MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 93120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008258	GCA	2	6	221563	221568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804254
4502	NC_008258	CAA	2	6	221626	221631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804254
4503	NC_008258	CAT	2	6	221642	221647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804254
4504	NC_008258	GGCAA	2	10	221693	221702	40 %	0 %	40 %	20 %	110804254
4505	NC_008258	GA	3	6	221704	221709	50 %	0 %	50 %	0 %	110804254
4506	NC_008258	CTC	2	6	221888	221893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110804255
4507	NC_008258	CCA	2	6	222023	222028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804255
4508	NC_008258	TCG	2	6	222235	222240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804255
4509	NC_008258	TTTC	2	8	222370	222377	0 %	75 %	0 %	25 %	110804255
4510	NC_008258	TAA	2	6	222386	222391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804255
4511	NC_008258	GGA	2	6	222399	222404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804255
4512	NC_008258	TTAA	2	8	222448	222455	50 %	50 %	0 %	0 %	110804255
4513	NC_008258	GCA	2	6	222470	222475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804255
4514	NC_008258	CGA	2	6	222580	222585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804255
4515	NC_008258	CTT	2	6	222599	222604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804255
4516	NC_008258	TTGC	2	8	222695	222702	0 %	50 %	25 %	25 %	110804255
4517	NC_008258	CGA	2	6	222740	222745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804255
4518	NC_008258	TTC	2	6	222765	222770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804255
4519	NC_008258	ATTT	2	8	222822	222829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_008258	AAT	2	6	222879	222884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008258	A	6	6	223031	223036	100 %	0 %	0 %	0 %	110804256
4522	NC_008258	CCG	2	6	223086	223091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804256
4523	NC_008258	ACC	2	6	223121	223126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804256
4524	NC_008258	GCC	2	6	223305	223310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804256
4525	NC_008258	TGC	2	6	223330	223335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804256
4526	NC_008258	CGG	2	6	223366	223371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804256
4527	NC_008258	TGC	2	6	223386	223391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804256
4528	NC_008258	TGG	2	6	223477	223482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804256
4529	NC_008258	CAC	2	6	223563	223568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804256
4530	NC_008258	GAT	2	6	223677	223682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804256
4531	NC_008258	GCC	2	6	223702	223707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804256
4532	NC_008258	CG	3	6	223765	223770	0 %	0 %	50 %	50 %	110804256
4533	NC_008258	ATAA	2	8	223819	223826	75 %	25 %	0 %	0 %	110804256
4534	NC_008258	ACA	2	6	223885	223890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008258	ACA	2	6	223907	223912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804257
4536	NC_008258	CCA	2	6	223918	223923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804257
4537	NC_008258	TGC	2	6	224086	224091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804257
4538	NC_008258	GGT	2	6	224107	224112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804257
4539	NC_008258	CAC	2	6	224185	224190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804257
4540	NC_008258	ATG	2	6	224274	224279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804257
4541	NC_008258	GCA	2	6	224285	224290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804257
4542	NC_008258	GTGAA	2	10	224295	224304	40 %	20 %	40 %	0 %	110804257
4543	NC_008258	GAT	2	6	224329	224334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804257
4544	NC_008258	TAATT	2	10	224479	224488	40 %	60 %	0 %	0 %	110804257
4545	NC_008258	TAG	2	6	224550	224555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804257
4546	NC_008258	ATC	2	6	224642	224647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804257
4547	NC_008258	ATAA	2	8	224671	224678	75 %	25 %	0 %	0 %	110804257
4548	NC_008258	A	6	6	224677	224682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_008258	TAT	2	6	224708	224713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_008258	TGT	3	9	224736	224744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804258
4551	NC_008258	AAC	2	6	224753	224758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804258
4552	NC_008258	TGT	2	6	224892	224897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804258
4553	NC_008258	CTGC	2	8	224918	224925	0 %	25 %	25 %	50 %	110804258
4554	NC_008258	CTG	2	6	224980	224985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804258
4555	NC_008258	GCG	2	6	225069	225074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804258
4556	NC_008258	CAG	2	6	225102	225107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804258
4557	NC_008258	GA	3	6	225124	225129	50 %	0 %	50 %	0 %	110804258
4558	NC_008258	CTT	2	6	225151	225156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804258
4559	NC_008258	CGC	2	6	225486	225491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804258
4560	NC_008258	GTC	3	9	225520	225528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804258
4561	NC_008258	CAT	2	6	225550	225555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804258
