MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 2521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	CAAAT	2	10	1472	1481	60 %	20 %	0 %	20 %	87161673
2	NC_007793	AATTT	2	10	2520	2529	40 %	60 %	0 %	0 %	87160973
3	NC_007793	CAATT	2	10	2586	2595	40 %	40 %	0 %	20 %	87160973
4	NC_007793	AAATT	2	10	2964	2973	60 %	40 %	0 %	0 %	87160973
5	NC_007793	CAAAT	2	10	5251	5260	60 %	20 %	0 %	20 %	87161454
6	NC_007793	TGAAT	2	10	6761	6770	40 %	40 %	20 %	0 %	87161454
7	NC_007793	TGAAC	2	10	7002	7011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007793	TTCAA	2	10	7748	7757	40 %	40 %	0 %	20 %	87160436
9	NC_007793	GGTGT	2	10	10150	10159	0 %	40 %	60 %	0 %	87160041
10	NC_007793	ATCGC	2	10	10212	10221	20 %	20 %	20 %	40 %	87160041
11	NC_007793	CGTTG	2	10	11755	11764	0 %	40 %	40 %	20 %	87161623
12	NC_007793	AGGAA	2	10	14369	14378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007793	GTAGG	2	10	14429	14438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007793	TTATT	2	10	15469	15478	20 %	80 %	0 %	0 %	87162161
15	NC_007793	GCAAG	2	10	16643	16652	40 %	0 %	40 %	20 %	87160802
16	NC_007793	TTTGA	2	10	16802	16811	20 %	60 %	20 %	0 %	87160802
17	NC_007793	AGTTA	2	10	22115	22124	40 %	40 %	20 %	0 %	87160622
18	NC_007793	ATGTA	2	10	23673	23682	40 %	40 %	20 %	0 %	87160876
19	NC_007793	TCGAT	2	10	23837	23846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007793	ATATT	2	10	24375	24384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007793	ACCAA	2	10	26284	26293	60 %	0 %	0 %	40 %	87161483
22	NC_007793	ATCAA	2	10	26996	27005	60 %	20 %	0 %	20 %	87161483
23	NC_007793	GAAAC	2	10	27617	27626	60 %	0 %	20 %	20 %	87162050
24	NC_007793	GAAGT	2	10	27767	27776	40 %	20 %	40 %	0 %	87162050
25	NC_007793	ATTAT	2	10	29410	29419	40 %	60 %	0 %	0 %	87160298
26	NC_007793	AAGGT	2	10	32503	32512	40 %	20 %	40 %	0 %	87161790
27	NC_007793	CATTA	2	10	33930	33939	40 %	40 %	0 %	20 %	87161272
28	NC_007793	TTTCA	2	10	34333	34342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007793	AAATG	2	10	35574	35583	60 %	20 %	20 %	0 %	87161823
30	NC_007793	ATTTT	2	10	35655	35664	20 %	80 %	0 %	0 %	87161823
31	NC_007793	TAAAA	2	10	35786	35795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007793	ATGAG	2	10	37660	37669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007793	TGAAT	2	10	38007	38016	40 %	40 %	20 %	0 %	87161628
34	NC_007793	TTGGT	2	10	38049	38058	0 %	60 %	40 %	0 %	87161628
35	NC_007793	AATAT	2	10	38117	38126	60 %	40 %	0 %	0 %	87161628
36	NC_007793	TTCGT	2	10	38328	38337	0 %	60 %	20 %	20 %	87161628
37	NC_007793	CAAAA	2	10	38688	38697	80 %	0 %	0 %	20 %	87160887
38	NC_007793	AAATT	2	10	40787	40796	60 %	40 %	0 %	0 %	87161759
39	NC_007793	TTGAA	2	10	42816	42825	40 %	40 %	20 %	0 %	87160780
40	NC_007793	TTGAA	2	10	43162	43171	40 %	40 %	20 %	0 %	87160780
41	NC_007793	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007793	TTTGA	2	10	47416	47425	20 %	60 %	20 %	0 %	87160426
43	NC_007793	GTTTT	2	10	47499	47508	0 %	80 %	20 %	0 %	87160426
44	NC_007793	GTTTG	2	10	48129	48138	0 %	60 %	40 %	0 %	87161136
45	NC_007793	TTGCT	2	10	48457	48466	0 %	60 %	20 %	20 %	87161136
46	NC_007793	TATTT	2	10	51951	51960	20 %	80 %	0 %	0 %	87162236
47	NC_007793	TATGT	2	10	55322	55331	20 %	60 %	20 %	0 %	87162240
48	NC_007793	GATTT	2	10	56643	56652	20 %	60 %	20 %	0 %	87161433
49	NC_007793	AAAGA	2	10	57284	57293	80 %	0 %	20 %	0 %	87160457
