MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008023	TAT	2	6	138935	138940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991626
3002	NC_008023	T	6	6	138971	138976	0 %	100 %	0 %	0 %	94991626
3003	NC_008023	TGGA	2	8	138984	138991	25 %	25 %	50 %	0 %	94991626
3004	NC_008023	A	7	7	138991	138997	100 %	0 %	0 %	0 %	94991626
3005	NC_008023	TGG	2	6	139004	139009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991626
3006	NC_008023	ATT	3	9	139026	139034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991626
3007	NC_008023	TAT	2	6	139142	139147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991626
3008	NC_008023	TTG	3	9	139174	139182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991626
3009	NC_008023	ATC	2	6	139199	139204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991626
3010	NC_008023	CTT	2	6	139276	139281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991626
3011	NC_008023	T	6	6	139297	139302	0 %	100 %	0 %	0 %	94991626
3012	NC_008023	GAAA	2	8	139320	139327	75 %	0 %	25 %	0 %	94991626
3013	NC_008023	TGG	2	6	139415	139420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991626
3014	NC_008023	TGC	2	6	139421	139426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991626
3015	NC_008023	TAT	3	9	139556	139564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991626
3016	NC_008023	AACAA	2	10	139619	139628	80 %	0 %	0 %	20 %	94991626
3017	NC_008023	TAA	2	6	139647	139652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991626
3018	NC_008023	TTGGC	2	10	139704	139713	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3019	NC_008023	AAG	2	6	139769	139774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008023	AC	3	6	139784	139789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_008023	A	6	6	139950	139955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008023	TAG	2	6	139961	139966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008023	AGATAA	2	12	140077	140088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008023	TGA	2	6	140101	140106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991627
3025	NC_008023	A	6	6	140178	140183	100 %	0 %	0 %	0 %	94991627
3026	NC_008023	A	6	6	140196	140201	100 %	0 %	0 %	0 %	94991627
3027	NC_008023	GAA	2	6	140202	140207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991627
3028	NC_008023	AGC	2	6	140215	140220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991627
3029	NC_008023	CTA	2	6	140250	140255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991627
3030	NC_008023	T	6	6	140277	140282	0 %	100 %	0 %	0 %	94991627
3031	NC_008023	A	6	6	140312	140317	100 %	0 %	0 %	0 %	94991627
3032	NC_008023	AGA	2	6	140357	140362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991627
3033	NC_008023	GTT	2	6	140376	140381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991627
3034	NC_008023	GGT	2	6	140399	140404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991627
3035	NC_008023	ATCTTG	2	12	140462	140473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94991628
3036	NC_008023	CAA	2	6	140488	140493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991628
3037	NC_008023	CTA	2	6	140611	140616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991628
3038	NC_008023	GAT	2	6	140617	140622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991628
3039	NC_008023	CAA	2	6	140650	140655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991628
3040	NC_008023	ACC	2	6	140694	140699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94991628
3041	NC_008023	A	6	6	140726	140731	100 %	0 %	0 %	0 %	94991628
3042	NC_008023	GAA	2	6	140758	140763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991628
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3045	NC_008023	ATG	2	6	140800	140805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991628
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3047	NC_008023	CAAAA	2	10	140836	140845	80 %	0 %	0 %	20 %	94991628
3048	NC_008023	T	6	6	140928	140933	0 %	100 %	0 %	0 %	94991628
3049	NC_008023	ATC	2	6	140981	140986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991628
3050	NC_008023	AGC	2	6	140993	140998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991628
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3052	NC_008023	TA	3	6	141113	141118	50 %	50 %	0 %	0 %	94991628
3053	NC_008023	AAC	2	6	141140	141145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991628
3054	NC_008023	CTA	2	6	141196	141201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991628
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3057	NC_008023	T	7	7	141564	141570	0 %	100 %	0 %	0 %	94991628
3058	NC_008023	ATG	2	6	141574	141579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991628
3059	NC_008023	TTG	2	6	141601	141606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991628
3060	NC_008023	T	6	6	141637	141642	0 %	100 %	0 %	0 %	94991628
3061	NC_008023	A	6	6	141650	141655	100 %	0 %	0 %	0 %	94991628
