MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella denitrificans OS217

Total Repeats: 2821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007954	CATTT	2	10	3267	3276	20 %	60 %	0 %	20 %	91791372
2	NC_007954	ATGGT	2	10	5810	5819	20 %	40 %	40 %	0 %	91791373
3	NC_007954	ATAAA	2	10	7232	7241	80 %	20 %	0 %	0 %	91791374
4	NC_007954	TGGTT	2	10	8189	8198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007954	CCTTG	2	10	12705	12714	0 %	40 %	20 %	40 %	91791377
6	NC_007954	ATGGC	2	10	13469	13478	20 %	20 %	40 %	20 %	91791378
7	NC_007954	AACGA	2	10	13909	13918	60 %	0 %	20 %	20 %	91791378
8	NC_007954	TATGC	2	10	14860	14869	20 %	40 %	20 %	20 %	91791379
9	NC_007954	GAGTC	2	10	17070	17079	20 %	20 %	40 %	20 %	91791380
10	NC_007954	AAATT	2	10	19239	19248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007954	TTCAA	2	10	19433	19442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007954	CGCAT	2	10	20964	20973	20 %	20 %	20 %	40 %	162210779
13	NC_007954	AAGTT	2	10	25026	25035	40 %	40 %	20 %	0 %	91791386
14	NC_007954	ATTTT	2	10	25185	25194	20 %	80 %	0 %	0 %	91791386
15	NC_007954	GCTGT	2	10	25687	25696	0 %	40 %	40 %	20 %	91791387
16	NC_007954	AACTT	2	10	28536	28545	40 %	40 %	0 %	20 %	91791390
17	NC_007954	ACGAG	2	10	29063	29072	40 %	0 %	40 %	20 %	91791391
18	NC_007954	TTGTC	2	10	29093	29102	0 %	60 %	20 %	20 %	91791391
19	NC_007954	GCGCC	2	10	30929	30938	0 %	0 %	40 %	60 %	91791392
20	NC_007954	AATCG	2	10	33685	33694	40 %	20 %	20 %	20 %	91791395
21	NC_007954	CCAAT	2	10	34665	34674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007954	GAAAC	2	10	36486	36495	60 %	0 %	20 %	20 %	91791399
23	NC_007954	GTTTG	2	10	36715	36724	0 %	60 %	40 %	0 %	91791399
24	NC_007954	ATTGG	2	10	37245	37254	20 %	40 %	40 %	0 %	91791400
25	NC_007954	AATGA	2	10	37906	37915	60 %	20 %	20 %	0 %	91791401
26	NC_007954	TATGA	2	10	40910	40919	40 %	40 %	20 %	0 %	91791403
27	NC_007954	TAGCT	2	10	41448	41457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007954	AGTCG	2	10	45761	45770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007954	AGGCT	2	10	46090	46099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007954	TTCAA	2	10	48308	48317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007954	AAGGT	2	10	49912	49921	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007954	GAATG	2	10	54339	54348	40 %	20 %	40 %	0 %	91791409
33	NC_007954	TTATT	2	10	56903	56912	20 %	80 %	0 %	0 %	91791413
34	NC_007954	TCAGT	2	10	57849	57858	20 %	40 %	20 %	20 %	91791413
35	NC_007954	CAGAT	2	10	59170	59179	40 %	20 %	20 %	20 %	91791414
36	NC_007954	GCAAA	2	10	59492	59501	60 %	0 %	20 %	20 %	91791415
37	NC_007954	AAGTT	2	10	66297	66306	40 %	40 %	20 %	0 %	91791425
38	NC_007954	TACTT	2	10	66616	66625	20 %	60 %	0 %	20 %	91791425
39	NC_007954	AATTT	2	10	67674	67683	40 %	60 %	0 %	0 %	91791426
40	NC_007954	AATTA	2	10	68737	68746	60 %	40 %	0 %	0 %	91791428
41	NC_007954	GCAGA	2	10	70507	70516	40 %	0 %	40 %	20 %	91791430
42	NC_007954	ATTGA	2	10	71016	71025	40 %	40 %	20 %	0 %	91791431
43	NC_007954	TTCAT	2	10	71888	71897	20 %	60 %	0 %	20 %	91791432
44	NC_007954	TGTAC	2	10	74963	74972	20 %	40 %	20 %	20 %	91791436
45	NC_007954	TGGCT	2	10	75323	75332	0 %	40 %	40 %	20 %	91791437
46	NC_007954	ATTTA	2	10	77423	77432	40 %	60 %	0 %	0 %	91791439
