MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 39161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008021	A	6	6	231929	231934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008021	TAA	2	6	232036	232041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987852
5003	NC_008021	CAT	2	6	232042	232047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987852
5004	NC_008021	ACTA	2	8	232066	232073	50 %	25 %	0 %	25 %	94987852
5005	NC_008021	GAA	2	6	232127	232132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987852
5006	NC_008021	CTA	2	6	232242	232247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987852
5007	NC_008021	GAG	2	6	232292	232297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987852
5008	NC_008021	TC	3	6	232305	232310	0 %	50 %	0 %	50 %	94987852
5009	NC_008021	TAT	2	6	232358	232363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987852
5010	NC_008021	TGGA	2	8	232364	232371	25 %	25 %	50 %	0 %	94987852
5011	NC_008021	TCA	2	6	232485	232490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987852
5012	NC_008021	AGC	2	6	232492	232497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987852
5013	NC_008021	CAT	2	6	232519	232524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987852
5014	NC_008021	ATG	2	6	232577	232582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987852
5015	NC_008021	GCAGC	2	10	232634	232643	20 %	0 %	40 %	40 %	94987852
5016	NC_008021	TGG	2	6	232665	232670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987852
5017	NC_008021	CAAA	2	8	232711	232718	75 %	0 %	0 %	25 %	94987852
5018	NC_008021	GAA	2	6	232781	232786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987852
5019	NC_008021	A	6	6	232837	232842	100 %	0 %	0 %	0 %	94987852
5020	NC_008021	TTG	2	6	232861	232866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987853
5021	NC_008021	GAC	2	6	232878	232883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987853
5022	NC_008021	GAA	2	6	232947	232952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987853
5023	NC_008021	GTG	2	6	232987	232992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987853
5024	NC_008021	ATG	3	9	233191	233199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987853
5025	NC_008021	AAC	2	6	233320	233325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987853
5026	NC_008021	ATT	2	6	233342	233347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987853
5027	NC_008021	GAA	2	6	233370	233375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987853
5028	NC_008021	GAG	2	6	233391	233396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987853
5029	NC_008021	AATAA	2	10	233407	233416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008021	A	6	6	233450	233455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008021	AAG	2	6	233480	233485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_008021	AGA	2	6	233501	233506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987854
5033	NC_008021	AT	3	6	233509	233514	50 %	50 %	0 %	0 %	94987854
5034	NC_008021	TGC	2	6	233713	233718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987854
5035	NC_008021	TGA	2	6	233740	233745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987854
5036	NC_008021	TCAA	2	8	233802	233809	50 %	25 %	0 %	25 %	94987854
5037	NC_008021	GGT	2	6	233875	233880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987854
5038	NC_008021	TAC	2	6	233894	233899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987854
5039	NC_008021	TTGA	2	8	233924	233931	25 %	50 %	25 %	0 %	94987854
5040	NC_008021	ATTCC	2	10	233939	233948	20 %	40 %	0 %	40 %	94987854
5041	NC_008021	ATG	2	6	233963	233968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987854
5042	NC_008021	TTGA	2	8	234149	234156	25 %	50 %	25 %	0 %	94987854
5043	NC_008021	TCG	2	6	234208	234213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987854
5044	NC_008021	GTG	2	6	234318	234323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987854
5045	NC_008021	AAG	2	6	234369	234374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987854
5046	NC_008021	A	7	7	234407	234413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008021	GTTCA	2	10	234438	234447	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5048	NC_008021	T	6	6	234501	234506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008021	A	6	6	234517	234522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008021	TCT	2	6	234587	234592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008021	A	6	6	234618	234623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008021	TCA	2	6	234624	234629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_008021	T	6	6	234716	234721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_008021	ATA	2	6	234773	234778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008021	TTA	2	6	234782	234787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008021	TAG	2	6	234788	234793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008021	CTGG	2	8	234833	234840	0 %	25 %	50 %	25 %	94987855
