MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008023	AATC	2	8	21323	21330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_008023	GGT	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008023	TCG	2	6	21524	21529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008023	CGT	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008023	AGGGA	2	10	21742	21751	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008023	C	6	6	21780	21785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
507	NC_008023	GA	3	6	21828	21833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008023	AGTGTA	2	12	21855	21866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008023	ACTAAT	2	12	21883	21894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
510	NC_008023	CAG	2	6	22045	22050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008023	GCTTA	2	10	22108	22117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_008023	AC	3	6	22121	22126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_008023	AGT	2	6	22302	22307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008023	T	6	6	22312	22317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008023	CGT	2	6	22642	22647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008023	GAG	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008023	T	6	6	22750	22755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008023	CTC	2	6	22821	22826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_008023	AGA	2	6	22918	22923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008023	AAAT	2	8	22995	23002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008023	AG	3	6	23046	23051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008023	GGC	2	6	23078	23083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008023	ACCT	2	8	23169	23176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008023	AG	3	6	23221	23226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008023	CGA	2	6	23323	23328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008023	GCA	2	6	23397	23402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008023	CGC	2	6	23444	23449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008023	GTGA	2	8	23450	23457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008023	TGT	2	6	23483	23488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008023	AGA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008023	ATG	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008023	CCA	2	6	23519	23524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_008023	TAAC	2	8	23533	23540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_008023	CAG	2	6	23566	23571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008023	AGCG	2	8	23621	23628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_008023	T	6	6	23636	23641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008023	AT	3	6	23750	23755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008023	GGA	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008023	CT	3	6	23781	23786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008023	GAA	2	6	24020	24025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008023	GGT	2	6	24094	24099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008023	GTC	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008023	TCGTG	2	10	24117	24126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_008023	CAT	2	6	24176	24181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008023	TAA	2	6	24211	24216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008023	GGA	2	6	24220	24225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008023	ATC	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008023	AC	3	6	24271	24276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008023	TGGT	2	8	24286	24293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008023	CGC	2	6	24410	24415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_008023	AC	3	6	24440	24445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_008023	CAC	2	6	24455	24460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_008023	AGCC	2	8	24503	24510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008023	GAT	2	6	24526	24531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008023	CCT	2	6	24582	24587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_008023	AGG	2	6	24681	24686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008023	CTA	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008023	TG	3	6	24795	24800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008023	AGCG	2	8	24849	24856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008023	TA	3	6	24870	24875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008023	TAA	2	6	24975	24980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008023	A	7	7	24993	24999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008023	TAA	2	6	25006	25011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008023	GTTAA	2	10	25013	25022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008023	GAA	2	6	25059	25064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008023	ACG	2	6	25076	25081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008023	GTAA	2	8	25099	25106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008023	ACTA	2	8	25141	25148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_008023	GAAG	2	8	25181	25188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008023	TAG	2	6	25247	25252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008023	GCGA	2	8	25255	25262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_008023	AGG	2	6	25269	25274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008023	AGA	2	6	25335	25340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008023	AG	3	6	25363	25368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008023	GGA	2	6	25451	25456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008023	CT	3	6	25477	25482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_008023	GGGAG	2	10	25532	25541	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008023	ACA	2	6	25569	25574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008023	ATG	2	6	25636	25641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008023	TGT	2	6	25706	25711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008023	GGA	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008023	TC	3	6	25855	25860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008023	ATC	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_008023	ACC	2	6	26034	26039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008023	AGC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008023	ATTC	2	8	26121	26128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_008023	TG	3	6	26245	26250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008023	AAG	2	6	26251	26256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008023	GAG	2	6	26266	26271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008023	GA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008023	TA	3	6	26450	26455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008023	CTAA	2	8	26477	26484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_008023	TAG	2	6	26579	26584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008023	GA	3	6	26692	26697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008023	CT	3	6	26807	26812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_008023	GAT	2	6	26825	26830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008023	AGG	2	6	26870	26875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008023	CGG	2	6	26916	26921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008023	GA	3	6	27014	27019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008023	TAGG	2	8	27132	27139	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008023	GTT	2	6	27176	27181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008023	TAC	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008023	CCT	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_008023	TTGG	2	8	27315	27322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008023	AATC	2	8	27324	27331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_008023	GGT	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008023	TCG	2	6	27525	27530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008023	CGT	2	6	27605	27610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008023	AGGGA	2	10	27743	27752	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008023	C	6	6	27781	27786	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
611	NC_008023	GA	3	6	27829	27834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008023	AGTGTA	2	12	27856	27867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008023	ACTAAT	2	12	27884	27895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_008023	CAG	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008023	GCTTA	2	10	28109	28118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
616	NC_008023	AC	3	6	28122	28127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_008023	AGT	2	6	28303	28308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008023	T	6	6	28313	28318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008023	CGT	2	6	28643	28648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008023	GAG	2	6	28657	28662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008023	T	6	6	28751	28756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008023	CTC	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_008023	CGC	2	6	28988	28993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_008023	TAT	2	6	28994	28999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008023	ATT	2	6	29104	29109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008023	GGA	2	6	29112	29117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008023	GCGT	2	8	29171	29178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_008023	TCC	2	6	29195	29200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008023	TCG	2	6	29235	29240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008023	GTT	2	6	29299	29304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_008023	CGG	2	6	29352	29357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008023	TGT	2	6	29429	29434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008023	GGT	2	6	29509	29514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008023	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008023	AT	4	8	29568	29575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008023	AGA	2	6	29736	29741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008023	T	8	8	29753	29760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008023	ATT	2	6	29802	29807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008023	ACT	2	6	29835	29840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_008023	GTT	2	6	29880	29885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008023	AGT	2	6	29909	29914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_008023	TTTTC	2	10	29941	29950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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