MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 90652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008048	GACGA	2	10	532598	532607	40 %	0 %	40 %	20 %	103486008
14002	NC_008048	TGA	2	6	532764	532769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486008
14003	NC_008048	CGG	2	6	532788	532793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486008
14004	NC_008048	CGC	3	9	532810	532818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486008
14005	NC_008048	GC	3	6	532856	532861	0 %	0 %	50 %	50 %	103486008
14006	NC_008048	GCTGCC	2	12	532872	532883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	103486009
14007	NC_008048	TGC	2	6	532895	532900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14008	NC_008048	CAT	2	6	532905	532910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486009
14009	NC_008048	GGC	2	6	532911	532916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14010	NC_008048	CGT	2	6	532938	532943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14011	NC_008048	GCC	2	6	532950	532955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486009
14012	NC_008048	CG	3	6	532973	532978	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14013	NC_008048	GCT	2	6	533025	533030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14014	NC_008048	CGC	2	6	533033	533038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486009
14015	NC_008048	GGC	2	6	533039	533044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14016	NC_008048	GC	3	6	533050	533055	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14017	NC_008048	GGA	2	6	533076	533081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486009
14018	NC_008048	CGG	2	6	533097	533102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14019	NC_008048	AGCA	2	8	533131	533138	50 %	0 %	25 %	25 %	103486009
14020	NC_008048	CGA	2	6	533144	533149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14021	NC_008048	GCT	2	6	533154	533159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14022	NC_008048	TGA	2	6	533162	533167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486009
14023	NC_008048	CGG	2	6	533222	533227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14024	NC_008048	CGA	2	6	533235	533240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14025	NC_008048	TCGCGC	2	12	533270	533281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	103486009
14026	NC_008048	GCA	2	6	533295	533300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14027	NC_008048	CGA	2	6	533310	533315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14028	NC_008048	TCG	2	6	533324	533329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
14029	NC_008048	GC	3	6	533351	533356	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14030	NC_008048	GC	3	6	533363	533368	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14031	NC_008048	GGT	2	6	533385	533390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486009
14032	NC_008048	GCC	2	6	533435	533440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486009
14033	NC_008048	GGC	2	6	533472	533477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14034	NC_008048	GC	3	6	533550	533555	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14035	NC_008048	CGCT	2	8	533585	533592	0 %	25 %	25 %	50 %	103486009
14036	NC_008048	GCG	2	6	533661	533666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
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14040	NC_008048	CG	3	6	533800	533805	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14041	NC_008048	GC	3	6	533826	533831	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14042	NC_008048	GC	3	6	533835	533840	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14043	NC_008048	GGC	2	6	533859	533864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486009
14044	NC_008048	GCC	2	6	533901	533906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486009
14045	NC_008048	CCCG	2	8	533913	533920	0 %	0 %	25 %	75 %	103486009
14046	NC_008048	CGT	2	6	533946	533951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
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14052	NC_008048	GC	4	8	534154	534161	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14053	NC_008048	TGC	2	6	534194	534199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486009
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14055	NC_008048	GC	3	6	534250	534255	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14056	NC_008048	GC	4	8	534258	534265	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14057	NC_008048	CGA	2	6	534270	534275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486009
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14064	NC_008048	GGGC	2	8	534451	534458	0 %	0 %	75 %	25 %	103486009
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14083	NC_008048	CG	4	8	535221	535228	0 %	0 %	50 %	50 %	103486009
14084	NC_008048	TGA	2	6	535292	535297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486009
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14088	NC_008048	GC	3	6	535491	535496	0 %	0 %	50 %	50 %	103486010
14089	NC_008048	GGGC	2	8	535519	535526	0 %	0 %	75 %	25 %	103486010
14090	NC_008048	GCG	2	6	535528	535533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486010
14091	NC_008048	TGT	2	6	535716	535721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_008048	GAC	3	9	535872	535880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486011
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14099	NC_008048	GCG	2	6	536089	536094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_008048	TTCG	2	8	536111	536118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14101	NC_008048	TCC	2	6	536135	536140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486012
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14103	NC_008048	GC	3	6	536175	536180	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14104	NC_008048	CGA	2	6	536199	536204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486012
14105	NC_008048	GCT	2	6	536214	536219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486012
14106	NC_008048	CG	3	6	536248	536253	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14107	NC_008048	GCC	2	6	536291	536296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486012
14108	NC_008048	CG	4	8	536298	536305	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14109	NC_008048	GC	4	8	536324	536331	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14110	NC_008048	CGCGG	2	10	536347	536356	0 %	0 %	60 %	40 %	103486012
14111	NC_008048	GC	3	6	536380	536385	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14112	NC_008048	GCC	2	6	536390	536395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486012
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14115	NC_008048	T	6	6	536424	536429	0 %	100 %	0 %	0 %	103486012
14116	NC_008048	CG	4	8	536460	536467	0 %	0 %	50 %	50 %	103486012
14117	NC_008048	TCA	2	6	536484	536489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486012
14118	NC_008048	TCC	2	6	536493	536498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103486013
14119	NC_008048	TCG	2	6	536517	536522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486013
14120	NC_008048	GC	3	6	536576	536581	0 %	0 %	50 %	50 %	103486013
14121	NC_008048	GCA	2	6	536614	536619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486013
14122	NC_008048	GCG	3	9	536637	536645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486013
14123	NC_008048	TCG	2	6	536700	536705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486013
14124	NC_008048	AGC	2	6	536739	536744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486013
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14128	NC_008048	GC	3	6	536796	536801	0 %	0 %	50 %	50 %	103486013
