MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008258	GCC	2	6	247344	247349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804282
5002	NC_008258	CAT	2	6	247365	247370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804282
5003	NC_008258	CCG	2	6	247391	247396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804282
5004	NC_008258	ACTC	2	8	247476	247483	25 %	25 %	0 %	50 %	110804282
5005	NC_008258	TGA	2	6	247545	247550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804282
5006	NC_008258	TGC	2	6	247572	247577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804282
5007	NC_008258	GGC	2	6	247608	247613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804282
5008	NC_008258	CAAA	2	8	247616	247623	75 %	0 %	0 %	25 %	110804282
5009	NC_008258	ATC	2	6	247725	247730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804283
5010	NC_008258	CTGG	2	8	247855	247862	0 %	25 %	50 %	25 %	110804283
5011	NC_008258	GCAAC	2	10	247873	247882	40 %	0 %	20 %	40 %	110804283
5012	NC_008258	TTC	2	6	247935	247940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804283
5013	NC_008258	TGA	2	6	247964	247969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804283
5014	NC_008258	CGC	2	6	247983	247988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804283
5015	NC_008258	A	6	6	248004	248009	100 %	0 %	0 %	0 %	110804283
5016	NC_008258	TTG	2	6	248065	248070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804283
5017	NC_008258	GCCT	2	8	248104	248111	0 %	25 %	25 %	50 %	110804283
5018	NC_008258	GAA	2	6	248259	248264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804283
5019	NC_008258	TGA	2	6	248306	248311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804283
5020	NC_008258	TTC	2	6	248314	248319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804283
5021	NC_008258	TCC	2	6	248466	248471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804283
5022	NC_008258	ACC	2	6	248472	248477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804283
5023	NC_008258	GCG	2	6	248488	248493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804283
5024	NC_008258	GAA	2	6	248537	248542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804283
5025	NC_008258	CTGA	2	8	248547	248554	25 %	25 %	25 %	25 %	110804283
5026	NC_008258	AGA	2	6	248648	248653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804283
5027	NC_008258	CT	3	6	248678	248683	0 %	50 %	0 %	50 %	110804283
5028	NC_008258	CAA	2	6	248719	248724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804283
5029	NC_008258	TGA	2	6	248747	248752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804283
5030	NC_008258	CTG	2	6	248763	248768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804283
5031	NC_008258	CTTC	2	8	248818	248825	0 %	50 %	0 %	50 %	110804283
5032	NC_008258	TCTG	2	8	248882	248889	0 %	50 %	25 %	25 %	110804283
5033	NC_008258	TG	3	6	248906	248911	0 %	50 %	50 %	0 %	110804283
5034	NC_008258	AC	3	6	249023	249028	50 %	0 %	0 %	50 %	110804284
5035	NC_008258	GAA	2	6	249052	249057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804284
5036	NC_008258	GCTG	2	8	249122	249129	0 %	25 %	50 %	25 %	110804284
5037	NC_008258	TGA	2	6	249142	249147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804284
5038	NC_008258	AGA	2	6	249172	249177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804284
5039	NC_008258	GGC	2	6	249211	249216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804284
5040	NC_008258	ATG	3	9	249345	249353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804285
5041	NC_008258	TGCC	2	8	249488	249495	0 %	25 %	25 %	50 %	110804285
5042	NC_008258	AGC	2	6	249599	249604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804285
5043	NC_008258	GGAA	2	8	249691	249698	50 %	0 %	50 %	0 %	110804285
5044	NC_008258	CAG	2	6	249836	249841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804286
5045	NC_008258	GCG	2	6	249901	249906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804286
5046	NC_008258	ACA	2	6	249913	249918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804286
5047	NC_008258	GT	3	6	249942	249947	0 %	50 %	50 %	0 %	110804286
5048	NC_008258	ATG	2	6	250072	250077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804286
5049	NC_008258	CAT	2	6	250283	250288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804286
5050	NC_008258	CGA	2	6	250333	250338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804286
5051	NC_008258	ACC	2	6	250365	250370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804286
5052	NC_008258	TCA	2	6	250468	250473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804286
5053	NC_008258	TA	3	6	250501	250506	50 %	50 %	0 %	0 %	110804286
5054	NC_008258	TCC	2	6	250558	250563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804286
5055	NC_008258	TGA	2	6	250577	250582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804286
5056	NC_008258	GC	3	6	250647	250652	0 %	0 %	50 %	50 %	110804286
5057	NC_008258	ACG	2	6	250666	250671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804286
5058	NC_008258	GT	3	6	250700	250705	0 %	50 %	50 %	0 %	110804286
5059	NC_008258	GCG	2	6	250777	250782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804286
5060	NC_008258	CAG	2	6	250823	250828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804286
