MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 25180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008021	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
3	NC_008021	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
4	NC_008021	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
5	NC_008021	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987632
6	NC_008021	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
7	NC_008021	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
8	NC_008021	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987632
9	NC_008021	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987632
10	NC_008021	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
11	NC_008021	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
12	NC_008021	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
13	NC_008021	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
14	NC_008021	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987632
15	NC_008021	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987632
16	NC_008021	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987632
17	NC_008021	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987632
18	NC_008021	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987632
19	NC_008021	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987632
20	NC_008021	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008021	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008021	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008021	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008021	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
25	NC_008021	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987633
26	NC_008021	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
27	NC_008021	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
28	NC_008021	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987633
29	NC_008021	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
30	NC_008021	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
31	NC_008021	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
32	NC_008021	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
33	NC_008021	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987633
34	NC_008021	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
35	NC_008021	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987633
36	NC_008021	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987633
37	NC_008021	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987633
38	NC_008021	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987633
39	NC_008021	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987633
40	NC_008021	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987633
41	NC_008021	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008021	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008021	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987634
44	NC_008021	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008021	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008021	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008021	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008021	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008021	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
50	NC_008021	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
51	NC_008021	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
52	NC_008021	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
53	NC_008021	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
54	NC_008021	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987635
55	NC_008021	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
56	NC_008021	AGA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
57	NC_008021	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
58	NC_008021	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
59	NC_008021	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
60	NC_008021	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987635
61	NC_008021	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987635
62	NC_008021	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987635
63	NC_008021	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987635
64	NC_008021	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
65	NC_008021	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987635
66	NC_008021	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987635
67	NC_008021	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987635
68	NC_008021	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987636
69	NC_008021	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987636
70	NC_008021	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
71	NC_008021	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
72	NC_008021	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
73	NC_008021	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
74	NC_008021	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987636
75	NC_008021	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987636
76	NC_008021	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
77	NC_008021	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987636
78	NC_008021	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987636
79	NC_008021	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987636
80	NC_008021	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
81	NC_008021	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987637
82	NC_008021	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
83	NC_008021	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
84	NC_008021	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
85	NC_008021	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
86	NC_008021	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
87	NC_008021	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
88	NC_008021	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
89	NC_008021	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
90	NC_008021	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
91	NC_008021	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
92	NC_008021	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
93	NC_008021	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
94	NC_008021	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
95	NC_008021	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987637
96	NC_008021	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987637
97	NC_008021	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
98	NC_008021	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
99	NC_008021	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987637
100	NC_008021	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987637
101	NC_008021	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
102	NC_008021	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
103	NC_008021	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
104	NC_008021	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
105	NC_008021	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
106	NC_008021	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
107	NC_008021	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
108	NC_008021	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
109	NC_008021	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987637
110	NC_008021	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
111	NC_008021	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
112	NC_008021	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
113	NC_008021	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
114	NC_008021	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987637
115	NC_008021	TAA	2	6	7687	7692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
116	NC_008021	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
117	NC_008021	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987637
118	NC_008021	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987637
119	NC_008021	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
120	NC_008021	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987637
121	NC_008021	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987637
122	NC_008021	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
123	NC_008021	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987637
124	NC_008021	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987637
125	NC_008021	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987637
126	NC_008021	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987637
127	NC_008021	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008021	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008021	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987638
130	NC_008021	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987638
131	NC_008021	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987638
132	NC_008021	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987638
133	NC_008021	AAT	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987639
134	NC_008021	GAA	4	12	9200	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987639
135	NC_008021	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987639
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137	NC_008021	GAT	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987639
138	NC_008021	ATG	3	9	9499	9507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987639
139	NC_008021	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987640
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141	NC_008021	CAG	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987641
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143	NC_008021	CTT	3	9	10076	10084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987641
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258	NC_008021	GGA	2	6	17753	17758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_008021	GTC	2	6	18105	18110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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