MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	TTAAAC	2	12	1624	1635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87159858
2	NC_007792	TTAAAC	2	12	6179	6190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87159860
3	NC_007792	CAAAAA	2	12	7056	7067	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	87159864
4	NC_007792	CCTAAA	2	12	8357	8368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	87159879
5	NC_007792	TTAAAC	2	12	9341	9352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87159872
6	NC_007792	ACAGCA	2	12	10546	10557	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87159868
7	NC_007792	CTGTTT	2	12	10856	10867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	87159868
8	NC_007792	AAAATA	2	12	11829	11840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	87159853
9	NC_007792	AGCAAG	2	12	12527	12538	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	87159848
10	NC_007792	ATGTAT	2	12	12943	12954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87159848
11	NC_007792	ACAGCA	2	12	13135	13146	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87159848
12	NC_007792	ACCTAA	2	12	14906	14917	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	87159857
13	NC_007792	AAAAGA	2	12	15014	15025	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87159857
14	NC_007792	CAACAG	2	12	16017	16028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87159855
15	NC_007792	AAGGTA	2	12	16104	16115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	87159855
16	NC_007792	GCTGGC	2	12	16706	16717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	87159855
17	NC_007792	TGATTT	2	12	20697	20708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	87159851
18	NC_007792	AAAACA	2	12	21612	21623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	87159851
19	NC_007792	TTAAAC	2	12	23744	23755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87159874
20	NC_007792	ATAGAT	2	12	25395	25406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87159862
21	NC_007792	AGTAAA	2	12	25725	25736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87159862
22	NC_007792	AAAAGC	2	12	28008	28019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	87159877
23	NC_007792	GATTTA	2	12	28414	28425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87159877
24	NC_007792	TTATAT	2	12	29278	29289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159865
25	NC_007792	TTAAAA	2	12	31984	31995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159876
26	NC_007792	ATTAAA	2	12	32254	32265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007792	TAATAT	2	12	34632	34643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007792	AATTGA	2	12	35645	35656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87159871

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.