MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 F plasmid

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008036	AACC	2	8	105	112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008036	CTTT	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	98152872
3	NC_008036	CGCC	2	8	844	851	0 %	0 %	25 %	75 %	98152872
4	NC_008036	CTTC	2	8	1066	1073	0 %	50 %	0 %	50 %	98152873
5	NC_008036	GCCG	2	8	1387	1394	0 %	0 %	50 %	50 %	98152873
6	NC_008036	CGAG	2	8	1456	1463	25 %	0 %	50 %	25 %	98152873
7	NC_008036	CGCC	2	8	2134	2141	0 %	0 %	25 %	75 %	98152874
8	NC_008036	CGCC	2	8	2510	2517	0 %	0 %	25 %	75 %	98152874
9	NC_008036	TGCG	2	8	2668	2675	0 %	25 %	50 %	25 %	98152874
10	NC_008036	CGTT	2	8	2848	2855	0 %	50 %	25 %	25 %	98152874
11	NC_008036	GCCT	2	8	4548	4555	0 %	25 %	25 %	50 %	98152874
12	NC_008036	GGCG	2	8	4999	5006	0 %	0 %	75 %	25 %	98152875
13	NC_008036	GCAA	2	8	5085	5092	50 %	0 %	25 %	25 %	98152875
14	NC_008036	CGAA	2	8	5216	5223	50 %	0 %	25 %	25 %	98152876
15	NC_008036	CTGA	2	8	5410	5417	25 %	25 %	25 %	25 %	98152876
16	NC_008036	AAAG	2	8	5424	5431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008036	TCGA	2	8	6751	6758	25 %	25 %	25 %	25 %	98152877
18	NC_008036	GAAC	2	8	7518	7525	50 %	0 %	25 %	25 %	98152878
19	NC_008036	GTCA	2	8	7605	7612	25 %	25 %	25 %	25 %	98152878
20	NC_008036	GCGA	2	8	7755	7762	25 %	0 %	50 %	25 %	98152878
21	NC_008036	CTTC	2	8	7983	7990	0 %	50 %	0 %	50 %	98152878
22	NC_008036	GCTG	2	8	8328	8335	0 %	25 %	50 %	25 %	98152878
23	NC_008036	GTGC	2	8	8911	8918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008036	GTGC	2	8	9109	9116	0 %	25 %	50 %	25 %	98152880
25	NC_008036	TCCT	2	8	9132	9139	0 %	50 %	0 %	50 %	98152880
26	NC_008036	ACCA	2	8	10459	10466	50 %	0 %	0 %	50 %	98152881
27	NC_008036	CCGA	2	8	11383	11390	25 %	0 %	25 %	50 %	98152881
28	NC_008036	GAAG	2	8	13513	13520	50 %	0 %	50 %	0 %	98152886
29	NC_008036	GCTG	2	8	13729	13736	0 %	25 %	50 %	25 %	98152886
30	NC_008036	GATC	2	8	13990	13997	25 %	25 %	25 %	25 %	98152886
31	NC_008036	GCAA	2	8	14499	14506	50 %	0 %	25 %	25 %	98152887
32	NC_008036	GGGC	2	8	14521	14528	0 %	0 %	75 %	25 %	98152887
33	NC_008036	TTGG	2	8	14734	14741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008036	GCTT	2	8	14792	14799	0 %	50 %	25 %	25 %	98152888
35	NC_008036	AGCC	2	8	15109	15116	25 %	0 %	25 %	50 %	98152888
36	NC_008036	GGCC	2	8	15163	15170	0 %	0 %	50 %	50 %	98152888
37	NC_008036	GATG	2	8	15239	15246	25 %	25 %	50 %	0 %	98152888
38	NC_008036	AAAG	2	8	15280	15287	75 %	0 %	25 %	0 %	98152888
39	NC_008036	GGCT	2	8	15401	15408	0 %	25 %	50 %	25 %	98152888
40	NC_008036	AACT	2	8	15420	15427	50 %	25 %	0 %	25 %	98152888
41	NC_008036	TCGC	2	8	15712	15719	0 %	25 %	25 %	50 %	98152889
42	NC_008036	TCCG	2	8	15728	15735	0 %	25 %	25 %	50 %	98152889
43	NC_008036	CTGC	2	8	15876	15883	0 %	25 %	25 %	50 %	98152889
44	NC_008036	GCCA	2	8	16148	16155	25 %	0 %	25 %	50 %	98152889
45	NC_008036	GCCA	2	8	16334	16341	25 %	0 %	25 %	50 %	98152889
46	NC_008036	CTGC	2	8	17058	17065	0 %	25 %	25 %	50 %	98152890
47	NC_008036	GCCT	2	8	17193	17200	0 %	25 %	25 %	50 %	98152890
48	NC_008036	GCTG	2	8	17750	17757	0 %	25 %	50 %	25 %	98152890
49	NC_008036	TCTG	2	8	18118	18125	0 %	50 %	25 %	25 %	98152890
50	NC_008036	CAGC	2	8	18237	18244	25 %	0 %	25 %	50 %	98152890
51	NC_008036	CGCT	2	8	18375	18382	0 %	25 %	25 %	50 %	98152890
52	NC_008036	CGAT	2	8	18658	18665	25 %	25 %	25 %	25 %	98152890
53	NC_008036	GCGG	2	8	18709	18716	0 %	0 %	75 %	25 %	98152890
54	NC_008036	GGGC	2	8	18866	18873	0 %	0 %	75 %	25 %	98152890
55	NC_008036	GGCG	2	8	18907	18914	0 %	0 %	75 %	25 %	98152890
56	NC_008036	TCCA	2	8	19799	19806	25 %	25 %	0 %	50 %	98152892
57	NC_008036	AGGC	2	8	20198	20205	25 %	0 %	50 %	25 %	98152892
58	NC_008036	GCTG	2	8	21005	21012	0 %	25 %	50 %	25 %	98152893
59	NC_008036	TCGG	2	8	21223	21230	0 %	25 %	50 %	25 %	98152893
60	NC_008036	ACGG	2	8	21363	21370	25 %	0 %	50 %	25 %	98152894
61	NC_008036	TTCG	2	8	21954	21961	0 %	50 %	25 %	25 %	98152894
62	NC_008036	GTTC	2	8	22201	22208	0 %	50 %	25 %	25 %	98152894
63	NC_008036	GCTG	2	8	22831	22838	0 %	25 %	50 %	25 %	98152895
64	NC_008036	GCGA	2	8	23263	23270	25 %	0 %	50 %	25 %	98152896
65	NC_008036	GACC	2	8	23316	23323	25 %	0 %	25 %	50 %	98152896
66	NC_008036	GGAA	2	8	23762	23769	50 %	0 %	50 %	0 %	98152897
67	NC_008036	TTGT	2	8	23965	23972	0 %	75 %	25 %	0 %	98152897
68	NC_008036	CCGC	2	8	24187	24194	0 %	0 %	25 %	75 %	98152897
69	NC_008036	TCTT	2	8	24329	24336	0 %	75 %	0 %	25 %	98152898
70	NC_008036	GGCT	2	8	24543	24550	0 %	25 %	50 %	25 %	98152898
71	NC_008036	CGCA	2	8	25013	25020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008036	ATTA	2	8	26327	26334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008036	TAAT	2	8	26559	26566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.