MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 41330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008022	TTGA	2	8	138901	138908	25 %	50 %	25 %	0 %	94989634
3002	NC_008022	TGG	2	6	138965	138970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008022	ATT	3	9	138985	138993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989635
3004	NC_008022	CTC	2	6	139049	139054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94989635
3005	NC_008022	T	6	6	139101	139106	0 %	100 %	0 %	0 %	94989635
3006	NC_008022	T	7	7	139128	139134	0 %	100 %	0 %	0 %	94989635
3007	NC_008022	GCT	3	9	139201	139209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989635
3008	NC_008022	GT	3	6	139232	139237	0 %	50 %	50 %	0 %	94989635
3009	NC_008022	TAT	2	6	139284	139289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989635
3010	NC_008022	T	6	6	139320	139325	0 %	100 %	0 %	0 %	94989635
3011	NC_008022	TGGA	2	8	139333	139340	25 %	25 %	50 %	0 %	94989635
3012	NC_008022	A	7	7	139340	139346	100 %	0 %	0 %	0 %	94989635
3013	NC_008022	TGG	2	6	139353	139358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989635
3014	NC_008022	ATT	3	9	139375	139383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989635
3015	NC_008022	TAT	2	6	139491	139496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989635
3016	NC_008022	TTG	3	9	139523	139531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989635
3017	NC_008022	ATC	2	6	139548	139553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989635
3018	NC_008022	CTT	2	6	139625	139630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989635
3019	NC_008022	T	6	6	139646	139651	0 %	100 %	0 %	0 %	94989635
3020	NC_008022	GAAA	2	8	139669	139676	75 %	0 %	25 %	0 %	94989635
3021	NC_008022	TGG	2	6	139764	139769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989635
3022	NC_008022	TGC	2	6	139770	139775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989635
3023	NC_008022	TAT	3	9	139905	139913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989635
3024	NC_008022	AACAA	2	10	139968	139977	80 %	0 %	0 %	20 %	94989635
3025	NC_008022	TAA	2	6	139996	140001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989635
3026	NC_008022	TTGGC	2	10	140053	140062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_008022	AAG	2	6	140118	140123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008022	AC	3	6	140133	140138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_008022	A	6	6	140299	140304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008022	TAG	2	6	140310	140315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008022	AGATAA	2	12	140426	140437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008022	TGA	2	6	140450	140455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989636
3033	NC_008022	A	6	6	140527	140532	100 %	0 %	0 %	0 %	94989636
3034	NC_008022	A	6	6	140545	140550	100 %	0 %	0 %	0 %	94989636
3035	NC_008022	GAA	2	6	140551	140556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989636
3036	NC_008022	AGC	2	6	140564	140569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989636
3037	NC_008022	CTA	2	6	140599	140604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989636
3038	NC_008022	T	6	6	140626	140631	0 %	100 %	0 %	0 %	94989636
3039	NC_008022	A	6	6	140661	140666	100 %	0 %	0 %	0 %	94989636
3040	NC_008022	AGCT	2	8	140684	140691	25 %	25 %	25 %	25 %	94989636
3041	NC_008022	AGA	2	6	140706	140711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989636
3042	NC_008022	GTT	2	6	140725	140730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989636
3043	NC_008022	GGT	2	6	140748	140753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989636
3044	NC_008022	ATCTTG	2	12	140811	140822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94989637
3045	NC_008022	CAA	2	6	140837	140842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989637
3046	NC_008022	CTA	2	6	140960	140965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989637
3047	NC_008022	GAT	2	6	140966	140971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989637
3048	NC_008022	CAA	2	6	140999	141004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989637
3049	NC_008022	ACC	2	6	141043	141048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94989637
3050	NC_008022	A	6	6	141075	141080	100 %	0 %	0 %	0 %	94989637
3051	NC_008022	GAA	2	6	141107	141112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989637
3052	NC_008022	ACA	2	6	141121	141126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989637
3053	NC_008022	AGC	2	6	141127	141132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3054	NC_008022	ATG	2	6	141149	141154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989637
3055	NC_008022	AGC	2	6	141177	141182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3056	NC_008022	CAAAA	2	10	141185	141194	80 %	0 %	0 %	20 %	94989637
3057	NC_008022	T	6	6	141277	141282	0 %	100 %	0 %	0 %	94989637
3058	NC_008022	ATC	2	6	141330	141335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989637
3059	NC_008022	AGC	2	6	141342	141347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3060	NC_008022	GTCTT	2	10	141396	141405	0 %	60 %	20 %	20 %	94989637
3061	NC_008022	TTA	2	6	141458	141463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989637
3062	NC_008022	TA	3	6	141462	141467	50 %	50 %	0 %	0 %	94989637
3063	NC_008022	AGC	2	6	141471	141476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3064	NC_008022	AAC	2	6	141489	141494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989637
3065	NC_008022	CTA	2	6	141545	141550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989637
3066	NC_008022	GCA	2	6	141628	141633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3067	NC_008022	T	6	6	141889	141894	0 %	100 %	0 %	0 %	94989637
3068	NC_008022	T	7	7	141913	141919	0 %	100 %	0 %	0 %	94989637
3069	NC_008022	ATG	2	6	141923	141928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989637
3070	NC_008022	TTG	2	6	141950	141955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989637
3071	NC_008022	T	6	6	141986	141991	0 %	100 %	0 %	0 %	94989637
