MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 2479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	88193824
2	NC_007795	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	88193825
3	NC_007795	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	88193825
4	NC_007795	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	88193825
5	NC_007795	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	88193828
6	NC_007795	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	88193828
7	NC_007795	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007795	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	88193829
9	NC_007795	GGTGT	2	10	10123	10132	0 %	40 %	60 %	0 %	88193830
10	NC_007795	ATCGC	2	10	10185	10194	20 %	20 %	20 %	40 %	88193830
11	NC_007795	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	88193831
12	NC_007795	AGGAA	2	10	14342	14351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007795	GTAGG	2	10	14402	14411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007795	TTATT	2	10	15442	15451	20 %	80 %	0 %	0 %	88193834
15	NC_007795	GCAAG	2	10	16616	16625	40 %	0 %	40 %	20 %	88193835
16	NC_007795	TTTGA	2	10	16775	16784	20 %	60 %	20 %	0 %	88193835
17	NC_007795	AGTTA	2	10	22094	22103	40 %	40 %	20 %	0 %	88193839
18	NC_007795	ATGTA	2	10	23652	23661	40 %	40 %	20 %	0 %	88193840
19	NC_007795	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007795	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007795	ACCAA	2	10	26263	26272	60 %	0 %	0 %	40 %	88193842
22	NC_007795	ATCAA	2	10	26975	26984	60 %	20 %	0 %	20 %	88193842
23	NC_007795	GAAAC	2	10	27596	27605	60 %	0 %	20 %	20 %	88193843
24	NC_007795	GAAGT	2	10	27746	27755	40 %	20 %	40 %	0 %	88193843
25	NC_007795	ATTAT	2	10	29389	29398	40 %	60 %	0 %	0 %	88193844
26	NC_007795	AAGGT	2	10	32482	32491	40 %	20 %	40 %	0 %	88193846
27	NC_007795	CATTA	2	10	33909	33918	40 %	40 %	0 %	20 %	88193847
28	NC_007795	TAGTA	2	10	36244	36253	40 %	40 %	20 %	0 %	88193851
29	NC_007795	TTTTA	2	10	36460	36469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007795	TACTA	2	10	37422	37431	40 %	40 %	0 %	20 %	88193854
31	NC_007795	ATCAA	2	10	40175	40184	60 %	20 %	0 %	20 %	88193857
32	NC_007795	TAATA	2	10	42007	42016	60 %	40 %	0 %	0 %	88193858
33	NC_007795	GTGTT	2	10	42090	42099	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007795	ATTTT	2	10	44616	44625	20 %	80 %	0 %	0 %	88193863
35	NC_007795	TATGG	2	10	46629	46638	20 %	40 %	40 %	0 %	88193865
36	NC_007795	TAACT	2	10	46934	46943	40 %	40 %	0 %	20 %	88193865
37	NC_007795	ATTGC	2	10	48207	48216	20 %	40 %	20 %	20 %	88193866
38	NC_007795	AGAAA	2	10	49127	49136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007795	TAAAG	2	10	49168	49177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007795	ATTCA	2	10	49440	49449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007795	TATAT	2	10	49701	49710	40 %	60 %	0 %	0 %	88193868
42	NC_007795	CTAAA	2	10	51341	51350	60 %	20 %	0 %	20 %	88193869
43	NC_007795	CAAAA	2	10	51372	51381	80 %	0 %	0 %	20 %	88193869
44	NC_007795	TTACC	2	10	54488	54497	20 %	40 %	0 %	40 %	88193871
45	NC_007795	GATAT	2	10	56063	56072	40 %	40 %	20 %	0 %	88193872
46	NC_007795	TACTA	2	10	56599	56608	40 %	40 %	0 %	20 %	88193873
47	NC_007795	TTTAC	2	10	57008	57017	20 %	60 %	0 %	20 %	88193873
48	NC_007795	ATTGC	2	10	59491	59500	20 %	40 %	20 %	20 %	88193876
49	NC_007795	CATGG	2	10	60895	60904	20 %	20 %	40 %	20 %	88193876
