MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 68939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007793	GCA	2	6	42079	42084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87162304
1003	NC_007793	TTG	2	6	42179	42184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87162304
1004	NC_007793	TGTA	2	8	42192	42199	25 %	50 %	25 %	0 %	87162304
1005	NC_007793	AAG	2	6	42228	42233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_007793	GCTAAA	2	12	42326	42337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87161163
1007	NC_007793	CCA	2	6	42380	42385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161163
1008	NC_007793	A	6	6	42393	42398	100 %	0 %	0 %	0 %	87161163
1009	NC_007793	AGCA	2	8	42420	42427	50 %	0 %	25 %	25 %	87161163
1010	NC_007793	A	7	7	42450	42456	100 %	0 %	0 %	0 %	87161163
1011	NC_007793	A	6	6	42499	42504	100 %	0 %	0 %	0 %	87160780
1012	NC_007793	ATA	2	6	42521	42526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87160780
1013	NC_007793	T	6	6	42538	42543	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1014	NC_007793	T	6	6	42549	42554	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1015	NC_007793	ATT	2	6	42556	42561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160780
1016	NC_007793	CTA	2	6	42576	42581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160780
1017	NC_007793	GACA	2	8	42646	42653	50 %	0 %	25 %	25 %	87160780
1018	NC_007793	T	6	6	42728	42733	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1019	NC_007793	TTC	2	6	42791	42796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160780
1020	NC_007793	ATT	2	6	42797	42802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160780
1021	NC_007793	T	7	7	42801	42807	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1022	NC_007793	GTTT	2	8	42808	42815	0 %	75 %	25 %	0 %	87160780
1023	NC_007793	TTGAA	2	10	42816	42825	40 %	40 %	20 %	0 %	87160780
1024	NC_007793	ATC	2	6	42862	42867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160780
1025	NC_007793	TAT	2	6	42945	42950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160780
1026	NC_007793	T	6	6	43021	43026	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1027	NC_007793	AT	3	6	43133	43138	50 %	50 %	0 %	0 %	87160780
1028	NC_007793	TTGAA	2	10	43162	43171	40 %	40 %	20 %	0 %	87160780
1029	NC_007793	ATC	2	6	43184	43189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160780
1030	NC_007793	TTG	2	6	43245	43250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160780
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1032	NC_007793	CAT	2	6	43323	43328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160780
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1034	NC_007793	T	6	6	43426	43431	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1035	NC_007793	TTG	2	6	43484	43489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160780
1036	NC_007793	TCT	2	6	43547	43552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160780
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1041	NC_007793	AATA	2	8	43780	43787	75 %	25 %	0 %	0 %	87160780
1042	NC_007793	TAA	2	6	43795	43800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87160780
1043	NC_007793	AAG	2	6	43845	43850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160780
1044	NC_007793	CAT	2	6	43873	43878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160780
1045	NC_007793	T	6	6	43899	43904	0 %	100 %	0 %	0 %	87160780
1046	NC_007793	TG	3	6	43931	43936	0 %	50 %	50 %	0 %	87160780
1047	NC_007793	CAT	2	6	43960	43965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_007793	CAC	2	6	43986	43991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_007793	TCG	2	6	44006	44011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_007793	CAA	2	6	44034	44039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_007793	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_007793	TGA	2	6	44172	44177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161958
1053	NC_007793	T	6	6	44180	44185	0 %	100 %	0 %	0 %	87161958
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1059	NC_007793	CTTT	2	8	44511	44518	0 %	75 %	0 %	25 %	87161958
1060	NC_007793	TCA	2	6	44555	44560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161958
1061	NC_007793	TG	3	6	44578	44583	0 %	50 %	50 %	0 %	87161958
1062	NC_007793	TCA	2	6	44604	44609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161958
1063	NC_007793	TTC	2	6	44628	44633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007793	ATA	2	6	44649	44654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007793	T	7	7	44713	44719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007793	GTT	2	6	44756	44761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_007793	T	8	8	44844	44851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_007793	GATT	2	8	44921	44928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_007793	TCCC	2	8	44940	44947	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1072	NC_007793	ATG	2	6	44963	44968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007793	GAT	2	6	44971	44976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_007793	TGA	2	6	45133	45138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_007793	TCA	2	6	45189	45194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_007793	TAG	2	6	45198	45203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_007793	TCC	2	6	45279	45284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_007793	TTA	2	6	45309	45314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_007793	ATT	2	6	45371	45376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_007793	TGA	2	6	45574	45579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_007793	TA	4	8	45602	45609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_007793	TTAT	3	12	45610	45621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_007793	A	6	6	45759	45764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007793	ATT	2	6	45864	45869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1103	NC_007793	TAT	2	6	45963	45968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160426
1104	NC_007793	GTT	2	6	45975	45980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160426
1105	NC_007793	TTA	2	6	45992	45997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160426
1106	NC_007793	T	6	6	46021	46026	0 %	100 %	0 %	0 %	87160426
1107	NC_007793	T	6	6	46039	46044	0 %	100 %	0 %	0 %	87160426
1108	NC_007793	ATCA	2	8	46057	46064	50 %	25 %	0 %	25 %	87160426
1109	NC_007793	GATA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	25 %	0 %	87160426
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1112	NC_007793	GTTG	2	8	46191	46198	0 %	50 %	50 %	0 %	87160426
1113	NC_007793	TTAT	2	8	46298	46305	25 %	75 %	0 %	0 %	87160426
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1116	NC_007793	TGA	2	6	46352	46357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160426
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1119	NC_007793	TAC	2	6	46399	46404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160426
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1131	NC_007793	TTA	2	6	47105	47110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160426
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