47	NC_007954	TGCTG	2	10	77801	77810	0 %	40 %	40 %	20 %	91791439
48	NC_007954	AAGGT	2	10	78552	78561	40 %	20 %	40 %	0 %	91791440
49	NC_007954	TTGGT	2	10	78664	78673	0 %	60 %	40 %	0 %	91791440
50	NC_007954	ATAGC	2	10	79386	79395	40 %	20 %	20 %	20 %	91791441
51	NC_007954	CTGTG	2	10	80430	80439	0 %	40 %	40 %	20 %	91791441
52	NC_007954	TCTTT	2	10	81156	81165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007954	GCCTT	2	10	82514	82523	0 %	40 %	20 %	40 %	91791444
54	NC_007954	CGTTT	2	10	82880	82889	0 %	60 %	20 %	20 %	91791444
55	NC_007954	ATTTT	2	10	83486	83495	20 %	80 %	0 %	0 %	91791445
56	NC_007954	AAATA	2	10	86312	86321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007954	AAGGC	2	10	86931	86940	40 %	0 %	40 %	20 %	91791446
58	NC_007954	ATCGT	2	10	87554	87563	20 %	40 %	20 %	20 %	91791447
59	NC_007954	CACTG	2	10	93804	93813	20 %	20 %	20 %	40 %	91791453
60	NC_007954	CGCTG	2	10	94046	94055	0 %	20 %	40 %	40 %	91791453
61	NC_007954	AATTG	2	10	94521	94530	40 %	40 %	20 %	0 %	91791453
62	NC_007954	GGGTT	2	10	95579	95588	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007954	TTCAA	2	10	96933	96942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007954	CTGTG	2	10	102495	102504	0 %	40 %	40 %	20 %	91791460
65	NC_007954	ATTCT	2	10	110485	110494	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007954	GTAGA	2	10	111835	111844	40 %	20 %	40 %	0 %	91791468
67	NC_007954	TTTTG	2	10	111870	111879	0 %	80 %	20 %	0 %	91791468
68	NC_007954	GCGCT	2	10	112412	112421	0 %	20 %	40 %	40 %	91791468
69	NC_007954	TACCT	2	10	114451	114460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007954	ATTTT	2	10	116310	116319	20 %	80 %	0 %	0 %	91791472
71	NC_007954	TGGTG	2	10	118382	118391	0 %	40 %	60 %	0 %	91791475
72	NC_007954	AATTC	2	10	122294	122303	40 %	40 %	0 %	20 %	91791479
73	NC_007954	AAACC	2	10	123198	123207	60 %	0 %	0 %	40 %	91791481
74	NC_007954	TAGAT	2	10	123971	123980	40 %	40 %	20 %	0 %	91791482
75	NC_007954	TAAGG	2	10	125240	125249	40 %	20 %	40 %	0 %	91791483
76	NC_007954	TCACA	2	10	131358	131367	40 %	20 %	0 %	40 %	91791490
77	NC_007954	CAAAC	2	10	135950	135959	60 %	0 %	0 %	40 %	91791492
78	NC_007954	TGAGT	2	10	139642	139651	20 %	40 %	40 %	0 %	91791498
79	NC_007954	TGCCT	2	10	140074	140083	0 %	40 %	20 %	40 %	91791498
80	NC_007954	TGGTT	2	10	143865	143874	0 %	60 %	40 %	0 %	91791501
81	NC_007954	TAACA	2	10	146079	146088	60 %	20 %	0 %	20 %	91791501
82	NC_007954	AAATG	2	10	146781	146790	60 %	20 %	20 %	0 %	91791501
83	NC_007954	TTAAT	2	10	147819	147828	40 %	60 %	0 %	0 %	91791502
84	NC_007954	GCGTT	2	10	150544	150553	0 %	40 %	40 %	20 %	91791505
85	NC_007954	ATTTT	2	10	151690	151699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007954	GGCAT	2	10	152540	152549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007954	TAGGA	2	10	152940	152949	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007954	CTGCA	2	10	154277	154286	20 %	20 %	20 %	40 %	91791506
89	NC_007954	AACCA	2	10	154340	154349	60 %	0 %	0 %	40 %	91791506
90	NC_007954	AATTA	2	10	154621	154630	60 %	40 %	0 %	0 %	91791506
91	NC_007954	CTTAT	2	10	155168	155177	20 %	60 %	0 %	20 %	91791506
92	NC_007954	CAAGC	2	10	156298	156307	40 %	0 %	20 %	40 %	91791506
93	NC_007954	TGGCT	2	10	159386	159395	0 %	40 %	40 %	20 %	91791506
