MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 1505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193825
2	NC_007795	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007795	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007795	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	88193828
5	NC_007795	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88193829
6	NC_007795	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193829
7	NC_007795	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88193829
8	NC_007795	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193829
9	NC_007795	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	88193831
10	NC_007795	TAGCAT	2	12	11347	11358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88193831
11	NC_007795	TAAATC	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007795	GCTTTA	2	12	17440	17451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88193836
13	NC_007795	TTTGAA	2	12	18261	18272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193836
14	NC_007795	TAAAGG	3	18	20308	20325	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88193838
15	NC_007795	TTGAAG	2	12	20511	20522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193838
16	NC_007795	TGATTG	2	12	21715	21726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88193839
17	NC_007795	TGAAAT	2	12	22046	22057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193839
18	NC_007795	AAGGAA	2	12	22484	22495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193840
19	NC_007795	TGAATT	2	12	25413	25424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193841
20	NC_007795	ATTTCA	2	12	27897	27908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88193843
21	NC_007795	CTAAAG	2	12	29031	29042	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193844
22	NC_007795	ATCAGC	2	12	31214	31225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88193846
23	NC_007795	AAAAGA	2	12	33855	33866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	88193847
24	NC_007795	ACAAAT	2	12	34754	34765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	88193851
25	NC_007795	AATTAA	2	12	34845	34856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193851
26	NC_007795	ATTTAT	2	12	37085	37096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193853
27	NC_007795	TTAATG	2	12	37607	37618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193854
28	NC_007795	AAGTCA	2	12	38815	38826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193856
29	NC_007795	AAAAAG	2	12	38929	38940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	88193856
30	NC_007795	GAAAAA	2	12	39242	39253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	88193856
31	NC_007795	AATTAT	2	12	41481	41492	50 %	50 %	0 %	0 %	88193858
32	NC_007795	ACCCTT	2	12	43320	43331	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88193860
33	NC_007795	ATTTCT	2	12	47846	47857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88193866
34	NC_007795	ATATTT	2	12	47954	47965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193866
35	NC_007795	AAGGAA	2	12	48938	48949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193867
36	NC_007795	TTTAGC	2	12	49987	49998	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88193868
37	NC_007795	AAATAA	2	12	50038	50049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	88193868
38	NC_007795	GTTAGA	2	12	52161	52172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193869
39	NC_007795	AAAAGA	2	12	52215	52226	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	88193869
40	NC_007795	GCTAAA	2	12	55002	55013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193871
41	NC_007795	AACAAA	2	12	55423	55434	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007795	TAAAGA	2	12	58314	58325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88193875
43	NC_007795	AACCAC	2	12	62183	62194	50 %	0 %	0 %	50 %	88193877
44	NC_007795	AATATA	2	12	63885	63896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007795	AATGAA	2	12	63897	63908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007795	AACCGA	2	12	65503	65514	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88193879
47	NC_007795	CATTAC	2	12	67205	67216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193880
48	NC_007795	ATAGAT	2	12	70404	70415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193882
49	NC_007795	TATCAT	2	12	71171	71182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88193883
50	NC_007795	TTTATT	2	12	71579	71590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	88193884
51	NC_007795	TATTTG	2	12	71665	71676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88193884
52	NC_007795	TAAATA	2	12	73098	73109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193884
53	NC_007795	TTTTTC	2	12	74966	74977	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	88193885
54	NC_007795	TAACAA	2	12	76418	76429	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007795	TAAGCC	2	12	76827	76838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88193887
56	NC_007795	ATCGCA	2	12	78042	78053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88193888
57	NC_007795	TTTGAA	2	12	79073	79084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193889
58	NC_007795	GCAATG	2	12	88030	88041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88193895
59	NC_007795	TGAAGA	2	12	88865	88876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88193896
60	NC_007795	TTTCAT	2	12	89546	89557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88193897
61	NC_007795	TGTATA	2	12	94223	94234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193903
62	NC_007795	TCGAAA	2	12	95724	95735	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193905
63	NC_007795	CTATTG	2	12	98310	98321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88193907