50	NC_007795	TGAAA	2	10	61563	61572	60 %	20 %	20 %	0 %	88193877
51	NC_007795	TCAAT	2	10	61935	61944	40 %	40 %	0 %	20 %	88193877
52	NC_007795	GTATT	2	10	62424	62433	20 %	60 %	20 %	0 %	88193878
53	NC_007795	AGATA	2	10	68295	68304	60 %	20 %	20 %	0 %	88193881
54	NC_007795	TAAAA	2	10	68855	68864	80 %	20 %	0 %	0 %	88193881
55	NC_007795	AAAGA	2	10	70488	70497	80 %	0 %	20 %	0 %	88193882
56	NC_007795	GTAAT	2	10	70707	70716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007795	CAATT	2	10	71139	71148	40 %	40 %	0 %	20 %	88193883
58	NC_007795	ATGTT	2	10	71973	71982	20 %	60 %	20 %	0 %	88193884
59	NC_007795	TTGCG	2	10	72544	72553	0 %	40 %	40 %	20 %	88193884
60	NC_007795	AGTTA	2	10	74104	74113	40 %	40 %	20 %	0 %	88193885
61	NC_007795	AGATG	2	10	77477	77486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007795	GGTGA	2	10	78073	78082	20 %	20 %	60 %	0 %	88193888
63	NC_007795	GAAAA	2	10	81510	81519	80 %	0 %	20 %	0 %	88193891
64	NC_007795	TTATT	2	10	81677	81686	20 %	80 %	0 %	0 %	88193891
65	NC_007795	AATCA	2	10	84699	84708	60 %	20 %	0 %	20 %	88193893
66	NC_007795	GCACG	2	10	85103	85112	20 %	0 %	40 %	40 %	88193894
67	NC_007795	ATTTT	2	10	85397	85406	20 %	80 %	0 %	0 %	88193894
68	NC_007795	ATCAA	2	10	85424	85433	60 %	20 %	0 %	20 %	88193894
69	NC_007795	ATCAC	2	10	86657	86666	40 %	20 %	0 %	40 %	88193895
70	NC_007795	AACGA	2	10	87334	87343	60 %	0 %	20 %	20 %	88193895
71	NC_007795	ACACA	2	10	89390	89399	60 %	0 %	0 %	40 %	88193897
72	NC_007795	GACAA	2	10	90541	90550	60 %	0 %	20 %	20 %	88193898
73	NC_007795	ATTAC	2	10	93182	93191	40 %	40 %	0 %	20 %	88193901
74	NC_007795	ATTTT	2	10	93486	93495	20 %	80 %	0 %	0 %	88193902
75	NC_007795	TATCT	2	10	93842	93851	20 %	60 %	0 %	20 %	88193903
76	NC_007795	ATACG	2	10	96275	96284	40 %	20 %	20 %	20 %	88193905
77	NC_007795	TTATA	2	10	96933	96942	40 %	60 %	0 %	0 %	88193906
78	NC_007795	TTTTA	2	10	97731	97740	20 %	80 %	0 %	0 %	88193906
79	NC_007795	GTATT	2	10	98244	98253	20 %	60 %	20 %	0 %	88193907
80	NC_007795	AATAA	2	10	98837	98846	80 %	20 %	0 %	0 %	88193907
81	NC_007795	TACGC	2	10	99104	99113	20 %	20 %	20 %	40 %	88193907
82	NC_007795	GACAA	2	10	100446	100455	60 %	0 %	20 %	20 %	88193909
83	NC_007795	TCCCT	2	10	101910	101919	0 %	40 %	0 %	60 %	88193910
84	NC_007795	GCTTT	2	10	104144	104153	0 %	60 %	20 %	20 %	88193912
85	NC_007795	TAATT	2	10	104229	104238	40 %	60 %	0 %	0 %	88193912
86	NC_007795	ATACT	2	10	105410	105419	40 %	40 %	0 %	20 %	88193914
87	NC_007795	TAATA	2	10	106576	106585	60 %	40 %	0 %	0 %	88193915
88	NC_007795	ATTTT	2	10	107567	107576	20 %	80 %	0 %	0 %	88193916
89	NC_007795	TTGTA	2	10	109791	109800	20 %	60 %	20 %	0 %	88193918
90	NC_007795	TGCAA	2	10	110796	110805	40 %	20 %	20 %	20 %	88193919
91	NC_007795	ATATG	2	10	112814	112823	40 %	40 %	20 %	0 %	88193920
92	NC_007795	AATAT	2	10	113682	113691	60 %	40 %	0 %	0 %	88193921
93	NC_007795	ATTTT	2	10	115071	115080	20 %	80 %	0 %	0 %	88193924
94	NC_007795	GATTT	2	10	115125	115134	20 %	60 %	20 %	0 %	88193924
95	NC_007795	GGGGC	2	10	115394	115403	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007795	TGGTA	2	10	118022	118031	20 %	40 %	40 %	0 %	88193926
97	NC_007795	CGAAC	2	10	118112	118121	40 %	0 %	20 %	40 %	88193926
98	NC_007795	TTCAA	2	10	120139	120148	40 %	40 %	0 %	20 %	88193927
99	NC_007795	ACATC	2	10	120982	120991	40 %	20 %	0 %	40 %	88193929
100	NC_007795	TAATT	2	10	123205	123214	40 %	60 %	0 %	0 %	88193930
101	NC_007795	AGAGA	2	10	126231	126240	60 %	0 %	40 %	0 %	88193933
