MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 90652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008048	ATCGAC	2	12	141427	141438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	103485641
3502	NC_008048	ATC	2	6	141452	141457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485641
3503	NC_008048	GGT	2	6	141550	141555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485641
3504	NC_008048	ACG	2	6	141590	141595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485641
3505	NC_008048	CG	5	10	141610	141619	0 %	0 %	50 %	50 %	103485641
3506	NC_008048	GGC	2	6	141628	141633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485641
3507	NC_008048	CGG	2	6	141642	141647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485641
3508	NC_008048	TGGTG	2	10	141672	141681	0 %	40 %	60 %	0 %	103485641
3509	NC_008048	ACG	2	6	141785	141790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_008048	GGCA	2	8	141838	141845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_008048	CG	3	6	141862	141867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_008048	GGC	2	6	141881	141886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_008048	GC	3	6	141885	141890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_008048	TGG	2	6	141918	141923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485642
3515	NC_008048	GAG	2	6	141986	141991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485642
3516	NC_008048	GC	3	6	142008	142013	0 %	0 %	50 %	50 %	103485642
3517	NC_008048	GCG	3	9	142036	142044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3518	NC_008048	CTG	2	6	142113	142118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485642
3519	NC_008048	CG	3	6	142128	142133	0 %	0 %	50 %	50 %	103485642
3520	NC_008048	GCG	3	9	142131	142139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3521	NC_008048	GGC	2	6	142154	142159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3522	NC_008048	GCG	2	6	142171	142176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3523	NC_008048	CGT	2	6	142217	142222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485642
3524	NC_008048	CCG	2	6	142277	142282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485642
3525	NC_008048	CGGG	2	8	142294	142301	0 %	0 %	75 %	25 %	103485642
3526	NC_008048	GGC	2	6	142323	142328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3527	NC_008048	GC	3	6	142327	142332	0 %	0 %	50 %	50 %	103485642
3528	NC_008048	GCG	2	6	142358	142363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3529	NC_008048	CGG	2	6	142388	142393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3530	NC_008048	GCC	2	6	142464	142469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485642
3531	NC_008048	CGC	2	6	142483	142488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485642
3532	NC_008048	GGCGC	2	10	142512	142521	0 %	0 %	60 %	40 %	103485642
3533	NC_008048	GGCGGG	2	12	142535	142546	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	103485642
3534	NC_008048	TCC	2	6	142581	142586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_008048	GGA	2	6	142604	142609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008048	CCCCA	2	10	142626	142635	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3537	NC_008048	CGT	2	6	142640	142645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_008048	TCG	2	6	142710	142715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3539	NC_008048	GCC	2	6	142781	142786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3540	NC_008048	GAC	2	6	142796	142801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3541	NC_008048	GCC	2	6	142853	142858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3542	NC_008048	GC	3	6	142905	142910	0 %	0 %	50 %	50 %	103485643
3543	NC_008048	TCG	2	6	143022	143027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3544	NC_008048	CGG	2	6	143044	143049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3545	NC_008048	GCG	2	6	143064	143069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3546	NC_008048	GC	3	6	143072	143077	0 %	0 %	50 %	50 %	103485643
3547	NC_008048	CTT	2	6	143114	143119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485643
3548	NC_008048	GCC	2	6	143134	143139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3549	NC_008048	GCG	2	6	143220	143225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3550	NC_008048	CG	4	8	143266	143273	0 %	0 %	50 %	50 %	103485643
3551	NC_008048	AGC	3	9	143274	143282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3552	NC_008048	CAG	2	6	143315	143320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3553	NC_008048	GCC	2	6	143334	143339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3554	NC_008048	GTC	2	6	143342	143347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3555	NC_008048	GCG	2	6	143352	143357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3556	NC_008048	GCG	2	6	143370	143375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3557	NC_008048	GCC	2	6	143431	143436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_008048	TGC	2	6	143445	143450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_008048	TGC	2	6	143464	143469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_008048	T	6	6	143470	143475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008048	GC	3	6	143547	143552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_008048	GAA	2	6	143695	143700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485644
3563	NC_008048	ATC	2	6	143711	143716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485644
3564	NC_008048	CGA	2	6	143731	143736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485644
3565	NC_008048	AGG	2	6	143742	143747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485644
3566	NC_008048	TCACCG	2	12	143775	143786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	103485644
3567	NC_008048	GTC	2	6	143846	143851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485644
3568	NC_008048	TCG	2	6	143883	143888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485644
3569	NC_008048	CGT	2	6	143908	143913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485644
3570	NC_008048	GCC	2	6	143924	143929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485644
3571	NC_008048	GCG	2	6	143930	143935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485644
3572	NC_008048	AAG	2	6	144085	144090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008048	ATC	2	6	144124	144129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485645
3574	NC_008048	GCA	2	6	144195	144200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3575	NC_008048	CGA	2	6	144225	144230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3576	NC_008048	TCG	2	6	144265	144270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3577	NC_008048	TCT	2	6	144371	144376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485645
3578	NC_008048	TCG	2	6	144383	144388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3579	NC_008048	ACG	2	6	144427	144432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3580	NC_008048	GC	3	6	144438	144443	0 %	0 %	50 %	50 %	103485645
3581	NC_008048	TTC	2	6	144505	144510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485645
3582	NC_008048	CGA	2	6	144516	144521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3583	NC_008048	CGA	2	6	144564	144569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
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3585	NC_008048	CCGC	2	8	144624	144631	0 %	0 %	25 %	75 %	103485645
3586	NC_008048	GC	3	6	144630	144635	0 %	0 %	50 %	50 %	103485645