5061	NC_008258	CTG	2	6	250854	250859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804286
5062	NC_008258	TC	3	6	250952	250957	0 %	50 %	0 %	50 %	110804286
5063	NC_008258	GAT	2	6	250994	250999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804286
5064	NC_008258	CGTT	2	8	251014	251021	0 %	50 %	25 %	25 %	110804286
5065	NC_008258	TCT	2	6	251217	251222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804287
5066	NC_008258	ATG	2	6	251310	251315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804287
5067	NC_008258	AGC	2	6	251361	251366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804287
5068	NC_008258	CTG	2	6	251373	251378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804287
5069	NC_008258	GAG	2	6	251402	251407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804287
5070	NC_008258	ACT	2	6	251558	251563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804287
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5072	NC_008258	GTT	2	6	251579	251584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804287
5073	NC_008258	CTG	2	6	251636	251641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804287
5074	NC_008258	TTC	2	6	251678	251683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804287
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5078	NC_008258	TTC	2	6	251876	251881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804287
5079	NC_008258	GCA	2	6	251916	251921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804287
5080	NC_008258	GCG	2	6	251945	251950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804287
5081	NC_008258	CAA	2	6	252066	252071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804288
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5089	NC_008258	GGCA	2	8	252688	252695	25 %	0 %	50 %	25 %	110804289
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5102	NC_008258	CAG	2	6	253377	253382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804290
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5121	NC_008258	TGA	2	6	254542	254547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804291
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5243	NC_008258	A	7	7	260772	260778	100 %	0 %	0 %	0 %	110804299
5244	NC_008258	GCA	2	6	260977	260982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804300
5245	NC_008258	GAC	2	6	260990	260995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804300
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5247	NC_008258	GCT	2	6	261124	261129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
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5250	NC_008258	CTG	2	6	261320	261325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
5251	NC_008258	GTG	2	6	261335	261340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804300
5252	NC_008258	A	6	6	261386	261391	100 %	0 %	0 %	0 %	110804300
5253	NC_008258	GGC	2	6	261404	261409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
5254	NC_008258	CG	3	6	261439	261444	0 %	0 %	50 %	50 %	110804300
5255	NC_008258	GAT	2	6	261533	261538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804300
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5259	NC_008258	GCGAC	2	10	261720	261729	20 %	0 %	40 %	40 %	110804300
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5262	NC_008258	CTG	2	6	261836	261841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
5263	NC_008258	CT	3	6	261898	261903	0 %	50 %	0 %	50 %	110804300
5264	NC_008258	CGC	2	6	261946	261951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804300
5265	NC_008258	ACC	2	6	262067	262072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804300
5266	NC_008258	CGG	2	6	262081	262086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
5267	NC_008258	CTG	2	6	262115	262120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
5268	NC_008258	GCG	2	6	262130	262135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
5269	NC_008258	GAA	2	6	262180	262185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_008258	GAC	2	6	262260	262265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804301
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5272	NC_008258	TGA	2	6	262450	262455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804302
5273	NC_008258	CTG	2	6	262469	262474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804302
5274	NC_008258	GCG	2	6	262481	262486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804302
5275	NC_008258	CGGA	2	8	262493	262500	25 %	0 %	50 %	25 %	110804302
5276	NC_008258	GAT	2	6	262577	262582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804302
5277	NC_008258	GATGCT	2	12	262594	262605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110804302
5278	NC_008258	TCG	2	6	262631	262636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804302
5279	NC_008258	TGGC	2	8	262675	262682	0 %	25 %	50 %	25 %	110804302
5280	NC_008258	TTG	2	6	262683	262688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804302
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5284	NC_008258	GCG	2	6	263031	263036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804303
5285	NC_008258	CTG	3	9	263041	263049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804303
