MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 1392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94987633
2	NC_008021	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94987634
3	NC_008021	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94987635
4	NC_008021	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94987637
5	NC_008021	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	94987642
6	NC_008021	TTTAT	2	10	15287	15296	20 %	80 %	0 %	0 %	94987645
7	NC_008021	TACAC	2	10	15916	15925	40 %	20 %	0 %	40 %	94987645
8	NC_008021	TAAAT	2	10	15926	15935	60 %	40 %	0 %	0 %	94987645
9	NC_008021	ACATT	2	10	16493	16502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008021	TCGTG	2	10	18114	18123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008021	GTTAA	2	10	19010	19019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008021	GGGAG	2	10	19529	19538	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008021	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008021	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008021	TCGTG	2	10	24115	24124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008021	GTTAA	2	10	25011	25020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008021	GGGAG	2	10	25530	25539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008021	AGGGA	2	10	27741	27750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008021	GCTTA	2	10	28107	28116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008021	TTTTC	2	10	29939	29948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008021	CTTTT	2	10	30047	30056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008021	TATAA	2	10	32160	32169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008021	AGTGA	2	10	32907	32916	40 %	20 %	40 %	0 %	94987649
24	NC_008021	ATTTT	2	10	33606	33615	20 %	80 %	0 %	0 %	94987650
25	NC_008021	TTGAT	2	10	33795	33804	20 %	60 %	20 %	0 %	94987650
26	NC_008021	TGGTG	2	10	35879	35888	0 %	40 %	60 %	0 %	94987653
27	NC_008021	AGCAG	2	10	43154	43163	40 %	0 %	40 %	20 %	94987657
28	NC_008021	GGTCA	2	10	43518	43527	20 %	20 %	40 %	20 %	94987657
29	NC_008021	TTGGG	2	10	43914	43923	0 %	40 %	60 %	0 %	94987658
30	NC_008021	GCAGG	2	10	47994	48003	20 %	0 %	60 %	20 %	94987660
31	NC_008021	CTCAG	2	10	49351	49360	20 %	20 %	20 %	40 %	94987662
32	NC_008021	TACTA	2	10	50989	50998	40 %	40 %	0 %	20 %	94987663
33	NC_008021	AAATT	2	10	51282	51291	60 %	40 %	0 %	0 %	94987664
34	NC_008021	CAAAT	2	10	51496	51505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008021	TCGGA	2	10	54256	54265	20 %	20 %	40 %	20 %	94987667
36	NC_008021	GCTTT	2	10	57002	57011	0 %	60 %	20 %	20 %	94987670
37	NC_008021	TTTTC	2	10	57200	57209	0 %	80 %	0 %	20 %	94987670
38	NC_008021	AAACC	2	10	57265	57274	60 %	0 %	0 %	40 %	94987670
39	NC_008021	ATGGT	2	10	59039	59048	20 %	40 %	40 %	0 %	94987671
40	NC_008021	ATTCA	2	10	59723	59732	40 %	40 %	0 %	20 %	94987671
41	NC_008021	ATTTT	2	10	60988	60997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008021	AAATA	2	10	62255	62264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008021	TATAT	2	10	62340	62349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008021	TTTTA	2	10	63494	63503	20 %	80 %	0 %	0 %	94987673
45	NC_008021	AAAGC	2	10	63687	63696	60 %	0 %	20 %	20 %	94987673
46	NC_008021	TTTGG	2	10	67682	67691	0 %	60 %	40 %	0 %	94987680
47	NC_008021	TTCAC	2	10	68038	68047	20 %	40 %	0 %	40 %	94987681
48	NC_008021	GAAAT	2	10	69119	69128	60 %	20 %	20 %	0 %	94987683
49	NC_008021	AAGGA	2	10	70199	70208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008021	TCCAA	2	10	74819	74828	40 %	20 %	0 %	40 %	162139091