102	NC_007795	AATCC	2	10	126587	126596	40 %	20 %	0 %	40 %	88193933
103	NC_007795	CTAAT	2	10	130482	130491	40 %	40 %	0 %	20 %	88193937
104	NC_007795	TGAAT	2	10	135343	135352	40 %	40 %	20 %	0 %	88193942
105	NC_007795	TGATT	2	10	136474	136483	20 %	60 %	20 %	0 %	88193944
106	NC_007795	AGCAA	2	10	136725	136734	60 %	0 %	20 %	20 %	88193944
107	NC_007795	CAAAA	2	10	138838	138847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007795	AAAGC	2	10	139188	139197	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007795	TTCAT	2	10	139580	139589	20 %	60 %	0 %	20 %	88193946
110	NC_007795	TTTAC	2	10	139963	139972	20 %	60 %	0 %	20 %	88193946
111	NC_007795	CGTTT	2	10	140407	140416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007795	TTATT	2	10	140944	140953	20 %	80 %	0 %	0 %	88193948
113	NC_007795	GGATT	2	10	141932	141941	20 %	40 %	40 %	0 %	88193949
114	NC_007795	TAACT	2	10	144972	144981	40 %	40 %	0 %	20 %	88193952
115	NC_007795	TTTAT	2	10	147879	147888	20 %	80 %	0 %	0 %	88193955
116	NC_007795	TATCA	2	10	148983	148992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007795	ATGCA	2	10	149482	149491	40 %	20 %	20 %	20 %	88193956
118	NC_007795	TATGA	2	10	156728	156737	40 %	40 %	20 %	0 %	88193957
119	NC_007795	GTGAA	2	10	156762	156771	40 %	20 %	40 %	0 %	88193957
120	NC_007795	ATCAT	2	10	157115	157124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007795	TTAAT	2	10	157205	157214	40 %	60 %	0 %	0 %	88193958
122	NC_007795	ATATA	2	10	160035	160044	60 %	40 %	0 %	0 %	88193961
123	NC_007795	AAGAT	2	10	163764	163773	60 %	20 %	20 %	0 %	88193963
124	NC_007795	CGTTT	2	10	164209	164218	0 %	60 %	20 %	20 %	88193964
125	NC_007795	AAATG	2	10	166690	166699	60 %	20 %	20 %	0 %	88193967
126	NC_007795	GTAAA	2	10	166854	166863	60 %	20 %	20 %	0 %	88193967
127	NC_007795	TTTAA	2	10	166874	166883	40 %	60 %	0 %	0 %	88193967
128	NC_007795	TTTGC	2	10	167390	167399	0 %	60 %	20 %	20 %	88193967
129	NC_007795	TTGTT	2	10	168396	168405	0 %	80 %	20 %	0 %	88193967
130	NC_007795	CAAAA	2	10	171609	171618	80 %	0 %	0 %	20 %	88193970
131	NC_007795	AGTTT	2	10	172145	172154	20 %	60 %	20 %	0 %	88193970
132	NC_007795	CAACA	2	10	172375	172384	60 %	0 %	0 %	40 %	88193970
133	NC_007795	AAAAT	2	10	173003	173012	80 %	20 %	0 %	0 %	88193971
134	NC_007795	AAATG	2	10	173412	173421	60 %	20 %	20 %	0 %	88193971
135	NC_007795	GCTTT	2	10	173758	173767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007795	TGAAG	2	10	173960	173969	40 %	20 %	40 %	0 %	88193972
137	NC_007795	AAAAT	2	10	174031	174040	80 %	20 %	0 %	0 %	88193972
138	NC_007795	TGATT	2	10	174104	174113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007795	TTGAA	2	10	174686	174695	40 %	40 %	20 %	0 %	88193973
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253	NC_007795	TAAAT	2	10	307022	307031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_007795	CATTG	2	10	312069	312078	20 %	40 %	20 %	20 %	88194099
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259	NC_007795	AGCCA	2	10	312900	312909	40 %	0 %	20 %	40 %	88194100
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263	NC_007795	ATAGA	2	10	318817	318826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_007795	TGACA	2	10	319009	319018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_007795	AAGTA	2	10	325219	325228	60 %	20 %	20 %	0 %	88194111
271	NC_007795	ATTTG	2	10	328379	328388	20 %	60 %	20 %	0 %	88194114
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