MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 1540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	GTTGAA	2	12	3218	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
2	NC_007793	ATAAAT	2	12	3319	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007793	TTTAAA	2	12	3496	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007793	TGGCGG	2	12	5396	5407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	87161454
5	NC_007793	GTTATC	2	12	7324	7335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87160436
6	NC_007793	CAGATA	2	12	8233	8244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87160436
7	NC_007793	CAAGCT	2	12	8292	8303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160436
8	NC_007793	GTAATG	2	12	9280	9291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160436
9	NC_007793	ACAATT	2	12	11279	11290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161623
10	NC_007793	TAGCAT	2	12	11374	11385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161623
11	NC_007793	TAAATC	2	12	17189	17200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007793	GCTTTA	2	12	17467	17478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87159904
13	NC_007793	TTTGAA	2	12	18288	18299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87159904
14	NC_007793	TAAAGG	2	12	20335	20346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	87161718
15	NC_007793	TTGAAG	2	12	20532	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161718
16	NC_007793	TGATTG	2	12	21736	21747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87160622
17	NC_007793	TGAAAT	2	12	22067	22078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87160622
18	NC_007793	AAGGAA	2	12	22505	22516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160876
19	NC_007793	TGAATT	2	12	25434	25445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160310
20	NC_007793	ATTTCA	2	12	27918	27929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87162050
21	NC_007793	CTAAAG	2	12	29052	29063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87160298
22	NC_007793	ATCAGC	2	12	31235	31246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87161790
23	NC_007793	AAAAGA	2	12	33876	33887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87161272
24	NC_007793	ACATCT	2	12	35530	35541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161823
25	NC_007793	GTTTAA	2	12	36095	36106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160207
26	NC_007793	AAAAAT	2	12	37786	37797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007793	AATGAA	2	12	39022	39033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87160887
28	NC_007793	ACAACT	2	12	41087	41098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	87161759
29	NC_007793	GCTAAA	2	12	42326	42337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87161163
30	NC_007793	GTATGA	2	12	49612	49623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161581
31	NC_007793	AATTAA	2	12	52418	52429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007793	GAAGGT	2	12	54498	54509	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	87161505
33	NC_007793	TATTAA	2	12	57561	57572	50 %	50 %	0 %	0 %	87160457
34	NC_007793	TTATAG	2	12	59736	59747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161965
35	NC_007793	AAAATT	2	12	60307	60318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161597
36	NC_007793	ATAACT	2	12	61482	61493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007793	TAAAAT	2	12	62672	62683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161681
38	NC_007793	TATAAA	2	12	63633	63644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007793	AGACCT	2	12	64269	64280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87161898
40	NC_007793	TTTATC	2	12	69187	69198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87160434
41	NC_007793	AACTTG	2	12	69481	69492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87160434
42	NC_007793	AAAGGA	2	12	69605	69616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160434
43	NC_007793	ATCTTT	2	12	73746	73757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87161307
44	NC_007793	TTAAAC	2	12	76713	76724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007793	TAAAAA	2	12	85480	85491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007793	TTAATT	2	12	86502	86513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161242
47	NC_007793	ATAAAC	2	12	87460	87471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	87161242
48	NC_007793	ATTAAA	2	12	88103	88114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161242
49	NC_007793	ACAAAT	2	12	89488	89499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	87161877
50	NC_007793	AATTAA	2	12	89579	89590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161877
51	NC_007793	ATTTAT	2	12	91825	91836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007793	TTAATG	2	12	92347	92358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160645
53	NC_007793	AAGTCA	2	12	93555	93566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87162131
54	NC_007793	AAAAAG	2	12	93669	93680	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87162131
55	NC_007793	GAAAAA	2	12	93982	93993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87162131
56	NC_007793	AATTAT	2	12	96221	96232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007793	ACCCTT	2	12	98060	98071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	87161344
58	NC_007793	ATTTCT	2	12	102584	102595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87162429
59	NC_007793	ATATTT	2	12	102692	102703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87162429
60	NC_007793	AAGGAA	2	12	103676	103687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160449
61	NC_007793	TTTAGC	2	12	104725	104736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161497
62	NC_007793	AAATAA	2	12	104776	104787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	87161497
63	NC_007793	GTTAGA	2	12	106899	106910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161985
64	NC_007793	AAAAGA	2	12	106953	106964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87161985
65	NC_007793	GCTAAA	2	12	109740	109751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87162123
66	NC_007793	AACAAA	2	12	110161	110172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007793	TAAAGA	2	12	113052	113063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87162291
68	NC_007793	AACCAC	2	12	116921	116932	50 %	0 %	0 %	50 %	87161414