51	NC_008021	GTTTC	2	10	77468	77477	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008021	TCGTG	2	10	80726	80735	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008021	GTTAA	2	10	81622	81631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008021	GGGAG	2	10	82141	82150	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008021	AGGGA	2	10	84352	84361	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008021	GCTTA	2	10	84718	84727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008021	ATTAT	2	10	85008	85017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008021	TATAT	2	10	85091	85100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008021	CTTGG	2	10	89027	89036	0 %	40 %	40 %	20 %	94987710
60	NC_008021	TCTTA	2	10	89445	89454	20 %	60 %	0 %	20 %	94987710
61	NC_008021	CACTC	2	10	90990	90999	20 %	20 %	0 %	60 %	94987712
62	NC_008021	GATTG	2	10	93251	93260	20 %	40 %	40 %	0 %	94987713
63	NC_008021	TTGAT	2	10	103418	103427	20 %	60 %	20 %	0 %	94987719
64	NC_008021	AAATC	2	10	103586	103595	60 %	20 %	0 %	20 %	94987719
65	NC_008021	TGAAG	2	10	108902	108911	40 %	20 %	40 %	0 %	94987728
66	NC_008021	AGAAA	2	10	110343	110352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008021	TTTAG	2	10	110612	110621	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008021	TTTAG	2	10	110761	110770	20 %	60 %	20 %	0 %	94987731
69	NC_008021	GTGTT	2	10	115165	115174	0 %	60 %	40 %	0 %	94987737
70	NC_008021	TTAAG	2	10	115365	115374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008021	TAGGT	2	10	115988	115997	20 %	40 %	40 %	0 %	94987738
72	NC_008021	TAAAT	2	10	116121	116130	60 %	40 %	0 %	0 %	94987738
73	NC_008021	AAATC	2	10	116998	117007	60 %	20 %	0 %	20 %	94987738
74	NC_008021	GAGAG	2	10	117160	117169	40 %	0 %	60 %	0 %	94987739
75	NC_008021	TAAAA	2	10	120770	120779	80 %	20 %	0 %	0 %	94987742
76	NC_008021	GACCT	2	10	129187	129196	20 %	20 %	20 %	40 %	94987748
77	NC_008021	TCAGG	2	10	130492	130501	20 %	20 %	40 %	20 %	94987748
78	NC_008021	TTTTA	2	10	132375	132384	20 %	80 %	0 %	0 %	94987750
79	NC_008021	GCTTT	3	15	132951	132965	0 %	60 %	20 %	20 %	94987750
80	NC_008021	GTCAT	2	10	133270	133279	20 %	40 %	20 %	20 %	94987750
81	NC_008021	TAGTG	2	10	134213	134222	20 %	40 %	40 %	0 %	94987751
82	NC_008021	GTTAA	2	10	134616	134625	40 %	40 %	20 %	0 %	94987751
83	NC_008021	AATAA	2	10	134645	134654	80 %	20 %	0 %	0 %	94987751
84	NC_008021	TTGAT	2	10	135732	135741	20 %	60 %	20 %	0 %	94987752
85	NC_008021	TACCT	2	10	137135	137144	20 %	40 %	0 %	40 %	94987754
86	NC_008021	AATCA	2	10	137914	137923	60 %	20 %	0 %	20 %	94987755
87	NC_008021	TCATG	2	10	138521	138530	20 %	40 %	20 %	20 %	94987756
88	NC_008021	AACAA	2	10	139667	139676	80 %	0 %	0 %	20 %	94987757
89	NC_008021	TTGGC	2	10	139752	139761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008021	CAAAA	2	10	140884	140893	80 %	0 %	0 %	20 %	94987759
91	NC_008021	TTTTA	2	10	141957	141966	20 %	80 %	0 %	0 %	94987759
92	NC_008021	AAAGC	2	10	143146	143155	60 %	0 %	20 %	20 %	94987761
93	NC_008021	AGTTC	2	10	143396	143405	20 %	40 %	20 %	20 %	94987761
94	NC_008021	GCTGA	2	10	143416	143425	20 %	20 %	40 %	20 %	94987761
95	NC_008021	AAGGA	2	10	144996	145005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008021	ATCGC	2	10	146790	146799	20 %	20 %	20 %	40 %	94987764
97	NC_008021	TTGGG	2	10	148193	148202	0 %	40 %	60 %	0 %	94987765
98	NC_008021	TCGCT	2	10	148479	148488	0 %	40 %	20 %	40 %	94987766
99	NC_008021	GAAAA	2	10	153503	153512	80 %	0 %	20 %	0 %	94987770
100	NC_008021	GGATT	2	10	153620	153629	20 %	40 %	40 %	0 %	94987770
101	NC_008021	TTTTG	2	10	154140	154149	0 %	80 %	20 %	0 %	94987770
102	NC_008021	TCATG	2	10	155645	155654	20 %	40 %	20 %	20 %	94987772
103	NC_008021	GTATC	2	10	156906	156915	20 %	40 %	20 %	20 %	94987773
104	NC_008021	GTCGC	2	10	157345	157354	0 %	20 %	40 %	40 %	94987774
105	NC_008021	AAGCT	2	10	159198	159207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008021	AAGCA	2	10	159245	159254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008021	CTTTT	2	10	160386	160395	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008021	ATTAT	2	10	160717	160726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008021	CTTGT	2	10	162719	162728	0 %	60 %	20 %	20 %	94987779