94	NC_007954	CAAAC	2	10	159757	159766	60 %	0 %	0 %	40 %	91791506
95	NC_007954	GCGTT	2	10	160444	160453	0 %	40 %	40 %	20 %	91791506
96	NC_007954	ATCAA	2	10	161279	161288	60 %	20 %	0 %	20 %	91791506
97	NC_007954	TTTTA	2	10	161532	161541	20 %	80 %	0 %	0 %	91791507
98	NC_007954	AAATG	2	10	165211	165220	60 %	20 %	20 %	0 %	91791513
99	NC_007954	AGCTC	2	10	166082	166091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007954	CTTTA	2	10	169618	169627	20 %	60 %	0 %	20 %	91791518
101	NC_007954	ACTGT	2	10	170516	170525	20 %	40 %	20 %	20 %	91791518
102	NC_007954	GCGCC	2	10	175416	175425	0 %	0 %	40 %	60 %	91791522
103	NC_007954	TTTGA	2	10	181735	181744	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007954	GTTTG	2	10	181879	181888	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007954	CGTAG	2	10	184453	184462	20 %	20 %	40 %	20 %	91791532
106	NC_007954	CAATT	2	10	188540	188549	40 %	40 %	0 %	20 %	91791533
107	NC_007954	CTTAT	2	10	188961	188970	20 %	60 %	0 %	20 %	91791533
108	NC_007954	GAAAA	2	10	192223	192232	80 %	0 %	20 %	0 %	91791535
109	NC_007954	GTTCT	2	10	192706	192715	0 %	60 %	20 %	20 %	91791536
110	NC_007954	TGGCG	2	10	197535	197544	0 %	20 %	60 %	20 %	91791540
111	NC_007954	ATCCA	2	10	198565	198574	40 %	20 %	0 %	40 %	91791542
112	NC_007954	AGGCA	2	10	202044	202053	40 %	0 %	40 %	20 %	91791550
113	NC_007954	AAGTT	2	10	203570	203579	40 %	40 %	20 %	0 %	91791554
114	NC_007954	GATAA	2	10	205019	205028	60 %	20 %	20 %	0 %	91791557
115	NC_007954	CTGAA	2	10	205516	205525	40 %	20 %	20 %	20 %	91791559
116	NC_007954	CATTG	2	10	207108	207117	20 %	40 %	20 %	20 %	91791561
117	NC_007954	ATGGC	2	10	207490	207499	20 %	20 %	40 %	20 %	91791562
118	NC_007954	ATTAC	2	10	213508	213517	40 %	40 %	0 %	20 %	91791566
119	NC_007954	ATTAC	2	10	214612	214621	40 %	40 %	0 %	20 %	91791566
120	NC_007954	ATCAG	2	10	217337	217346	40 %	20 %	20 %	20 %	91791566
121	NC_007954	GCTGG	2	10	219619	219628	0 %	20 %	60 %	20 %	91791568
122	NC_007954	GGGTT	2	10	223136	223145	0 %	40 %	60 %	0 %	91791570
123	NC_007954	CATGG	2	10	223400	223409	20 %	20 %	40 %	20 %	91791570
124	NC_007954	CTTGC	2	10	225216	225225	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007954	GATTT	2	10	225338	225347	20 %	60 %	20 %	0 %	91791574
126	NC_007954	CTTTA	2	10	225789	225798	20 %	60 %	0 %	20 %	91791574
127	NC_007954	TGAAT	2	10	227748	227757	40 %	40 %	20 %	0 %	91791576
128	NC_007954	TGCGG	2	10	229449	229458	0 %	20 %	60 %	20 %	91791578
129	NC_007954	CGATG	2	10	234406	234415	20 %	20 %	40 %	20 %	91791584
130	NC_007954	TTGTA	2	10	234796	234805	20 %	60 %	20 %	0 %	91791584
131	NC_007954	TGAGT	2	10	240608	240617	20 %	40 %	40 %	0 %	91791590
132	NC_007954	AACTG	2	10	241409	241418	40 %	20 %	20 %	20 %	91791590
133	NC_007954	GGTGA	2	10	242124	242133	20 %	20 %	60 %	0 %	91791590
134	NC_007954	TTGTT	2	10	242962	242971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007954	GCGCG	2	10	243200	243209	0 %	0 %	60 %	40 %	91791591
136	NC_007954	CTAGA	2	10	243770	243779	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007954	ATTGG	2	10	244758	244767	20 %	40 %	40 %	0 %	91791592
138	NC_007954	ACGGC	2	10	246633	246642	20 %	0 %	40 %	40 %	91791592
139	NC_007954	TGGTG	2	10	247666	247675	0 %	40 %	60 %	0 %	91791592
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