MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 90652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008048	GC	3	6	118923	118928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_008048	GC	3	6	118934	118939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_008048	GGC	2	6	118992	118997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485618
3004	NC_008048	AGG	2	6	119057	119062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485618
3005	NC_008048	GAT	2	6	119076	119081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485618
3006	NC_008048	GCC	2	6	119091	119096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3007	NC_008048	ATG	2	6	119122	119127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485618
3008	NC_008048	GCC	2	6	119130	119135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3009	NC_008048	GCGGA	2	10	119188	119197	20 %	0 %	60 %	20 %	103485618
3010	NC_008048	CCG	3	9	119212	119220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3011	NC_008048	ATC	3	9	119221	119229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485618
3012	NC_008048	AGG	2	6	119305	119310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485618
3013	NC_008048	CAG	2	6	119343	119348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485618
3014	NC_008048	GCC	3	9	119349	119357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3015	NC_008048	GAT	2	6	119364	119369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485618
3016	NC_008048	CG	4	8	119395	119402	0 %	0 %	50 %	50 %	103485618
3017	NC_008048	AGC	2	6	119407	119412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485618
3018	NC_008048	CGG	2	6	119431	119436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485618
3019	NC_008048	CCA	2	6	119463	119468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485618
3020	NC_008048	GCG	2	6	119476	119481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485618
3021	NC_008048	GCCA	2	8	119485	119492	25 %	0 %	25 %	50 %	103485618
3022	NC_008048	CGC	2	6	119493	119498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3023	NC_008048	AGC	2	6	119524	119529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485618
3024	NC_008048	AGA	2	6	119605	119610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485618
3025	NC_008048	GCC	2	6	119622	119627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3026	NC_008048	GCC	2	6	119797	119802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3027	NC_008048	GTCGG	2	10	119823	119832	0 %	20 %	60 %	20 %	103485618
3028	NC_008048	CGC	2	6	119833	119838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485618
3029	NC_008048	AGC	2	6	119919	119924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_008048	GCGG	2	8	119992	119999	0 %	0 %	75 %	25 %	103485619
3031	NC_008048	GC	3	6	120015	120020	0 %	0 %	50 %	50 %	103485619
3032	NC_008048	GCA	2	6	120049	120054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3033	NC_008048	GCA	2	6	120091	120096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3034	NC_008048	CGA	2	6	120130	120135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3035	NC_008048	CGT	2	6	120190	120195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3036	NC_008048	GC	4	8	120236	120243	0 %	0 %	50 %	50 %	103485619
3037	NC_008048	TTC	2	6	120267	120272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485619
3038	NC_008048	ATG	2	6	120275	120280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485619
3039	NC_008048	GAT	2	6	120290	120295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485619
3040	NC_008048	GC	3	6	120371	120376	0 %	0 %	50 %	50 %	103485619
3041	NC_008048	CGA	2	6	120388	120393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3042	NC_008048	GCAAG	2	10	120543	120552	40 %	0 %	40 %	20 %	103485619
3043	NC_008048	ACG	2	6	120561	120566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485619
3044	NC_008048	GGC	2	6	120602	120607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485619
3045	NC_008048	CGG	4	12	120616	120627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485619
3046	NC_008048	CGC	3	9	120782	120790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485619
3047	NC_008048	GCAA	2	8	120896	120903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_008048	CCT	2	6	120954	120959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_008048	CAT	2	6	120976	120981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008048	CGC	2	6	121002	121007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_008048	GCG	2	6	121049	121054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008048	CCG	2	6	121066	121071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_008048	TCG	2	6	121126	121131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_008048	TGGGC	2	10	121149	121158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3055	NC_008048	TCCCC	2	10	121225	121234	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3056	NC_008048	AGA	2	6	121247	121252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485620
3057	NC_008048	CGA	2	6	121314	121319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485620
3058	NC_008048	CTG	2	6	121414	121419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485620
3059	NC_008048	CGG	2	6	121431	121436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485620
3060	NC_008048	GATT	2	8	121457	121464	25 %	50 %	25 %	0 %	103485620
3061	NC_008048	TTTC	2	8	121485	121492	0 %	75 %	0 %	25 %	103485620
3062	NC_008048	GCG	2	6	121493	121498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485620
3063	NC_008048	GGC	2	6	121542	121547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485620
3064	NC_008048	GAGC	2	8	121568	121575	25 %	0 %	50 %	25 %	103485620
3065	NC_008048	GCG	2	6	121723	121728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485620
3066	NC_008048	CGA	2	6	121752	121757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485620
3067	NC_008048	ATC	2	6	121813	121818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485620
3068	NC_008048	CGG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485620
3069	NC_008048	GC	3	6	121930	121935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_008048	GCG	2	6	121938	121943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008048	ACCT	2	8	121996	122003	25 %	25 %	0 %	50 %	103485621