110	NC_008021	GCAAC	2	10	163652	163661	40 %	0 %	20 %	40 %	94987780
111	NC_008021	AAGGT	2	10	165334	165343	40 %	20 %	40 %	0 %	94987780
112	NC_008021	CGTCA	2	10	165531	165540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008021	AACAA	2	10	167270	167279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008021	ATTTG	2	10	171618	171627	20 %	60 %	20 %	0 %	94987788
115	NC_008021	CAAGA	2	10	173540	173549	60 %	0 %	20 %	20 %	94987789
116	NC_008021	TTTGG	2	10	174708	174717	0 %	60 %	40 %	0 %	94987790
117	NC_008021	TGGAT	2	10	175657	175666	20 %	40 %	40 %	0 %	94987791
118	NC_008021	TTGCC	2	10	176032	176041	0 %	40 %	20 %	40 %	94987791
119	NC_008021	ACCTA	2	10	176738	176747	40 %	20 %	0 %	40 %	94987791
120	NC_008021	ATTTT	2	10	181603	181612	20 %	80 %	0 %	0 %	94987795
121	NC_008021	AAAAG	2	10	181767	181776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008021	TCTAT	2	10	182591	182600	20 %	60 %	0 %	20 %	94987796
123	NC_008021	GTTTG	2	10	183131	183140	0 %	60 %	40 %	0 %	94987796
124	NC_008021	TGAAA	2	10	183306	183315	60 %	20 %	20 %	0 %	94987797
125	NC_008021	TTGAT	2	10	183554	183563	20 %	60 %	20 %	0 %	94987797
126	NC_008021	TAGGT	2	10	184524	184533	20 %	40 %	40 %	0 %	94987800
127	NC_008021	CCAAA	2	10	185901	185910	60 %	0 %	0 %	40 %	94987802
128	NC_008021	TCCCA	2	10	186103	186112	20 %	20 %	0 %	60 %	94987802
129	NC_008021	GCCAA	2	10	186950	186959	40 %	0 %	20 %	40 %	94987803
130	NC_008021	GGAAA	2	10	189900	189909	60 %	0 %	40 %	0 %	94987806
131	NC_008021	TAATC	2	10	192726	192735	40 %	40 %	0 %	20 %	94987810
132	NC_008021	TCTAA	2	10	197335	197344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008021	TTTAC	2	10	198184	198193	20 %	60 %	0 %	20 %	94987815
134	NC_008021	CAAAC	2	10	200706	200715	60 %	0 %	0 %	40 %	94987819
135	NC_008021	AGATA	2	10	200820	200829	60 %	20 %	20 %	0 %	94987819
136	NC_008021	ATATA	2	10	201609	201618	60 %	40 %	0 %	0 %	94987819
137	NC_008021	TTAAA	2	10	202120	202129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008021	TTTTG	2	10	206821	206830	0 %	80 %	20 %	0 %	94987826
139	NC_008021	ATCGC	2	10	208139	208148	20 %	20 %	20 %	40 %	94987828
140	NC_008021	TTTTA	2	10	209307	209316	20 %	80 %	0 %	0 %	94987829
141	NC_008021	CTAAT	2	10	209545	209554	40 %	40 %	0 %	20 %	94987829
142	NC_008021	GAATG	2	10	210068	210077	40 %	20 %	40 %	0 %	94987829
143	NC_008021	TGTCT	2	10	212562	212571	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008021	TAAGA	2	10	214080	214089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008021	CCTTC	2	10	214495	214504	0 %	40 %	0 %	60 %	94987833
146	NC_008021	TAAGA	2	10	214540	214549	60 %	20 %	20 %	0 %	94987833
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150	NC_008021	GAGAA	2	10	218170	218179	60 %	0 %	40 %	0 %	94987836
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156	NC_008021	CTCAT	2	10	226418	226427	20 %	40 %	0 %	40 %	94987846
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162	NC_008021	GTTCA	2	10	234438	234447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_008021	AAAAG	2	10	277003	277012	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_008021	ATTTT	2	10	292544	292553	20 %	80 %	0 %	0 %	94987906
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265	NC_008021	TGTTT	2	10	364665	364674	0 %	80 %	20 %	0 %	94987986
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267	NC_008021	GGCAT	2	10	365452	365461	20 %	20 %	40 %	20 %	94987987
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270	NC_008021	TTTAG	2	10	368309	368318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_008021	TATAG	2	10	368376	368385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_008021	ATGTG	2	10	369052	369061	20 %	40 %	40 %	0 %	94987992
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