MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 25458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008023	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991498
3	NC_008023	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
4	NC_008023	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
5	NC_008023	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991498
6	NC_008023	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
7	NC_008023	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991498
8	NC_008023	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991498
9	NC_008023	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991498
10	NC_008023	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
11	NC_008023	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991498
12	NC_008023	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991498
13	NC_008023	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
14	NC_008023	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94991498
15	NC_008023	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
16	NC_008023	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
17	NC_008023	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991498
18	NC_008023	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991498
19	NC_008023	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991498
20	NC_008023	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008023	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008023	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008023	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008023	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
25	NC_008023	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991499
26	NC_008023	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
27	NC_008023	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
28	NC_008023	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991499
29	NC_008023	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991499
30	NC_008023	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991499
31	NC_008023	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
32	NC_008023	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
33	NC_008023	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991499
34	NC_008023	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991499
35	NC_008023	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991499
36	NC_008023	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991499
37	NC_008023	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
38	NC_008023	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991499
39	NC_008023	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991499
40	NC_008023	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991499
41	NC_008023	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008023	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008023	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991500
44	NC_008023	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008023	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008023	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008023	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008023	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008023	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
50	NC_008023	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991501
51	NC_008023	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
52	NC_008023	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
53	NC_008023	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991501
54	NC_008023	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991501
55	NC_008023	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
56	NC_008023	AGA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
57	NC_008023	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
58	NC_008023	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
59	NC_008023	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991501
60	NC_008023	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
61	NC_008023	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991501
62	NC_008023	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991501
63	NC_008023	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
64	NC_008023	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
65	NC_008023	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
66	NC_008023	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991501
67	NC_008023	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991501
68	NC_008023	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991502
69	NC_008023	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991502
70	NC_008023	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991502
71	NC_008023	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991502
72	NC_008023	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991502
73	NC_008023	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991502
74	NC_008023	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991502
75	NC_008023	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991502
76	NC_008023	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991502
77	NC_008023	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991502
78	NC_008023	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991502
79	NC_008023	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991502
80	NC_008023	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
81	NC_008023	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94991503
82	NC_008023	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
83	NC_008023	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
84	NC_008023	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
85	NC_008023	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
86	NC_008023	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
87	NC_008023	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991503
88	NC_008023	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
89	NC_008023	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
90	NC_008023	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
91	NC_008023	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
92	NC_008023	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
93	NC_008023	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
94	NC_008023	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
95	NC_008023	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991503
96	NC_008023	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991503
97	NC_008023	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991503
98	NC_008023	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
99	NC_008023	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991503
100	NC_008023	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991503
101	NC_008023	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991503
102	NC_008023	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
103	NC_008023	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
104	NC_008023	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
105	NC_008023	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
106	NC_008023	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
107	NC_008023	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
108	NC_008023	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
109	NC_008023	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991503
110	NC_008023	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
111	NC_008023	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
112	NC_008023	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991503
113	NC_008023	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991503
114	NC_008023	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94991503
115	NC_008023	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
116	NC_008023	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991503
117	NC_008023	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991503
118	NC_008023	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
119	NC_008023	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94991503
120	NC_008023	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
121	NC_008023	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991503
122	NC_008023	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991503
123	NC_008023	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
124	NC_008023	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
125	NC_008023	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991503
126	NC_008023	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008023	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008023	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991504
129	NC_008023	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991504
130	NC_008023	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991504
131	NC_008023	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991504
132	NC_008023	AAT	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991505
133	NC_008023	GAA	4	12	9200	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991505
134	NC_008023	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991505
135	NC_008023	GGT	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991505
136	NC_008023	GAT	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991505
137	NC_008023	ATG	3	9	9499	9507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991505
138	NC_008023	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991506
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142	NC_008023	CTT	3	9	10076	10084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991507
143	NC_008023	TTA	2	6	10140	10145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991507
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