MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 44405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007793	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007793	GTC	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007793	TAA	2	6	411	416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007793	TTA	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007793	ATT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007793	TAT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
8	NC_007793	CAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
9	NC_007793	TGT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161673
10	NC_007793	TAC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161673
11	NC_007793	GAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
12	NC_007793	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161673
13	NC_007793	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
14	NC_007793	AAC	2	6	852	857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
15	NC_007793	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
16	NC_007793	TCA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161673
17	NC_007793	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161673
18	NC_007793	TTA	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
19	NC_007793	TTA	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
20	NC_007793	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161673
21	NC_007793	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
22	NC_007793	ACC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
23	NC_007793	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
24	NC_007793	TTG	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161673
25	NC_007793	CCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
26	NC_007793	AGA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
27	NC_007793	GAA	3	9	1426	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
28	NC_007793	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
29	NC_007793	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
30	NC_007793	CTG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161673
31	NC_007793	GAA	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
32	NC_007793	TGG	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161673
33	NC_007793	AGA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
34	NC_007793	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
35	NC_007793	CCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007793	CTA	3	9	2115	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007793	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
38	NC_007793	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
39	NC_007793	AAC	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87160973
40	NC_007793	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
41	NC_007793	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160973
42	NC_007793	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
43	NC_007793	AGA	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
44	NC_007793	TCA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160973
45	NC_007793	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
46	NC_007793	TCT	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
47	NC_007793	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
48	NC_007793	ACA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87160973
49	NC_007793	TTA	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
50	NC_007793	GGT	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160973
51	NC_007793	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
52	NC_007793	TGA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
53	NC_007793	GTT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160973
54	NC_007793	TCT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
55	NC_007793	AGA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
56	NC_007793	GGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160973
57	NC_007793	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
58	NC_007793	TTC	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
59	NC_007793	GAC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87160973
60	NC_007793	AAT	2	6	3379	3384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007793	GCA	2	6	3412	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007793	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007793	ATT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160250
64	NC_007793	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160250
65	NC_007793	GTA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160250
66	NC_007793	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160250
67	NC_007793	TGG	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160250
68	NC_007793	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
69	NC_007793	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161857
70	NC_007793	AGA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
71	NC_007793	CTC	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	87161857
72	NC_007793	GAC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161857
73	NC_007793	CTG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161857
74	NC_007793	AAT	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161857
75	NC_007793	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161857
76	NC_007793	AAG	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
77	NC_007793	ATT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
78	NC_007793	GAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
79	NC_007793	ATA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161857
80	NC_007793	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
81	NC_007793	TTA	3	9	4875	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
82	NC_007793	GAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
83	NC_007793	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
84	NC_007793	ACA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161454
85	NC_007793	ATA	2	6	5218	5223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161454
86	NC_007793	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161454
87	NC_007793	TGG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
88	NC_007793	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
89	NC_007793	TCA	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
90	NC_007793	TCA	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
91	NC_007793	AAG	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
92	NC_007793	CAG	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161454
93	NC_007793	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
94	NC_007793	AGA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
95	NC_007793	ATG	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
96	NC_007793	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
97	NC_007793	GAT	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
98	NC_007793	GGT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
99	NC_007793	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
100	NC_007793	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
101	NC_007793	TAT	2	6	6218	6223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
102	NC_007793	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87161454
103	NC_007793	TGC	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161454
104	NC_007793	CGT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161454
105	NC_007793	GAA	2	6	6339	6344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
106	NC_007793	TTA	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
107	NC_007793	TTC	2	6	6627	6632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87161454
108	NC_007793	TAT	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
109	NC_007793	ACA	2	6	6840	6845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161454
110	NC_007793	AGA	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
111	NC_007793	AGG	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007793	TCG	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87160436
113	NC_007793	TTG	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160436
114	NC_007793	GCA	3	9	7383	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87160436
115	NC_007793	TAA	2	6	7448	7453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87160436
116	NC_007793	ATG	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160436
117	NC_007793	TTA	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
118	NC_007793	CCA	2	6	7581	7586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87160436
119	NC_007793	GGA	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87160436
120	NC_007793	CTG	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87160436
121	NC_007793	GAA	2	6	7779	7784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160436
122	NC_007793	TTG	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160436
123	NC_007793	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160436
124	NC_007793	CAT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160436
125	NC_007793	TTA	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
126	NC_007793	AAG	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160436
127	NC_007793	ATT	2	6	8092	8097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
128	NC_007793	GTT	2	6	8115	8120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160436
129	NC_007793	AGA	2	6	8121	8126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160436
130	NC_007793	ATT	2	6	8211	8216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
131	NC_007793	CAA	2	6	8265	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87160436
132	NC_007793	TTA	2	6	8373	8378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
133	NC_007793	TGA	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160436
134	NC_007793	TTA	2	6	8424	8429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160436
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