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3063	NC_008023	TTCT	2	8	141726	141733	0 %	75 %	0 %	25 %	94991628
3064	NC_008023	ATT	2	6	141756	141761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991628
3065	NC_008023	GTT	2	6	141793	141798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991628
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3067	NC_008023	TTTTA	2	10	141909	141918	20 %	80 %	0 %	0 %	94991628
3068	NC_008023	CTG	2	6	141925	141930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991628
3069	NC_008023	TTAT	2	8	141931	141938	25 %	75 %	0 %	0 %	94991628
3070	NC_008023	CTTA	2	8	141965	141972	25 %	50 %	0 %	25 %	94991628
3071	NC_008023	GTT	2	6	142021	142026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991628
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3073	NC_008023	TA	3	6	142070	142075	50 %	50 %	0 %	0 %	94991628
3074	NC_008023	CTTA	2	8	142094	142101	25 %	50 %	0 %	25 %	94991628
3075	NC_008023	TTG	2	6	142178	142183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991628
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3082	NC_008023	GGA	2	6	142401	142406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94991628
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3089	NC_008023	AGC	2	6	142822	142827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139138
3090	NC_008023	GTC	2	6	142859	142864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139138
3091	NC_008023	TAAA	2	8	142878	142885	75 %	25 %	0 %	0 %	162139138
3092	NC_008023	A	6	6	142919	142924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008023	AAG	2	6	143012	143017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991630
3094	NC_008023	AAAGC	2	10	143098	143107	60 %	0 %	20 %	20 %	94991630
3095	NC_008023	GCA	3	9	143151	143159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991630
3096	NC_008023	AAGA	2	8	143171	143178	75 %	0 %	25 %	0 %	94991630
3097	NC_008023	CTA	2	6	143185	143190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991630
3098	NC_008023	CTT	2	6	143228	143233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991630
3099	NC_008023	GAA	3	9	143260	143268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991630
3100	NC_008023	T	6	6	143274	143279	0 %	100 %	0 %	0 %	94991630
3101	NC_008023	A	6	6	143333	143338	100 %	0 %	0 %	0 %	94991630
3102	NC_008023	AGTTC	2	10	143348	143357	20 %	40 %	20 %	20 %	94991630
3103	NC_008023	GCTGA	2	10	143368	143377	20 %	20 %	40 %	20 %	94991630
3104	NC_008023	ATT	2	6	143465	143470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991630
3105	NC_008023	AGA	2	6	143502	143507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991630
3106	NC_008023	CAT	2	6	143517	143522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991630
3107	NC_008023	T	6	6	143531	143536	0 %	100 %	0 %	0 %	94991630
3108	NC_008023	AGG	2	6	143546	143551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94991630
3109	NC_008023	ACT	2	6	143587	143592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991631
3110	NC_008023	ACA	2	6	143659	143664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991631
3111	NC_008023	CAGT	2	8	143686	143693	25 %	25 %	25 %	25 %	94991631
3112	NC_008023	ATCT	2	8	143739	143746	25 %	50 %	0 %	25 %	94991631
3113	NC_008023	ATT	2	6	143814	143819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991631
3114	NC_008023	GTT	2	6	143853	143858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991631
3115	NC_008023	AAAGCT	2	12	143860	143871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94991631
3116	NC_008023	TTA	2	6	143893	143898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991631
3117	NC_008023	TGG	2	6	143921	143926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991631
3118	NC_008023	TGA	2	6	143958	143963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991631
3119	NC_008023	GGT	2	6	143976	143981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991631
3120	NC_008023	CAA	2	6	144112	144117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991631
3121	NC_008023	TGAT	2	8	144131	144138	25 %	50 %	25 %	0 %	94991631
3122	NC_008023	ATG	2	6	144196	144201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991631
3123	NC_008023	TTA	2	6	144205	144210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991631
3124	NC_008023	TGA	2	6	144213	144218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991631
3125	NC_008023	GAT	2	6	144256	144261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991631
3126	NC_008023	TGA	2	6	144269	144274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991631
3127	NC_008023	TTG	2	6	144377	144382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991631
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3146	NC_008023	A	6	6	145058	145063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_008023	AGG	2	6	145067	145072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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