3587	NC_008048	GGC	2	6	144640	144645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485645
3588	NC_008048	CGA	2	6	144701	144706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3589	NC_008048	CAC	2	6	144736	144741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485645
3590	NC_008048	CGC	2	6	144750	144755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485645
3591	NC_008048	GCA	2	6	144759	144764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3592	NC_008048	CCG	2	6	144800	144805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485645
3593	NC_008048	GTC	2	6	144829	144834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3594	NC_008048	CGG	2	6	145002	145007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485645
3595	NC_008048	TCA	2	6	145010	145015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485645
3596	NC_008048	CGA	3	9	145049	145057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485645
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3598	NC_008048	GCT	2	6	145227	145232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485645
3599	NC_008048	ATCC	2	8	145264	145271	25 %	25 %	0 %	50 %	103485645
3600	NC_008048	GCC	2	6	145305	145310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485645
3601	NC_008048	GC	3	6	145606	145611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_008048	CCG	2	6	145634	145639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_008048	CGG	2	6	145644	145649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008048	GAT	2	6	145672	145677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485646
3605	NC_008048	GCG	2	6	145719	145724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3606	NC_008048	CCG	2	6	145728	145733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485646
3607	NC_008048	CGG	2	6	145737	145742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3608	NC_008048	GGC	4	12	145774	145785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3609	NC_008048	GGC	2	6	145816	145821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3610	NC_008048	CGA	2	6	145840	145845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485646
3611	NC_008048	GCG	2	6	145866	145871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3612	NC_008048	CGC	2	6	145897	145902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485646
3613	NC_008048	CGC	2	6	145906	145911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485646
3614	NC_008048	GC	3	6	145974	145979	0 %	0 %	50 %	50 %	103485646
3615	NC_008048	CGC	2	6	145984	145989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485646
3616	NC_008048	CCG	2	6	146010	146015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485646
3617	NC_008048	TCG	2	6	146028	146033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485646
3618	NC_008048	CGG	2	6	146134	146139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485646
3619	NC_008048	CTGA	2	8	146142	146149	25 %	25 %	25 %	25 %	103485646
3620	NC_008048	G	7	7	146153	146159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_008048	CAT	2	6	146174	146179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485647
3622	NC_008048	CGC	2	6	146184	146189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485647
3623	NC_008048	AGC	2	6	146211	146216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485647
3624	NC_008048	GCCGC	2	10	146280	146289	0 %	0 %	40 %	60 %	103485647
3625	NC_008048	CGA	2	6	146302	146307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485647
3626	NC_008048	CAT	2	6	146309	146314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485647
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3649	NC_008048	CCTGAT	2	12	147203	147214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3651	NC_008048	CCG	2	6	147232	147237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3652	NC_008048	CG	3	6	147289	147294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3653	NC_008048	AAG	2	6	147295	147300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_008048	CGG	2	6	147323	147328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3655	NC_008048	CCCG	2	8	147372	147379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3656	NC_008048	CTG	2	6	147453	147458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485649
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3686	NC_008048	CCG	2	6	148913	148918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3687	NC_008048	ATGCC	2	10	148944	148953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3689	NC_008048	CCG	2	6	149047	149052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3743	NC_008048	TCG	2	6	151179	151184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485651
3744	NC_008048	CGA	2	6	151248	151253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485651
3745	NC_008048	CGC	2	6	151276	151281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485651
3746	NC_008048	GGC	2	6	151318	151323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485651
3747	NC_008048	CGG	2	6	151324	151329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485651
3748	NC_008048	TGC	2	6	151380	151385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485651
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3750	NC_008048	CGC	2	6	151420	151425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485651
3751	NC_008048	CGA	2	6	151429	151434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485651
3752	NC_008048	CGC	2	6	151456	151461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485651
3753	NC_008048	GGT	2	6	151495	151500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485651
3754	NC_008048	CGA	2	6	151558	151563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485651
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3756	NC_008048	CGC	2	6	151599	151604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485651
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3758	NC_008048	CGACCG	2	12	151684	151695	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	103485651
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3763	NC_008048	G	7	7	151997	152003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3764	NC_008048	GC	3	6	152014	152019	0 %	0 %	50 %	50 %	103485652
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3857	NC_008048	CAG	2	6	155207	155212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485653
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3862	NC_008048	CGC	2	6	155358	155363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485653
3863	NC_008048	GC	3	6	155368	155373	0 %	0 %	50 %	50 %	103485653
3864	NC_008048	CG	3	6	155393	155398	0 %	0 %	50 %	50 %	103485653
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3990	NC_008048	CCG	2	6	159030	159035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485655
3991	NC_008048	CG	3	6	159040	159045	0 %	0 %	50 %	50 %	103485655
3992	NC_008048	GC	3	6	159081	159086	0 %	0 %	50 %	50 %	103485655
3993	NC_008048	GCC	2	6	159165	159170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485655
3994	NC_008048	CCG	2	6	159171	159176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485655
3995	NC_008048	CGC	2	6	159192	159197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485655
3996	NC_008048	AGC	3	9	159236	159244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485655
3997	NC_008048	CATC	2	8	159246	159253	25 %	25 %	0 %	50 %	103485655
3998	NC_008048	CGT	2	6	159258	159263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485655
3999	NC_008048	GC	3	6	159271	159276	0 %	0 %	50 %	50 %	103485655
4000	NC_008048	GGATC	2	10	159336	159345	20 %	20 %	40 %	20 %	103485655

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