50	NC_007793	TATAA	2	10	57952	57961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007793	ATGTA	2	10	58709	58718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007793	AAAAT	2	10	59501	59510	80 %	20 %	0 %	0 %	87161965
53	NC_007793	ACTAT	2	10	61565	61574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007793	GATTT	2	10	62052	62061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007793	TTTCA	2	10	62535	62544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007793	AGCAA	2	10	64793	64802	60 %	0 %	20 %	20 %	87161898
57	NC_007793	CTTTA	2	10	65713	65722	20 %	60 %	0 %	20 %	87162269
58	NC_007793	AAAAC	2	10	68048	68057	80 %	0 %	0 %	20 %	87162436
59	NC_007793	AAATC	2	10	68457	68466	60 %	20 %	0 %	20 %	87162436
60	NC_007793	TTTTC	2	10	69095	69104	0 %	80 %	0 %	20 %	87160434
61	NC_007793	TAATC	2	10	71778	71787	40 %	40 %	0 %	20 %	87160589
62	NC_007793	CTTAT	2	10	74537	74546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007793	TAAGA	2	10	75031	75040	60 %	20 %	20 %	0 %	87162413
64	NC_007793	AAATG	2	10	78183	78192	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007793	TAAGC	2	10	79073	79082	40 %	20 %	20 %	20 %	87161793
66	NC_007793	AATGA	2	10	79699	79708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007793	GTAAA	2	10	80914	80923	60 %	20 %	20 %	0 %	87161538
68	NC_007793	TATGA	2	10	81372	81381	40 %	40 %	20 %	0 %	87161538
69	NC_007793	TGATT	2	10	81617	81626	20 %	60 %	20 %	0 %	87161538
70	NC_007793	AAAGT	2	10	88263	88272	60 %	20 %	20 %	0 %	87160733
71	NC_007793	TAGTA	2	10	90984	90993	40 %	40 %	20 %	0 %	87161877
72	NC_007793	TTTTA	2	10	91200	91209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007793	TACTA	2	10	92162	92171	40 %	40 %	0 %	20 %	87160645
74	NC_007793	ATCAA	2	10	94915	94924	60 %	20 %	0 %	20 %	87160960
75	NC_007793	TAATA	2	10	96747	96756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007793	GTGTT	2	10	96830	96839	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007793	ATTTT	2	10	99356	99365	20 %	80 %	0 %	0 %	87160166
78	NC_007793	TATGG	2	10	101368	101377	20 %	40 %	40 %	0 %	87160804
79	NC_007793	TAACT	2	10	101673	101682	40 %	40 %	0 %	20 %	87160804
80	NC_007793	ATTGC	2	10	102945	102954	20 %	40 %	20 %	20 %	87162429
81	NC_007793	AGAAA	2	10	103865	103874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007793	TAAAG	2	10	103906	103915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007793	ATTCA	2	10	104178	104187	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007793	TATAT	2	10	104439	104448	40 %	60 %	0 %	0 %	87161497
85	NC_007793	CTAAA	2	10	106079	106088	60 %	20 %	0 %	20 %	87161985
86	NC_007793	CAAAA	2	10	106110	106119	80 %	0 %	0 %	20 %	87161985
87	NC_007793	TTACC	2	10	109226	109235	20 %	40 %	0 %	40 %	87162123
88	NC_007793	GATAT	2	10	110801	110810	40 %	40 %	20 %	0 %	87161540
89	NC_007793	TACTA	2	10	111337	111346	40 %	40 %	0 %	20 %	87161129
90	NC_007793	TTTAC	2	10	111746	111755	20 %	60 %	0 %	20 %	87161129
91	NC_007793	ATTGC	2	10	114229	114238	20 %	40 %	20 %	20 %	87161751
92	NC_007793	CATGG	2	10	115633	115642	20 %	20 %	40 %	20 %	87161751
93	NC_007793	TGAAA	2	10	116301	116310	60 %	20 %	20 %	0 %	87161414
94	NC_007793	TCAAT	2	10	116673	116682	40 %	40 %	0 %	20 %	87161414
95	NC_007793	GTATT	2	10	117162	117171	20 %	60 %	20 %	0 %	87160979
96	NC_007793	AGATA	2	10	123033	123042	60 %	20 %	20 %	0 %	87161281
97	NC_007793	TAAAA	2	10	123593	123602	80 %	20 %	0 %	0 %	87161281
98	NC_007793	AAAGA	2	10	125226	125235	80 %	0 %	20 %	0 %	87161855
99	NC_007793	GTAAT	2	10	125445	125454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007793	CAATT	2	10	125877	125886	40 %	40 %	0 %	20 %	87160686
