MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 39161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_008021	TGC	2	6	185915	185920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987802
4003	NC_008021	GGT	2	6	185934	185939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987802
4004	NC_008021	TGG	2	6	185964	185969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987802
4005	NC_008021	TTC	2	6	185996	186001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987802
4006	NC_008021	ATA	2	6	186026	186031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987802
4007	NC_008021	TCCCA	2	10	186103	186112	20 %	20 %	0 %	60 %	94987802
4008	NC_008021	CCT	2	6	186169	186174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987802
4009	NC_008021	TAG	2	6	186266	186271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987802
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4011	NC_008021	GTT	2	6	186397	186402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987802
4012	NC_008021	AG	4	8	186416	186423	50 %	0 %	50 %	0 %	94987802
4013	NC_008021	A	6	6	186438	186443	100 %	0 %	0 %	0 %	94987802
4014	NC_008021	GAA	2	6	186464	186469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987802
4015	NC_008021	CAG	2	6	186528	186533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987802
4016	NC_008021	ATT	3	9	186589	186597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987802
4017	NC_008021	TTAG	2	8	186620	186627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008021	ACC	2	6	186665	186670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_008021	TAT	2	6	186692	186697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008021	A	7	7	186702	186708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008021	TTG	2	6	186727	186732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008021	GAT	2	6	186871	186876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987803
4023	NC_008021	AGC	2	6	186885	186890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987803
4024	NC_008021	ATC	2	6	186941	186946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987803
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4030	NC_008021	GAT	2	6	187222	187227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987803
4031	NC_008021	ATC	2	6	187313	187318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987803
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4033	NC_008021	GTGGAA	2	12	187435	187446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	94987803
4034	NC_008021	TGC	3	9	187452	187460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987803
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4036	NC_008021	GCG	3	9	187471	187479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94987803
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4039	NC_008021	ACCT	2	8	187687	187694	25 %	25 %	0 %	50 %	94987803
4040	NC_008021	AACT	2	8	187716	187723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_008021	TTA	2	6	187820	187825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008021	A	6	6	187849	187854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008021	GAA	2	6	187906	187911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008021	GTTT	2	8	187914	187921	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008021	TCA	2	6	187936	187941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_008021	AATC	2	8	187948	187955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_008021	ATT	2	6	188003	188008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987804
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4059	NC_008021	TAA	2	6	188424	188429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987804
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4073	NC_008021	AT	3	6	189234	189239	50 %	50 %	0 %	0 %	94987805
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4109	NC_008021	TGG	2	6	190753	190758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987808
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4122	NC_008021	GTG	2	6	191304	191309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987808
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4126	NC_008021	TAT	2	6	191575	191580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987808
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4252	NC_008021	AAAT	2	8	198093	198100	75 %	25 %	0 %	0 %	94987815
4253	NC_008021	GTT	2	6	198160	198165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987815
4254	NC_008021	A	6	6	198171	198176	100 %	0 %	0 %	0 %	94987815
4255	NC_008021	TTTAC	2	10	198184	198193	20 %	60 %	0 %	20 %	94987815
4256	NC_008021	CTA	2	6	198287	198292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987815
4257	NC_008021	ATTT	2	8	198317	198324	25 %	75 %	0 %	0 %	94987815
4258	NC_008021	GAT	2	6	198331	198336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987815
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4262	NC_008021	AGTA	2	8	198502	198509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_008021	AAG	2	6	198515	198520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_008021	TTA	2	6	198647	198652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_008021	T	6	6	198674	198679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_008021	A	6	6	198719	198724	100 %	0 %	0 %	0 %	94987817
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4271	NC_008021	A	6	6	198790	198795	100 %	0 %	0 %	0 %	94987817
4272	NC_008021	TAGA	2	8	198841	198848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_008021	ATT	2	6	198916	198921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987818
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4344	NC_008021	TAA	2	6	201917	201922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987819
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4349	NC_008021	ATA	2	6	202089	202094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987819
4350	NC_008021	TC	3	6	202113	202118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4351	NC_008021	TTAAA	2	10	202120	202129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_008021	TA	3	6	202141	202146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_008021	ATC	2	6	202212	202217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4354	NC_008021	AGC	2	6	202222	202227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4355	NC_008021	TCA	2	6	202233	202238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4356	NC_008021	GATT	2	8	202242	202249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_008021	GA	3	6	202274	202279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4358	NC_008021	TTTAAA	2	12	202322	202333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4359	NC_008021	AGGG	2	8	202370	202377	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_008021	AAG	2	6	202383	202388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_008021	T	6	6	202542	202547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_008021	GA	3	6	202548	202553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_008021	GAA	2	6	202577	202582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_008021	ATCA	2	8	202620	202627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4365	NC_008021	AGT	2	6	202629	202634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_008021	GAT	2	6	202657	202662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987820
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4368	NC_008021	TGA	2	6	202681	202686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987820
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4370	NC_008021	ATGA	2	8	202817	202824	50 %	25 %	25 %	0 %	94987820
4371	NC_008021	TCA	2	6	202969	202974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987820
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4373	NC_008021	TCA	2	6	203062	203067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987820
4374	NC_008021	GAG	2	6	203093	203098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987820
4375	NC_008021	TTG	2	6	203112	203117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987820
4376	NC_008021	ATG	2	6	203265	203270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987820
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