3072	NC_008022	A	6	6	141999	142004	100 %	0 %	0 %	0 %	94989637
3073	NC_008022	CTT	2	6	142024	142029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989637
3074	NC_008022	TTCT	2	8	142075	142082	0 %	75 %	0 %	25 %	94989637
3075	NC_008022	ATT	2	6	142105	142110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989637
3076	NC_008022	GTT	2	6	142142	142147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989637
3077	NC_008022	CAA	2	6	142202	142207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989637
3078	NC_008022	TTTTA	2	10	142258	142267	20 %	80 %	0 %	0 %	94989637
3079	NC_008022	CTG	2	6	142274	142279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989637
3080	NC_008022	TTAT	2	8	142280	142287	25 %	75 %	0 %	0 %	94989637
3081	NC_008022	CTTA	2	8	142314	142321	25 %	50 %	0 %	25 %	94989637
3082	NC_008022	GTT	2	6	142370	142375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989637
3083	NC_008022	AAAAGC	2	12	142385	142396	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94989637
3084	NC_008022	TA	3	6	142419	142424	50 %	50 %	0 %	0 %	94989637
3085	NC_008022	CTTA	2	8	142443	142450	25 %	50 %	0 %	25 %	94989637
3086	NC_008022	TTG	2	6	142527	142532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989637
3087	NC_008022	CCA	2	6	142541	142546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94989637
3088	NC_008022	TTTATT	2	12	142571	142582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	94989637
3089	NC_008022	T	6	6	142658	142663	0 %	100 %	0 %	0 %	94989637
3090	NC_008022	GGA	2	6	142682	142687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989637
3091	NC_008022	ATGTCA	2	12	142722	142733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94989637
3092	NC_008022	GAA	2	6	142736	142741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989637
3093	NC_008022	GGA	2	6	142750	142755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989637
3094	NC_008022	ATT	2	6	142780	142785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527103354
3095	NC_008022	TGG	2	6	142796	142801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527103354
3096	NC_008022	TTC	2	6	142806	142811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527103354
3097	NC_008022	GGT	2	6	142878	142883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527103354
3098	NC_008022	AGA	2	6	142907	142912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527103354
3099	NC_008022	TTG	2	6	143071	143076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527103354
3100	NC_008022	AGC	2	6	143171	143176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527103354
3101	NC_008022	GTC	2	6	143208	143213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527103354
3102	NC_008022	TAAA	2	8	143227	143234	75 %	25 %	0 %	0 %	527103354
3103	NC_008022	A	6	6	143268	143273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008022	CAC	2	6	143280	143285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_008022	AAG	2	6	143361	143366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989639
3106	NC_008022	AAAGC	2	10	143447	143456	60 %	0 %	20 %	20 %	94989639
3107	NC_008022	GCA	3	9	143500	143508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989639
3108	NC_008022	AAGA	2	8	143520	143527	75 %	0 %	25 %	0 %	94989639
3109	NC_008022	CTA	2	6	143534	143539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989639
3110	NC_008022	CTT	2	6	143577	143582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989639
3111	NC_008022	GAA	3	9	143609	143617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989639
3112	NC_008022	T	6	6	143623	143628	0 %	100 %	0 %	0 %	94989639
3113	NC_008022	A	6	6	143682	143687	100 %	0 %	0 %	0 %	94989639
3114	NC_008022	AGTTC	2	10	143697	143706	20 %	40 %	20 %	20 %	94989639
3115	NC_008022	GCTGA	2	10	143717	143726	20 %	20 %	40 %	20 %	94989639
3116	NC_008022	ATT	2	6	143814	143819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989639
3117	NC_008022	AGA	2	6	143851	143856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989639
3118	NC_008022	CAT	2	6	143866	143871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989639
3119	NC_008022	T	6	6	143880	143885	0 %	100 %	0 %	0 %	94989639
3120	NC_008022	AGG	2	6	143895	143900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989639
3121	NC_008022	ACT	2	6	143936	143941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989640
3122	NC_008022	ACA	2	6	144008	144013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989640
3123	NC_008022	CAGT	2	8	144035	144042	25 %	25 %	25 %	25 %	94989640
3124	NC_008022	ATCT	2	8	144088	144095	25 %	50 %	0 %	25 %	94989640
3125	NC_008022	ATT	2	6	144163	144168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989640
3126	NC_008022	GTT	2	6	144202	144207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989640
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3155	NC_008022	A	6	6	145407	145412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_008022	TAT	2	6	150117	150122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989645
3251	NC_008022	CTG	2	6	150138	150143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989645
3252	NC_008022	TCT	2	6	150167	150172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989645
3253	NC_008022	T	6	6	150204	150209	0 %	100 %	0 %	0 %	94989645
3254	NC_008022	GAA	2	6	150276	150281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989645
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3257	NC_008022	CAG	2	6	150444	150449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989645
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3291	NC_008022	A	7	7	151761	151767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_008022	CAG	2	6	154748	154753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3373	NC_008022	TAT	2	6	154764	154769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_008022	A	9	9	154801	154809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_008022	TGT	2	6	160098	160103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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