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5291	NC_008258	CGT	2	6	263438	263443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804304
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5310	NC_008258	CAG	2	6	264034	264039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804305
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5313	NC_008258	CCG	2	6	264229	264234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5314	NC_008258	TGA	2	6	264248	264253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5315	NC_008258	AAC	2	6	264255	264260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5316	NC_008258	AGC	2	6	264278	264283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5324	NC_008258	TAC	2	6	264868	264873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804306
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5331	NC_008258	TGG	2	6	265295	265300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804306
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5335	NC_008258	TGC	2	6	265397	265402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
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5337	NC_008258	AGTA	2	8	265528	265535	50 %	25 %	25 %	0 %	110804306
5338	NC_008258	CGG	2	6	265598	265603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804306
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5340	NC_008258	CAG	2	6	265860	265865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804307
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5342	NC_008258	ATG	2	6	265912	265917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804307
5343	NC_008258	CAT	2	6	265919	265924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804307
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5345	NC_008258	TGA	2	6	266030	266035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804307
5346	NC_008258	GTC	2	6	266081	266086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804307
5347	NC_008258	GCGAA	2	10	266101	266110	40 %	0 %	40 %	20 %	110804307
5348	NC_008258	GAA	2	6	266121	266126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804307
5349	NC_008258	GAA	2	6	266154	266159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804307
5350	NC_008258	TGA	2	6	266239	266244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804308
5351	NC_008258	AGTC	2	8	266301	266308	25 %	25 %	25 %	25 %	110804308
5352	NC_008258	GCG	2	6	266405	266410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804308
5353	NC_008258	T	6	6	266425	266430	0 %	100 %	0 %	0 %	110804308
5354	NC_008258	CTT	2	6	266466	266471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5355	NC_008258	GTCA	2	8	266545	266552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5356	NC_008258	CA	3	6	266580	266585	50 %	0 %	0 %	50 %	110804309
5357	NC_008258	GAA	2	6	266687	266692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804309
5358	NC_008258	TGG	2	6	266716	266721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804309
5359	NC_008258	CGC	2	6	266776	266781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804309
5360	NC_008258	ATG	2	6	266801	266806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804309
5361	NC_008258	ATG	2	6	266906	266911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804309
5362	NC_008258	A	7	7	266996	267002	100 %	0 %	0 %	0 %	110804309
5363	NC_008258	GCT	2	6	267014	267019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804309
5364	NC_008258	TGC	2	6	267025	267030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804309
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5482	NC_008258	C	6	6	272942	272947	0 %	0 %	0 %	100 %	110804315
5483	NC_008258	CAGC	2	8	272961	272968	25 %	0 %	25 %	50 %	110804315
5484	NC_008258	TCA	2	6	273010	273015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804315
5485	NC_008258	CAC	3	9	273052	273060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804315
5486	NC_008258	GGCG	2	8	273172	273179	0 %	0 %	75 %	25 %	110804315
5487	NC_008258	TGC	2	6	273211	273216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804315
5488	NC_008258	CAGAC	2	10	273223	273232	40 %	0 %	20 %	40 %	110804315
5489	NC_008258	GCC	2	6	273338	273343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804315
5490	NC_008258	ACC	2	6	273350	273355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804315
5491	NC_008258	TG	3	6	273419	273424	0 %	50 %	50 %	0 %	110804315
5492	NC_008258	GAT	2	6	273587	273592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_008258	ACT	2	6	273594	273599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_008258	AGG	2	6	273612	273617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_008258	GTG	2	6	273629	273634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_008258	GGC	2	6	273663	273668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_008258	CG	3	6	273692	273697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5498	NC_008258	CTG	2	6	273698	273703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_008258	AGC	2	6	273784	273789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_008258	GCT	2	6	273863	273868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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