69	NC_007793	AATATA	2	12	118623	118634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007793	AATGAA	2	12	118635	118646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007793	AACCGA	2	12	120241	120252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87159888
72	NC_007793	CATTAC	2	12	121943	121954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161006
73	NC_007793	ATAGAT	2	12	125142	125153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161855
74	NC_007793	TATCAT	2	12	125909	125920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87160686
75	NC_007793	TTTATT	2	12	126317	126328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	87160277
76	NC_007793	TATTTG	2	12	126403	126414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	87160277
77	NC_007793	TAAATA	2	12	127836	127847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87160277
78	NC_007793	TTTTTC	2	12	129680	129691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	87161843
79	NC_007793	TAACAA	2	12	131132	131143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007793	TAAGCC	2	12	131541	131552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160394
81	NC_007793	ATCGCA	2	12	132756	132767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160001
82	NC_007793	TTTGAA	2	12	133787	133798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161572
83	NC_007793	GCAATG	2	12	142744	142755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	87160266
84	NC_007793	TGAAGA	2	12	143579	143590	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	87160851
85	NC_007793	TTTCAT	2	12	144260	144271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87160623
86	NC_007793	TGTATA	2	12	148937	148948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87162155
87	NC_007793	TCGAAA	2	12	150438	150449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87161056
88	NC_007793	CTATTG	2	12	153024	153035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161267
89	NC_007793	ATTAAG	2	12	153961	153972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007793	CATATG	2	12	154227	154238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161851
91	NC_007793	AATGTA	2	12	155128	155139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007793	CTGTAA	2	12	156951	156962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007793	GGTATG	2	12	157272	157283	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	87159961
94	NC_007793	CAGATT	2	12	159870	159881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161186
95	NC_007793	AGATAT	2	12	167269	167280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161080
96	NC_007793	GTTTTT	2	12	168178	168189	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007793	TAAAGC	2	12	168879	168890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007793	TTTTGA	2	12	169065	169076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007793	GATATG	2	12	177128	177139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007793	ATTTGA	2	12	181035	181046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160813
101	NC_007793	GATTTT	2	12	185546	185557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	87162167
102	NC_007793	ACAAAG	2	12	190066	190077	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	87160148
103	NC_007793	TGTAAT	2	12	191090	191101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161977
104	NC_007793	AAAGAT	2	12	192079	192090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87161510
105	NC_007793	CAATAT	2	12	194550	194561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161093
106	NC_007793	TTGGTA	2	12	198405	198416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87161514
107	NC_007793	GCGATT	2	12	198425	198436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	87161514
108	NC_007793	AAATTT	2	12	198523	198534	50 %	50 %	0 %	0 %	87161514
109	NC_007793	ACCTGC	2	12	201425	201436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	87160024
110	NC_007793	AAGATA	2	12	201571	201582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87160024
111	NC_007793	CGTTAA	2	12	204505	204516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161363
112	NC_007793	CTATTA	2	12	206356	206367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87161363
113	NC_007793	TATGAT	2	12	207890	207901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161363
114	NC_007793	TTGAAA	2	12	208342	208353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161363
115	NC_007793	AACATT	2	12	210782	210793	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161363
116	NC_007793	AGCAAC	2	12	214271	214282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87161926
117	NC_007793	TGTTTG	2	12	214319	214330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161926
118	NC_007793	CACCTT	2	12	216323	216334	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	87160787
119	NC_007793	ACCTTT	2	12	216828	216839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	87160787
120	NC_007793	TTTATA	2	12	216924	216935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007793	ATTAAT	2	12	216947	216958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007793	GTAAAT	2	12	220564	220575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87160234
123	NC_007793	ATTTTA	2	12	222160	222171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160101
124	NC_007793	TATCTT	2	12	226775	226786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87159952
125	NC_007793	ATTTGG	2	12	227788	227799	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87160090
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128	NC_007793	TCCTGA	2	12	236527	236538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	87161253
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154	NC_007793	TAACTT	2	12	322311	322322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_007793	TCTTCA	2	12	327184	327195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	87160126
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233	NC_007793	AAAATA	2	12	504129	504140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_007793	GTTGGT	2	12	505483	505494	0 %	50 %	50 %	0 %	87161556
235	NC_007793	GCTATT	2	12	505555	505566	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161556
236	NC_007793	GATCAT	2	12	507151	507162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87160192
237	NC_007793	AATTTA	2	12	508058	508069	50 %	50 %	0 %	0 %	87160023
238	NC_007793	CAAGAA	2	12	511183	511194	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	87160949
239	NC_007793	TATGGT	2	12	512267	512278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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