MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 39161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008021	AATC	2	8	21321	21328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_008021	GGT	2	6	21407	21412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008021	TCG	2	6	21522	21527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008021	CGT	2	6	21602	21607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008021	AGGGA	2	10	21740	21749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008021	C	6	6	21778	21783	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
507	NC_008021	GA	3	6	21826	21831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008021	AGTGTA	2	12	21853	21864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008021	ACTAAT	2	12	21881	21892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
510	NC_008021	CAG	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008021	GCTTA	2	10	22106	22115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_008021	AC	3	6	22119	22124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_008021	AGT	2	6	22300	22305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008021	T	6	6	22310	22315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008021	CGT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008021	GAG	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008021	T	6	6	22748	22753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008021	CTC	2	6	22819	22824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_008021	AGA	2	6	22916	22921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008021	AAAT	2	8	22993	23000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008021	AG	3	6	23044	23049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008021	GGC	2	6	23076	23081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008021	ACCT	2	8	23167	23174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008021	AG	3	6	23219	23224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008021	CGA	2	6	23321	23326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008021	GCA	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008021	CGC	2	6	23442	23447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_008021	GTGA	2	8	23448	23455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008021	TGT	2	6	23481	23486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008021	AGA	2	6	23490	23495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008021	ATG	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008021	CCA	2	6	23517	23522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_008021	TAAC	2	8	23531	23538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_008021	CAG	2	6	23564	23569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008021	AGCG	2	8	23619	23626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_008021	T	6	6	23634	23639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008021	AT	3	6	23748	23753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008021	GGA	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008021	CT	3	6	23779	23784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008021	GAA	2	6	24018	24023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008021	GGT	2	6	24092	24097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008021	GTC	2	6	24106	24111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008021	TCGTG	2	10	24115	24124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_008021	CAT	2	6	24174	24179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008021	TAA	2	6	24209	24214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008021	GGA	2	6	24218	24223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008021	ATC	2	6	24242	24247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008021	AC	3	6	24269	24274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008021	TGGT	2	8	24284	24291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008021	CGC	2	6	24408	24413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_008021	AC	3	6	24438	24443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_008021	CAC	2	6	24453	24458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_008021	AGCC	2	8	24501	24508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008021	GAT	2	6	24524	24529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008021	CCT	2	6	24580	24585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_008021	AGG	2	6	24679	24684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008021	CTA	2	6	24725	24730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008021	TG	3	6	24793	24798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008021	AGCG	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008021	TA	3	6	24868	24873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008021	TAA	2	6	24973	24978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008021	A	7	7	24991	24997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008021	TAA	2	6	25004	25009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008021	GTTAA	2	10	25011	25020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008021	GAA	2	6	25057	25062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008021	ACG	2	6	25074	25079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008021	GTAA	2	8	25097	25104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008021	ACTA	2	8	25139	25146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_008021	GAAG	2	8	25179	25186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008021	TAG	2	6	25245	25250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008021	GCGA	2	8	25253	25260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_008021	AGG	2	6	25267	25272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008021	AGA	2	6	25333	25338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008021	AG	3	6	25361	25366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008021	GGA	2	6	25449	25454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008021	CT	3	6	25475	25480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_008021	GGGAG	2	10	25530	25539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008021	ACA	2	6	25567	25572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008021	ATG	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008021	TGT	2	6	25704	25709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008021	GGA	2	6	25767	25772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008021	TC	3	6	25853	25858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_008021	ATC	2	6	25974	25979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_008021	ACC	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008021	AGC	2	6	26112	26117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008021	ATTC	2	8	26119	26126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_008021	TG	3	6	26243	26248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008021	AAG	2	6	26249	26254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008021	GAG	2	6	26264	26269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_008021	GA	3	6	26394	26399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008021	TA	3	6	26448	26453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008021	CTAA	2	8	26475	26482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_008021	TAG	2	6	26577	26582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008021	GA	3	6	26690	26695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008021	CT	3	6	26805	26810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_008021	GAT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008021	AGG	2	6	26868	26873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008021	CGG	2	6	26914	26919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008021	GA	3	6	27012	27017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008021	TAGG	2	8	27130	27137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008021	TAC	2	6	27184	27189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_008021	CCT	2	6	27272	27277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_008021	TTGG	2	8	27313	27320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008021	AATC	2	8	27322	27329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_008021	GGT	2	6	27408	27413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008021	TCG	2	6	27523	27528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008021	CGT	2	6	27603	27608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008021	AGGGA	2	10	27741	27750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008021	C	6	6	27779	27784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
610	NC_008021	GA	3	6	27827	27832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008021	AGTGTA	2	12	27854	27865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008021	ACTAAT	2	12	27882	27893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_008021	CAG	2	6	28044	28049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_008021	GCTTA	2	10	28107	28116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
615	NC_008021	AC	3	6	28120	28125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_008021	AGT	2	6	28301	28306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008021	T	6	6	28311	28316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008021	CGT	2	6	28641	28646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008021	GAG	2	6	28655	28660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008021	T	6	6	28749	28754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008021	CTC	2	6	28820	28825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_008021	CGC	2	6	28986	28991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_008021	TAT	2	6	28992	28997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008021	ATT	2	6	29102	29107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008021	GGA	2	6	29110	29115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008021	GCGT	2	8	29169	29176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_008021	TCC	2	6	29193	29198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_008021	TCG	2	6	29233	29238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_008021	GTT	2	6	29297	29302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008021	CGG	2	6	29350	29355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_008021	TGT	2	6	29427	29432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008021	GGT	2	6	29507	29512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008021	GGT	2	6	29542	29547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008021	AT	4	8	29566	29573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008021	AGA	2	6	29734	29739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008021	T	8	8	29751	29758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008021	ATT	2	6	29800	29805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008021	ACT	2	6	29833	29838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_008021	GTT	2	6	29878	29883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008021	AGT	2	6	29907	29912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008021	TTTTC	2	10	29939	29948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
642	NC_008021	AAT	2	6	30010	30015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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