101	NC_007793	ATGTT	2	10	126711	126720	20 %	60 %	20 %	0 %	87160277
102	NC_007793	TTGCG	2	10	127282	127291	0 %	40 %	40 %	20 %	87160277
103	NC_007793	AGTTA	2	10	128818	128827	40 %	40 %	20 %	0 %	87161843
104	NC_007793	AGATG	2	10	132191	132200	40 %	20 %	40 %	0 %	87160394
105	NC_007793	GGTGA	2	10	132787	132796	20 %	20 %	60 %	0 %	87160001
106	NC_007793	GAAAA	2	10	136224	136233	80 %	0 %	20 %	0 %	87159979
107	NC_007793	TTATT	2	10	136391	136400	20 %	80 %	0 %	0 %	87159979
108	NC_007793	AATCA	2	10	139413	139422	60 %	20 %	0 %	20 %	87161745
109	NC_007793	GCACG	2	10	139817	139826	20 %	0 %	40 %	40 %	87162288
110	NC_007793	ATTTT	2	10	140111	140120	20 %	80 %	0 %	0 %	87162288
111	NC_007793	ATCAA	2	10	140138	140147	60 %	20 %	0 %	20 %	87162288
112	NC_007793	ATCAC	2	10	141371	141380	40 %	20 %	0 %	40 %	87160266
113	NC_007793	AACGA	2	10	142048	142057	60 %	0 %	20 %	20 %	87160266
114	NC_007793	ACACA	2	10	144104	144113	60 %	0 %	0 %	40 %	87160623
115	NC_007793	GACAA	2	10	145255	145264	60 %	0 %	20 %	20 %	87161161
116	NC_007793	ATTAC	2	10	147896	147905	40 %	40 %	0 %	20 %	87162164
117	NC_007793	ATTTT	2	10	148200	148209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007793	TATCT	2	10	148556	148565	20 %	60 %	0 %	20 %	87162155
119	NC_007793	ATACG	2	10	150989	150998	40 %	20 %	20 %	20 %	87161056
120	NC_007793	TTATA	2	10	151647	151656	40 %	60 %	0 %	0 %	87161321
121	NC_007793	TTTTA	2	10	152445	152454	20 %	80 %	0 %	0 %	87161321
122	NC_007793	GTATT	2	10	152958	152967	20 %	60 %	20 %	0 %	87161267
123	NC_007793	AATAA	2	10	153551	153560	80 %	20 %	0 %	0 %	87161267
124	NC_007793	TACGC	2	10	153818	153827	20 %	20 %	20 %	40 %	87161267
125	NC_007793	GACAA	2	10	155160	155169	60 %	0 %	20 %	20 %	87160939
126	NC_007793	TCCCT	2	10	156626	156635	0 %	40 %	0 %	60 %	87162100
127	NC_007793	GCTTT	2	10	158860	158869	0 %	60 %	20 %	20 %	87160648
128	NC_007793	TAATT	2	10	158945	158954	40 %	60 %	0 %	0 %	87160648
129	NC_007793	ATACT	2	10	160126	160135	40 %	40 %	0 %	20 %	87162049
130	NC_007793	TAATA	2	10	161292	161301	60 %	40 %	0 %	0 %	87160389
131	NC_007793	ATTTT	2	10	162283	162292	20 %	80 %	0 %	0 %	87160558
132	NC_007793	TTGTA	2	10	164507	164516	20 %	60 %	20 %	0 %	87162344
133	NC_007793	TGCAA	2	10	165512	165521	40 %	20 %	20 %	20 %	87162012
134	NC_007793	ATATG	2	10	167530	167539	40 %	40 %	20 %	0 %	87161080
135	NC_007793	AATAT	2	10	168398	168407	60 %	40 %	0 %	0 %	87161927
136	NC_007793	ATTTT	2	10	169787	169796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007793	GATTT	2	10	169841	169850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007793	GGGGC	2	10	170063	170072	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007793	TGGTA	2	10	172691	172700	20 %	40 %	40 %	0 %	87160829
140	NC_007793	CGAAC	2	10	172781	172790	40 %	0 %	20 %	40 %	87160829
141	NC_007793	TTCAA	2	10	174808	174817	40 %	40 %	0 %	20 %	87160118
142	NC_007793	ACATC	2	10	175651	175660	40 %	20 %	0 %	40 %	87160783
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151	NC_007793	AAAGC	2	10	193858	193867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_007793	TCATA	2	10	314472	314481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_007793	TGGCA	2	10	316462	316471	20 %	20 %	40 %	20 %	87160729
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271	NC_007793	CTTTG	2	10	329773	329782	0 %	60 %	20 %	20 %	87160169
272	NC_007793	ATTTA	2	10	330297	330306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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