64	NC_007795	ATTAAG	2	12	99247	99258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007795	CATATG	2	12	99513	99524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88193908
66	NC_007795	AATGTA	2	12	100414	100425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007795	CTGTAA	2	12	102235	102246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007795	GGTATG	2	12	102556	102567	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88193911
69	NC_007795	CAGATT	2	12	105154	105165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88193913
70	NC_007795	AGATAT	2	12	112553	112564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193920
71	NC_007795	GTTTTT	2	12	113462	113473	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007795	TAAAGC	2	12	114163	114174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88193922
73	NC_007795	TTTTGA	2	12	114349	114360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88193922
74	NC_007795	GATATG	2	12	122459	122470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193930
75	NC_007795	ATTTGA	2	12	126365	126376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193933
76	NC_007795	GATTTT	2	12	130876	130887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88193938
77	NC_007795	ACAAAG	2	12	135396	135407	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	88193942
78	NC_007795	TGTAAT	2	12	136420	136431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193943
79	NC_007795	AAAGAT	2	12	137409	137420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88193945
80	NC_007795	CAATAT	2	12	139880	139891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	88193946
81	NC_007795	TTGGTA	2	12	143735	143746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88193951
82	NC_007795	GCGATT	2	12	143755	143766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88193951
83	NC_007795	AAATTT	2	12	143853	143864	50 %	50 %	0 %	0 %	88193951
84	NC_007795	ACCTGC	2	12	146755	146766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88193954
85	NC_007795	AAGATA	2	12	146901	146912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88193954
86	NC_007795	CGTTAA	2	12	149835	149846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88193956
87	NC_007795	CTATTA	2	12	151686	151697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88193956
88	NC_007795	TATGAT	2	12	153220	153231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193956
89	NC_007795	TTGAAA	2	12	153672	153683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193956
90	NC_007795	AACATT	2	12	156112	156123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	88193956
91	NC_007795	AGCAAC	2	12	159601	159612	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88193960
92	NC_007795	TGTTTG	2	12	159649	159660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193960
93	NC_007795	CACCTT	2	12	161653	161664	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88193962
94	NC_007795	ACCTTT	2	12	162158	162169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88193962
95	NC_007795	TTTATA	2	12	162254	162265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007795	ATTAAT	2	12	162277	162288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007795	GTAAAT	2	12	165894	165905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193965
98	NC_007795	ATTTTA	2	12	167490	167501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193967
99	NC_007795	TATCTT	2	12	172105	172116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88193970
100	NC_007795	ATTTGG	2	12	173118	173129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88193971
101	NC_007795	GAGTTT	2	12	176461	176472	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88193973
102	NC_007795	CCCTGA	2	12	181038	181049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88193977
103	NC_007795	TCCTGA	2	12	181857	181868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88193977
104	NC_007795	TCAATT	2	12	184008	184019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88193979
105	NC_007795	AATATG	2	12	185308	185319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193980
106	NC_007795	AAAAAT	2	12	188800	188811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	88193982
107	NC_007795	AGGACA	2	12	190661	190672	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88193984
108	NC_007795	ACATTT	2	12	190997	191008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88193984
109	NC_007795	TTCTTG	2	12	195925	195936	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88193988
110	NC_007795	GGACGT	2	12	206427	206438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88193997
111	NC_007795	ATATGA	2	12	209178	209189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007795	CTTCAA	2	12	214167	214178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007795	GGAATA	2	12	223990	224001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007795	TGGTAT	2	12	235571	235582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88194023
115	NC_007795	TATAGA	2	12	238925	238936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88194027
116	NC_007795	ATATAG	2	12	245218	245229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007795	ACGATG	2	12	245554	245565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88194032
118	NC_007795	ATTTTC	2	12	250534	250545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007795	ATAATT	2	12	251485	251496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007795	AAGTAA	2	12	256536	256547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88194042
121	NC_007795	ATAAAG	2	12	257517	257528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88194043
122	NC_007795	AACGAT	2	12	258801	258812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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