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14130	NC_008048	CGC	2	6	536885	536890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486014
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14136	NC_008048	GC	3	6	537054	537059	0 %	0 %	50 %	50 %	103486014
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14151	NC_008048	TTGC	2	8	537503	537510	0 %	50 %	25 %	25 %	103486015
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14166	NC_008048	AT	3	6	537921	537926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14169	NC_008048	ATCC	2	8	538016	538023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14207	NC_008048	CG	3	6	539437	539442	0 %	0 %	50 %	50 %	103486017
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14215	NC_008048	TGC	2	6	539873	539878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14217	NC_008048	CG	3	6	539999	540004	0 %	0 %	50 %	50 %	103486018
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14230	NC_008048	GCCTT	2	10	540460	540469	0 %	40 %	20 %	40 %	103486018
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14234	NC_008048	CGG	2	6	540643	540648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486018
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14237	NC_008048	GGC	2	6	540740	540745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486018
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14239	NC_008048	TCG	2	6	540967	540972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486018
14240	NC_008048	GC	3	6	540997	541002	0 %	0 %	50 %	50 %	103486018
14241	NC_008048	TGG	2	6	541039	541044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486018
14242	NC_008048	CGA	2	6	541091	541096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14243	NC_008048	AAGG	2	8	541129	541136	50 %	0 %	50 %	0 %	103486019
14244	NC_008048	CGA	2	6	541209	541214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14245	NC_008048	CGA	2	6	541280	541285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14246	NC_008048	GGA	2	6	541299	541304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486019
14247	NC_008048	GCAA	2	8	541336	541343	50 %	0 %	25 %	25 %	103486019
14248	NC_008048	GCCCCC	2	12	541363	541374	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	103486019
14249	NC_008048	CCCGCT	2	12	541399	541410	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	103486019
14250	NC_008048	CGC	2	6	541428	541433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486019
14251	NC_008048	GAC	2	6	541537	541542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14252	NC_008048	GCT	2	6	541605	541610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14253	NC_008048	GC	3	6	541622	541627	0 %	0 %	50 %	50 %	103486019
14254	NC_008048	GCG	2	6	541684	541689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
14255	NC_008048	GGC	2	6	541693	541698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
14256	NC_008048	CAT	2	6	541755	541760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486019
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14258	NC_008048	CGGG	2	8	541790	541797	0 %	0 %	75 %	25 %	103486019
14259	NC_008048	GCG	3	9	541837	541845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
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14261	NC_008048	GC	3	6	541853	541858	0 %	0 %	50 %	50 %	103486019
14262	NC_008048	CGC	2	6	541926	541931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486019
14263	NC_008048	GCT	2	6	541944	541949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14264	NC_008048	GGC	2	6	541953	541958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486019
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14266	NC_008048	GCT	2	6	541998	542003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
14267	NC_008048	GAT	2	6	542035	542040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486019
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14270	NC_008048	CGT	2	6	542094	542099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
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14273	NC_008048	GTC	3	9	542248	542256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486019
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14275	NC_008048	CGA	2	6	542322	542327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486019
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14281	NC_008048	GCGCG	2	10	542610	542619	0 %	0 %	60 %	40 %	103486020
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14286	NC_008048	TGG	2	6	542712	542717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486020
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14295	NC_008048	GGC	2	6	542922	542927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486020
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14300	NC_008048	CTG	2	6	543066	543071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
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14303	NC_008048	TGC	2	6	543139	543144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486020
14304	NC_008048	ATCT	2	8	543215	543222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14305	NC_008048	TCGAT	2	10	543283	543292	20 %	40 %	20 %	20 %	103486021
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14310	NC_008048	CATC	2	8	543455	543462	25 %	25 %	0 %	50 %	103486021
14311	NC_008048	CCG	2	6	543523	543528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486021
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14352	NC_008048	CGA	2	6	545123	545128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486023
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14358	NC_008048	CGG	2	6	545300	545305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486023
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14360	NC_008048	CTT	2	6	545374	545379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14362	NC_008048	GCC	2	6	545589	545594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14363	NC_008048	CAA	2	6	545613	545618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14477	NC_008048	GGC	3	9	549618	549626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14480	NC_008048	CGT	2	6	549727	549732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14483	NC_008048	GCA	2	6	549850	549855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14484	NC_008048	CGG	2	6	549888	549893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14485	NC_008048	GCG	2	6	549896	549901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14486	NC_008048	CGCGG	2	10	549944	549953	0 %	0 %	60 %	40 %	103486027
14487	NC_008048	GAA	2	6	549959	549964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103486027
14488	NC_008048	CCG	2	6	549988	549993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486027
14489	NC_008048	GCG	2	6	550011	550016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486027
14490	NC_008048	CCG	2	6	550059	550064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486027
14491	NC_008048	GCG	2	6	550075	550080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486027
14492	NC_008048	AGC	2	6	550110	550115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486027
14493	NC_008048	CGG	2	6	550117	550122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486027
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14497	NC_008048	CG	3	6	550238	550243	0 %	0 %	50 %	50 %	103486027
14498	NC_008048	GGCG	2	8	550309	550316	0 %	0 %	75 %	25 %	103486027
14499	NC_008048	CGG	2	6	550324	550329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486027
14500	NC_008048	GTCGCG	2	12	550374	550385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	103486028

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