3072	NC_008048	GGC	2	6	122062	122067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485621
3073	NC_008048	CTG	2	6	122092	122097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485621
3074	NC_008048	GCG	2	6	122135	122140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485621
3075	NC_008048	CGAC	2	8	122156	122163	25 %	0 %	25 %	50 %	103485621
3076	NC_008048	CGA	2	6	122235	122240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485621
3077	NC_008048	GAT	2	6	122250	122255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485621
3078	NC_008048	CG	3	6	122318	122323	0 %	0 %	50 %	50 %	103485621
3079	NC_008048	GGC	2	6	122329	122334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485621
3080	NC_008048	GAG	2	6	122425	122430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485621
3081	NC_008048	CGG	2	6	122462	122467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485622
3082	NC_008048	CGT	2	6	122510	122515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485622
3083	NC_008048	GCG	3	9	122536	122544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485622
3084	NC_008048	GCAC	2	8	122575	122582	25 %	0 %	25 %	50 %	103485622
3085	NC_008048	GATCA	2	10	122613	122622	40 %	20 %	20 %	20 %	103485622
3086	NC_008048	CCG	2	6	122627	122632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485622
3087	NC_008048	TTC	2	6	122646	122651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485622
3088	NC_008048	CGG	2	6	122696	122701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485622
3089	NC_008048	TAT	2	6	122721	122726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	103485622
3090	NC_008048	CGA	2	6	122729	122734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485622
3091	NC_008048	AGCG	2	8	122804	122811	25 %	0 %	50 %	25 %	103485622
3092	NC_008048	CGGAGC	2	12	122842	122853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	103485622
3093	NC_008048	CG	3	6	122902	122907	0 %	0 %	50 %	50 %	103485622
3094	NC_008048	CGGC	2	8	122926	122933	0 %	0 %	50 %	50 %	103485622
3095	NC_008048	ATGAA	2	10	122963	122972	60 %	20 %	20 %	0 %	103485623
3096	NC_008048	GAT	2	6	123079	123084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485623
3097	NC_008048	TGG	2	6	123117	123122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485623
3098	NC_008048	TCA	2	6	123146	123151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485623
3099	NC_008048	GAT	2	6	123175	123180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485623
3100	NC_008048	TGG	2	6	123182	123187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485623
3101	NC_008048	CGG	2	6	123201	123206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485623
3102	NC_008048	TGC	3	9	123215	123223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485623
3103	NC_008048	CCG	2	6	123257	123262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_008048	GCC	2	6	123295	123300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_008048	GCCC	2	8	123373	123380	0 %	0 %	25 %	75 %	103485624
3106	NC_008048	CGA	2	6	123511	123516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485624
3107	NC_008048	GCCGT	2	10	123518	123527	0 %	20 %	40 %	40 %	103485624
3108	NC_008048	TGC	2	6	123547	123552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485624
3109	NC_008048	AGG	2	6	123648	123653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485624
3110	NC_008048	GCG	2	6	123729	123734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485624
3111	NC_008048	GCG	2	6	123815	123820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485624
3112	NC_008048	GC	3	6	123853	123858	0 %	0 %	50 %	50 %	103485624
3113	NC_008048	TCC	2	6	123902	123907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485624
3114	NC_008048	CAT	2	6	123908	123913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485624
3115	NC_008048	TCAA	2	8	123930	123937	50 %	25 %	0 %	25 %	103485624
3116	NC_008048	GAG	2	6	123953	123958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485624
3117	NC_008048	CGG	2	6	124020	124025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485624
3118	NC_008048	CG	3	6	124035	124040	0 %	0 %	50 %	50 %	103485624
3119	NC_008048	CG	3	6	124047	124052	0 %	0 %	50 %	50 %	103485624
3120	NC_008048	GGC	2	6	124061	124066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485624
3121	NC_008048	AC	3	6	124096	124101	50 %	0 %	0 %	50 %	103485624
3122	NC_008048	CAA	2	6	124150	124155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103485624
3123	NC_008048	GTT	2	6	124198	124203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485624
3124	NC_008048	GCCC	2	8	124361	124368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3125	NC_008048	ATG	2	6	124381	124386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485625
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3151	NC_008048	A	6	6	125623	125628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_008048	GTT	2	6	125655	125660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3154	NC_008048	GCC	2	6	125734	125739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3231	NC_008048	CCGA	2	8	129757	129764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3232	NC_008048	AACG	2	8	129789	129796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3233	NC_008048	ACC	2	6	129835	129840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3234	NC_008048	ATC	2	6	129911	129916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3237	NC_008048	ACC	2	6	130040	130045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485632
3238	NC_008048	CGTC	2	8	130083	130090	0 %	25 %	25 %	50 %	103485632
3239	NC_008048	GCT	2	6	130138	130143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485632
3240	NC_008048	GCG	2	6	130212	130217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485632
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3242	NC_008048	CGT	2	6	130258	130263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485632
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3246	NC_008048	GC	3	6	130562	130567	0 %	0 %	50 %	50 %	103485632
3247	NC_008048	CGG	2	6	130593	130598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485632
3248	NC_008048	CGCA	2	8	130644	130651	25 %	0 %	25 %	50 %	103485632