5058	NC_008021	TTA	2	6	234844	234849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987855
5059	NC_008021	CAG	2	6	234945	234950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987855
5060	NC_008021	CCT	2	6	235010	235015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987855
5061	NC_008021	TTA	2	6	235041	235046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987855
5062	NC_008021	TCT	2	6	235078	235083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987855
5063	NC_008021	CTTG	2	8	235099	235106	0 %	50 %	25 %	25 %	94987855
5064	NC_008021	CTTG	2	8	235124	235131	0 %	50 %	25 %	25 %	94987855
5065	NC_008021	TTA	2	6	235176	235181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987856
5066	NC_008021	GAG	2	6	235191	235196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94987856
5067	NC_008021	TTG	2	6	235260	235265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987856
5068	NC_008021	CAC	2	6	235400	235405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987856
5069	NC_008021	TCA	2	6	235464	235469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987856
5070	NC_008021	TACCCA	2	12	235559	235570	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	94987856
5071	NC_008021	CGT	2	6	235668	235673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987856
5072	NC_008021	A	6	6	235683	235688	100 %	0 %	0 %	0 %	94987856
5073	NC_008021	AAAG	2	8	235696	235703	75 %	0 %	25 %	0 %	94987856
5074	NC_008021	AGC	2	6	235748	235753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987857
5075	NC_008021	AGCT	2	8	235777	235784	25 %	25 %	25 %	25 %	94987857
5076	NC_008021	GAA	2	6	235791	235796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987857
5077	NC_008021	ATGG	2	8	235827	235834	25 %	25 %	50 %	0 %	94987857
5078	NC_008021	TGT	2	6	235868	235873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987857
5079	NC_008021	TGG	2	6	235921	235926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987857
5080	NC_008021	CA	3	6	235986	235991	50 %	0 %	0 %	50 %	94987857
5081	NC_008021	A	6	6	236023	236028	100 %	0 %	0 %	0 %	94987857
5082	NC_008021	TCTT	2	8	236403	236410	0 %	75 %	0 %	25 %	94987858
5083	NC_008021	ATT	2	6	236429	236434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987858
5084	NC_008021	AAG	2	6	236522	236527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987858
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5086	NC_008021	A	7	7	236579	236585	100 %	0 %	0 %	0 %	94987858
5087	NC_008021	ACC	2	6	236678	236683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987858
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5089	NC_008021	TACC	2	8	236769	236776	25 %	25 %	0 %	50 %	94987858
5090	NC_008021	AAG	3	9	236804	236812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987858
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5092	NC_008021	AGTT	2	8	236949	236956	25 %	50 %	25 %	0 %	94987858
5093	NC_008021	ATT	3	9	236974	236982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987858
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5095	NC_008021	CAA	2	6	237167	237172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987859
5096	NC_008021	TGA	2	6	237192	237197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987859
5097	NC_008021	ACA	2	6	237202	237207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987859
5098	NC_008021	CAA	2	6	237221	237226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987859
5099	NC_008021	TAG	2	6	237268	237273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987859
5100	NC_008021	A	6	6	237297	237302	100 %	0 %	0 %	0 %	94987859
5101	NC_008021	CAG	2	6	237308	237313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987859
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5104	NC_008021	GAA	2	6	237395	237400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987859
5105	NC_008021	A	6	6	237406	237411	100 %	0 %	0 %	0 %	94987859
5106	NC_008021	GGC	2	6	237680	237685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94987859
5107	NC_008021	TACC	2	8	237692	237699	25 %	25 %	0 %	50 %	94987859
5108	NC_008021	ATT	2	6	237726	237731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987859
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5110	NC_008021	AGC	2	6	237799	237804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987859
5111	NC_008021	C	6	6	237847	237852	0 %	0 %	0 %	100 %	94987859
5112	NC_008021	GAC	2	6	237856	237861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987859
5113	NC_008021	CTTT	2	8	237924	237931	0 %	75 %	0 %	25 %	94987859
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5117	NC_008021	TGA	2	6	238042	238047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987859
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5121	NC_008021	CAA	2	6	238221	238226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987859
5122	NC_008021	TC	3	6	238229	238234	0 %	50 %	0 %	50 %	94987859
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5126	NC_008021	TTA	2	6	238360	238365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987860
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