	276655	276660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804318
5554	NC_008258	CAGC	2	8	276675	276682	25 %	0 %	25 %	50 %	110804318
5555	NC_008258	TAA	2	6	276687	276692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804318
5556	NC_008258	CTT	3	9	276798	276806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804318
5557	NC_008258	GGA	2	6	276925	276930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804319
5558	NC_008258	CAAC	2	8	276952	276959	50 %	0 %	0 %	50 %	110804319
5559	NC_008258	GAA	2	6	277047	277052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804319
5560	NC_008258	ATAC	2	8	277120	277127	50 %	25 %	0 %	25 %	110804319
5561	NC_008258	ACC	2	6	277135	277140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804319
5562	NC_008258	GT	3	6	277151	277156	0 %	50 %	50 %	0 %	110804319
5563	NC_008258	ATTT	2	8	277198	277205	25 %	75 %	0 %	0 %	110804319
5564	NC_008258	ATC	2	6	277236	277241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_008258	TGA	2	6	277273	277278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008258	TGG	2	6	277338	277343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008258	TAT	2	6	277433	277438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_008258	TTGC	2	8	277537	277544	0 %	50 %	25 %	25 %	110804320
5569	NC_008258	TCC	2	6	277608	277613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804320
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5572	NC_008258	CCAG	2	8	277652	277659	25 %	0 %	25 %	50 %	110804320
5573	NC_008258	TGCC	2	8	277703	277710	0 %	25 %	25 %	50 %	110804320
5574	NC_008258	TTG	2	6	277735	277740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804320
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5582	NC_008258	TTGC	2	8	278194	278201	0 %	50 %	25 %	25 %	110804320
5583	NC_008258	GGC	2	6	278279	278284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804320
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5588	NC_008258	TCA	3	9	278386	278394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804320
5589	NC_008258	CTT	2	6	278400	278405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804320
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5591	NC_008258	AG	3	6	278545	278550	50 %	0 %	50 %	0 %	110804320
5592	NC_008258	CGA	2	6	278576	278581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804320
5593	NC_008258	TTGA	2	8	278611	278618	25 %	50 %	25 %	0 %	110804320
5594	NC_008258	CCT	2	6	278629	278634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_008258	GTC	2	6	278755	278760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_008258	ACG	2	6	278806	278811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_008258	TCT	2	6	278835	278840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_008258	ATTGG	2	10	278861	278870	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008258	TAT	2	6	278871	278876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008258	TTC	2	6	278959	278964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_008258	GAAT	2	8	279083	279090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008258	CAA	2	6	279112	279117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_008258	TGA	2	6	279165	279170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008258	A	6	6	279295	279300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008258	GGC	2	6	279310	279315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_008258	ATC	2	6	279380	279385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_008258	TCCAT	2	10	279442	279451	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5608	NC_008258	ATC	2	6	279477	279482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_008258	AAAAC	2	10	279488	279497	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5610	NC_008258	CCG	2	6	279498	279503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_008258	CTG	2	6	279558	279563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_008258	TAT	2	6	279621	279626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008258	GGC	2	6	279655	279660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_008258	CGG	2	6	279680	279685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804321
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