3249	NC_008048	TGG	2	6	130652	130657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485632
3250	NC_008048	CGA	2	6	130753	130758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485632
3251	NC_008048	TGT	2	6	130765	130770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485632
3252	NC_008048	GCT	2	6	130790	130795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485632
3253	NC_008048	GC	3	6	130801	130806	0 %	0 %	50 %	50 %	103485632
3254	NC_008048	CGA	2	6	130837	130842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485632
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3257	NC_008048	TGG	2	6	130929	130934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485633
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3263	NC_008048	ATG	2	6	131250	131255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485633
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3265	NC_008048	GGC	2	6	131297	131302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485633
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3271	NC_008048	CG	3	6	131518	131523	0 %	0 %	50 %	50 %	103485633
3272	NC_008048	GAT	2	6	131565	131570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485633
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3274	NC_008048	TGT	2	6	131620	131625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485633
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3277	NC_008048	GTGCT	2	10	131683	131692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3278	NC_008048	ACG	2	6	131702	131707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3280	NC_008048	AAGT	2	8	131775	131782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_008048	CGAA	2	8	131802	131809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3282	NC_008048	GT	3	6	131810	131815	0 %	50 %	50 %	0 %	103485634
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3315	NC_008048	GA	3	6	133066	133071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3316	NC_008048	ATA	2	6	133133	133138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3317	NC_008048	AT	3	6	133158	133163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3318	NC_008048	T	6	6	133180	133185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3319	NC_008048	TTC	2	6	133207	133212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3335	NC_008048	GGCCG	2	10	133854	133863	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
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3337	NC_008048	CG	3	6	133914	133919	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
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3343	NC_008048	CCG	2	6	134095	134100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
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3348	NC_008048	GCCC	2	8	134268	134275	0 %	0 %	25 %	75 %	103485636
3349	NC_008048	CAA	2	6	134304	134309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103485636
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3351	NC_008048	CG	3	6	134445	134450	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3352	NC_008048	TCA	2	6	134453	134458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485636
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3354	NC_008048	CGA	2	6	134612	134617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3355	NC_008048	GC	3	6	134626	134631	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3356	NC_008048	GCA	2	6	134640	134645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
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3358	NC_008048	CTCG	2	8	134757	134764	0 %	25 %	25 %	50 %	103485636
3359	NC_008048	TGC	2	6	134784	134789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485636
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3361	NC_008048	GCC	2	6	134809	134814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3362	NC_008048	GC	3	6	134839	134844	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3363	NC_008048	GGAC	2	8	134901	134908	25 %	0 %	50 %	25 %	103485636
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3366	NC_008048	CGAG	2	8	135072	135079	25 %	0 %	50 %	25 %	103485636
3367	NC_008048	GTT	2	6	135118	135123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485636
3368	NC_008048	TGA	2	6	135179	135184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485636
3369	NC_008048	CGC	2	6	135200	135205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3370	NC_008048	GACG	2	8	135223	135230	25 %	0 %	50 %	25 %	103485636
3371	NC_008048	CGA	2	6	135249	135254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3372	NC_008048	GATTT	2	10	135280	135289	20 %	60 %	20 %	0 %	103485636
3373	NC_008048	GTT	2	6	135360	135365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485636
3374	NC_008048	CAG	2	6	135380	135385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
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3387	NC_008048	CGA	2	6	135978	135983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
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3476	NC_008048	GCA	2	6	140542	140547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3478	NC_008048	TTG	2	6	140647	140652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3479	NC_008048	GCC	2	6	140683	140688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3481	NC_008048	CCA	2	6	140736	140741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485641
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3492	NC_008048	GC	3	6	141143	141148	0 %	0 %	50 %	50 %	103485641
3493	NC_008048	TCG	2	6	141179	141184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485641
3494	NC_008048	TGGT	2	8	141188	141195	0 %	50 %	50 %	0 %	103485641
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3496	NC_008048	GCC	3	9	141226	141234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485641
3497	NC_008048	GAC	3	9	141238	141246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485641
3498	NC_008048	CTT	2	6	141247	141252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485641
3499	NC_008048	GCC	2	6	141301	141306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485641
3500	NC_008048	CGC	2	6	141387	141392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485641

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