4562	NC_008258	GTT	2	6	225569	225574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804258
4563	NC_008258	CAA	2	6	225579	225584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804258
4564	NC_008258	GTA	3	9	225717	225725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804258
4565	NC_008258	T	6	6	225748	225753	0 %	100 %	0 %	0 %	110804258
4566	NC_008258	TTTCTG	2	12	225832	225843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	110804258
4567	NC_008258	TCG	2	6	225884	225889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804258
4568	NC_008258	TCCA	2	8	225938	225945	25 %	25 %	0 %	50 %	110804258
4569	NC_008258	TGC	2	6	225967	225972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804258
4570	NC_008258	GTGC	2	8	226002	226009	0 %	25 %	50 %	25 %	110804258
4571	NC_008258	TG	4	8	226080	226087	0 %	50 %	50 %	0 %	110804258
4572	NC_008258	GAC	2	6	226105	226110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_008258	TCTT	2	8	226162	226169	0 %	75 %	0 %	25 %	110804259
4574	NC_008258	GTT	2	6	226199	226204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804259
4575	NC_008258	AAT	2	6	226207	226212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804259
4576	NC_008258	TTC	2	6	226215	226220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110804259
4577	NC_008258	ATTA	2	8	226230	226237	50 %	50 %	0 %	0 %	110804259
4578	NC_008258	A	7	7	226258	226264	100 %	0 %	0 %	0 %	110804259
4579	NC_008258	T	6	6	226312	226317	0 %	100 %	0 %	0 %	110804259
4580	NC_008258	ATA	2	6	226341	226346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804259
4581	NC_008258	TGAT	2	8	226464	226471	25 %	50 %	25 %	0 %	110804259
4582	NC_008258	AAC	2	6	226495	226500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804259
4583	NC_008258	CACC	2	8	226507	226514	25 %	0 %	0 %	75 %	110804259
4584	NC_008258	CGC	2	6	226529	226534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804259
4585	NC_008258	TGT	2	6	226650	226655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804259
4586	NC_008258	CCA	2	6	226709	226714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804259
4587	NC_008258	CGC	2	6	226724	226729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804259
4588	NC_008258	GTG	2	6	226740	226745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804259
4589	NC_008258	TGG	2	6	226747	226752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804259
4590	NC_008258	TCA	2	6	226849	226854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804259
4591	NC_008258	TCA	2	6	226876	226881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804259
4592	NC_008258	TGA	2	6	226939	226944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804260
4593	NC_008258	TCA	2	6	227129	227134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804260
4594	NC_008258	GTG	2	6	227243	227248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804260
4595	NC_008258	TTA	2	6	227265	227270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804260
4596	NC_008258	TGAT	2	8	227290	227297	25 %	50 %	25 %	0 %	110804260
4597	NC_008258	TGGC	2	8	227300	227307	0 %	25 %	50 %	25 %	110804260
4598	NC_008258	ACTGG	2	10	227417	227426	20 %	20 %	40 %	20 %	110804260
4599	NC_008258	CT	3	6	227427	227432	0 %	50 %	0 %	50 %	110804260
4600	NC_008258	TTG	2	6	227433	227438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804260
4601	NC_008258	TGC	2	6	227449	227454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804260
4602	NC_008258	AACA	2	8	227484	227491	75 %	0 %	0 %	25 %	110804260
4603	NC_008258	GGA	2	6	227493	227498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804260
4604	NC_008258	TTG	2	6	227545	227550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804260
4605	NC_008258	CGC	2	6	227705	227710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804262
4606	NC_008258	TCA	2	6	227724	227729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804262
4607	NC_008258	CGTT	2	8	227733	227740	0 %	50 %	25 %	25 %	110804262
4608	NC_008258	CCCATT	2	12	227767	227778	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	110804262
4609	NC_008258	TGC	2	6	227787	227792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804262
4610	NC_008258	GCA	2	6	227799	227804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804262
4611	NC_008258	T	6	6	227829	227834	0 %	100 %	0 %	0 %	110804262
4612	NC_008258	T	6	6	227840	227845	0 %	100 %	0 %	0 %	110804262
4613	NC_008258	CTG	2	6	227848	227853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804262
4614	NC_008258	T	6	6	227867	227872	0 %	100 %	0 %	0 %	110804262
4615	NC_008258	GTT	2	6	227993	227998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804262
4616	NC_008258	GGT	2	6	227999	228004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804262
4617	NC_008258	ACC	2	6	228234	228239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804262
4618	NC_008258	AGT	2	6	228302	228307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804261
4619	NC_008258	TGG	2	6	228361	228366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804261
4620	NC_008258	TGA	2	6	228398	228403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804261
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4622	NC_008258	TGG	2	6	228586	228591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804261
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4752	NC_008258	TGT	2	6	234536	234541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804268
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