MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 26497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008022	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008022	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989510
3	NC_008022	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
4	NC_008022	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
5	NC_008022	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989510
6	NC_008022	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
7	NC_008022	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989510
8	NC_008022	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989510
9	NC_008022	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989510
10	NC_008022	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989510
11	NC_008022	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989510
12	NC_008022	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
13	NC_008022	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94989510
14	NC_008022	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
15	NC_008022	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
16	NC_008022	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989510
17	NC_008022	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989510
18	NC_008022	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989510
19	NC_008022	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008022	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008022	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008022	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008022	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
24	NC_008022	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989511
25	NC_008022	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
26	NC_008022	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
27	NC_008022	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989511
28	NC_008022	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989511
29	NC_008022	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989511
30	NC_008022	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
31	NC_008022	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
32	NC_008022	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989511
33	NC_008022	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989511
34	NC_008022	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989511
35	NC_008022	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989511
36	NC_008022	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
37	NC_008022	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989511
38	NC_008022	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989511
39	NC_008022	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989511
40	NC_008022	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008022	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008022	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989512
43	NC_008022	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008022	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008022	TCT	2	6	3372	3377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008022	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008022	TAA	2	6	3411	3416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008022	CAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
49	NC_008022	GCT	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989513
50	NC_008022	TGA	3	9	3769	3777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
51	NC_008022	AGA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
52	NC_008022	GTT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989513
53	NC_008022	AAC	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989513
54	NC_008022	AGT	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
55	NC_008022	AGA	3	9	4192	4200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
56	NC_008022	AGA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
57	NC_008022	AGC	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
58	NC_008022	ATC	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989513
59	NC_008022	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
60	NC_008022	GCT	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989513
61	NC_008022	TAT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989513
62	NC_008022	ATG	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
63	NC_008022	AAG	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
64	NC_008022	GAA	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
65	NC_008022	TGT	2	6	4519	4524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989513
66	NC_008022	CAT	2	6	4537	4542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989513
67	NC_008022	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989514
68	NC_008022	TTG	2	6	4647	4652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989514
69	NC_008022	GAT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989514
70	NC_008022	TTA	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989514
71	NC_008022	CTA	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989514
72	NC_008022	AAT	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989514
73	NC_008022	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989514
74	NC_008022	ATG	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989514
75	NC_008022	CAG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989514
76	NC_008022	GAC	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989514
77	NC_008022	TTA	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989514
78	NC_008022	ATA	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989514
79	NC_008022	ATT	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
80	NC_008022	ACC	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94989515
81	NC_008022	GAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
82	NC_008022	TGA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
83	NC_008022	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
84	NC_008022	TTA	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
85	NC_008022	GAT	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
86	NC_008022	AAC	2	6	5849	5854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
87	NC_008022	TTA	2	6	5867	5872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
88	NC_008022	GAT	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
89	NC_008022	AGA	2	6	5976	5981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
90	NC_008022	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
91	NC_008022	ATT	2	6	6063	6068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
92	NC_008022	GAT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
93	NC_008022	AGA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
94	NC_008022	ACT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989515
95	NC_008022	CTT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989515
96	NC_008022	AAC	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
97	NC_008022	TGA	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
98	NC_008022	ACG	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989515
99	NC_008022	CTG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989515
100	NC_008022	CAA	2	6	6864	6869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
101	NC_008022	TGA	2	6	6933	6938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
102	NC_008022	AAG	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
103	NC_008022	GAT	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
104	NC_008022	TGA	3	9	7017	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
105	NC_008022	AGA	2	6	7044	7049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
106	NC_008022	TAG	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
107	NC_008022	AGC	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989515
108	NC_008022	CAG	2	6	7225	7230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989515
109	NC_008022	GTA	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
110	NC_008022	ATT	2	6	7354	7359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
111	NC_008022	AAC	2	6	7430	7435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
112	NC_008022	AAT	2	6	7615	7620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989515
113	NC_008022	GGA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989515
114	NC_008022	ATG	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
115	NC_008022	CAA	3	9	7838	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
116	NC_008022	GAA	2	6	7949	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
117	NC_008022	GAG	2	6	8096	8101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989515
118	NC_008022	GAT	2	6	8266	8271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
119	NC_008022	AAT	2	6	8470	8475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989515
120	NC_008022	CTT	2	6	8501	8506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989515
121	NC_008022	ATT	2	6	8528	8533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
122	NC_008022	AGA	2	6	8637	8642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
123	NC_008022	ATA	2	6	8706	8711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989515
124	NC_008022	AAC	2	6	8718	8723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008022	TGC	2	6	8797	8802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008022	TTA	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989516
127	NC_008022	CGT	2	6	8913	8918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989516
128	NC_008022	AAG	2	6	8929	8934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989516
129	NC_008022	GAA	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989516
130	NC_008022	AAT	2	6	9157	9162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989517
131	NC_008022	GAA	4	12	9199	9210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989517
132	NC_008022	ATG	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989517
133	NC_008022	GGT	2	6	9327	9332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989517
134	NC_008022	GAT	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989517
135	NC_008022	ATG	3	9	9498	9506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989517
136	NC_008022	AGA	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989518
137	NC_008022	ATT	2	6	9644	9649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989519
138	NC_008022	CTT	3	9	10075	10083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989519
139	NC_008022	TTA	2	6	10139	10144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989519
140	NC_008022	TGA	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989519
141	NC_008022	AAG	2	6	10174	10179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989519
142	NC_008022	ATA	2	6	10237	10242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989519
143	NC_008022	ATT	2	6	10249	10254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989519
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147	NC_008022	CAA	2	6	10524	10529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989519
148	NC_008022	TTA	2	6	10559	10564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989519
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154	NC_008022	ATT	2	6	10704	10709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989519
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156	NC_008022	ATG	2	6	10919	10924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989519
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160	NC_008022	TAT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989520
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165	NC_008022	TAC	2	6	11605	11610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989520
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167	NC_008022	ATT	2	6	11722	11727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989520
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257	NC_008022	ATC	2	6	18238	18243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008022	CGC	2	6	18404	18409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_008022	CAC	2	6	18449	18454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_008022	GAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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