MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 67368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007795	CTT	2	6	20371	20376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88193838
502	NC_007795	A	6	6	20438	20443	100 %	0 %	0 %	0 %	88193838
503	NC_007795	CAA	2	6	20462	20467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193838
504	NC_007795	TTGAAG	2	12	20511	20522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193838
505	NC_007795	GGT	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193838
506	NC_007795	AGTA	2	8	20563	20570	50 %	25 %	25 %	0 %	88193838
507	NC_007795	ATTC	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	88193838
508	NC_007795	AAG	2	6	20691	20696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193838
509	NC_007795	AC	3	6	20716	20721	50 %	0 %	0 %	50 %	88193838
510	NC_007795	GTCT	2	8	20819	20826	0 %	50 %	25 %	25 %	88193839
511	NC_007795	ATT	2	6	20835	20840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193839
512	NC_007795	TAC	2	6	20861	20866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193839
513	NC_007795	ATG	2	6	20928	20933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
514	NC_007795	ATA	2	6	20947	20952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193839
515	NC_007795	TGT	2	6	20963	20968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193839
516	NC_007795	TGAA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	25 %	0 %	88193839
517	NC_007795	ACG	2	6	21057	21062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193839
518	NC_007795	TAT	2	6	21075	21080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193839
519	NC_007795	GCAT	2	8	21098	21105	25 %	25 %	25 %	25 %	88193839
520	NC_007795	GATT	2	8	21115	21122	25 %	50 %	25 %	0 %	88193839
521	NC_007795	ATG	2	6	21145	21150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
522	NC_007795	ATG	2	6	21157	21162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
523	NC_007795	ATC	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193839
524	NC_007795	CAG	2	6	21355	21360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193839
525	NC_007795	GGTA	2	8	21605	21612	25 %	25 %	50 %	0 %	88193839
526	NC_007795	TGA	2	6	21638	21643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
527	NC_007795	GTC	2	6	21682	21687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193839
528	NC_007795	TGATTG	2	12	21715	21726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88193839
529	NC_007795	ACT	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193839
530	NC_007795	ACA	2	6	21776	21781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193839
531	NC_007795	TC	3	6	21796	21801	0 %	50 %	0 %	50 %	88193839
532	NC_007795	GTG	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193839
533	NC_007795	AAC	2	6	21874	21879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88193839
534	NC_007795	ATG	2	6	21897	21902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
535	NC_007795	TGA	2	6	21965	21970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
536	NC_007795	GGC	2	6	21984	21989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88193839
537	NC_007795	GAT	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
538	NC_007795	GAT	2	6	22005	22010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
539	NC_007795	GGT	2	6	22011	22016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193839
540	NC_007795	ATG	2	6	22033	22038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
541	NC_007795	TGAAAT	2	12	22046	22057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88193839
542	NC_007795	AGTTA	2	10	22094	22103	40 %	40 %	20 %	0 %	88193839
543	NC_007795	ATA	2	6	22120	22125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193839
544	NC_007795	ATG	2	6	22158	22163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193839
545	NC_007795	A	6	6	22165	22170	100 %	0 %	0 %	0 %	88193839
546	NC_007795	AAT	2	6	22183	22188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007795	GAT	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007795	AT	3	6	22238	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007795	TCA	2	6	22447	22452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193840
550	NC_007795	GTA	2	6	22456	22461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193840
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553	NC_007795	GGT	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193840
554	NC_007795	AAT	2	6	22552	22557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193840
555	NC_007795	GTT	2	6	22660	22665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193840
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557	NC_007795	GTG	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88193840
558	NC_007795	A	6	6	22828	22833	100 %	0 %	0 %	0 %	88193840
559	NC_007795	ATT	2	6	22917	22922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193840
560	NC_007795	CAT	2	6	22982	22987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193840
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562	NC_007795	GAA	2	6	23002	23007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193840
563	NC_007795	TAT	2	6	23008	23013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88193840
564	NC_007795	GCA	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88193840
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566	NC_007795	CAT	2	6	23302	23307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88193840
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573	NC_007795	AGA	2	6	23601	23606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193840
574	NC_007795	ATGTA	2	10	23652	23661	40 %	40 %	20 %	0 %	88193840
575	NC_007795	TCT	2	6	23672	23677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88193840
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577	NC_007795	TA	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007795	AGG	2	6	23787	23792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007795	TGCT	2	8	23802	23809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_007795	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
581	NC_007795	A	6	6	23835	23840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007795	AGA	2	6	23877	23882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007795	GAT	2	6	23886	23891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007795	AAG	2	6	23926	23931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007795	ATT	2	6	24018	24023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007795	ATA	2	6	24024	24029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_007795	A	6	6	24098	24103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_007795	ATCT	2	8	24136	24143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_007795	CGG	2	6	24194	24199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007795	T	6	6	24232	24237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007795	GCCT	2	8	24264	24271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_007795	T	7	7	24340	24346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007795	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007795	AT	3	6	24372	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_007795	TTA	2	6	24489	24494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007795	TTC	2	6	24526	24531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007795	CCA	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_007795	TCC	2	6	24550	24555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_007795	AAT	2	6	24587	24592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007795	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007795	TAT	2	6	24648	24653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007795	TCA	2	6	24667	24672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_007795	CCG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_007795	TAA	2	6	24712	24717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_007795	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007795	AT	3	6	24727	24732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007795	TA	3	6	24778	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007795	T	6	6	24852	24857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007795	A	6	6	24882	24887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007795	ATA	2	6	24895	24900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007795	GTT	2	6	24943	24948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88193841
614	NC_007795	TGA	3	9	24954	24962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193841
615	NC_007795	A	7	7	24996	25002	100 %	0 %	0 %	0 %	88193841
616	NC_007795	ATG	2	6	25037	25042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88193841
617	NC_007795	GAA	3	9	25060	25068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88193841
618	NC_007795	A	6	6	25138	25143	100 %	0 %	0 %	0 %	88193841
619	NC_007795	AAT	3	9	25155	25163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88193841
620	NC_007795	CGT	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193841
621	NC_007795	A	6	6	25378	25383	100 %	0 %	0 %	0 %	88193841
622	NC_007795	TGAATT	2	12	25413	25424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88193841
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629	NC_007795	TCC	2	6	25613	25618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88193841
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632	NC_007795	GCT	2	6	25764	25769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88193842
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