MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007791	TAC	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159845
2	NC_007791	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159845
3	NC_007791	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
4	NC_007791	CTG	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87159845
5	NC_007791	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159845
6	NC_007791	AAT	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159845
7	NC_007791	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
8	NC_007791	CAA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159845
9	NC_007791	TAT	2	6	665	670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
10	NC_007791	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
11	NC_007791	TTA	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
12	NC_007791	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159845
13	NC_007791	TAG	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159845
14	NC_007791	ATG	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159845
15	NC_007791	TGG	2	6	971	976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159845
16	NC_007791	ATT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
17	NC_007791	ACT	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159845
18	NC_007791	AGT	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159845
19	NC_007791	GAA	3	9	1170	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159845
20	NC_007791	AGG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87159845
21	NC_007791	ATT	2	6	1303	1308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
22	NC_007791	TTA	2	6	1351	1356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
23	NC_007791	TGT	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159845
24	NC_007791	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159845
25	NC_007791	TTA	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007791	ATA	2	6	1683	1688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159846
27	NC_007791	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159846
28	NC_007791	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159846
29	NC_007791	AGA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159846
30	NC_007791	TAT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159846
31	NC_007791	CAC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87159846
32	NC_007791	GTT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159846
33	NC_007791	TGA	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159846
34	NC_007791	AAG	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159846
35	NC_007791	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159846
36	NC_007791	AAC	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159846
37	NC_007791	GGT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159846
38	NC_007791	TGT	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159846
39	NC_007791	GCT	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87159846
40	NC_007791	GAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159846
41	NC_007791	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159846
42	NC_007791	TTA	2	6	2528	2533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159846
43	NC_007791	GAA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159846
44	NC_007791	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159846
45	NC_007791	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159846
46	NC_007791	CAA	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159846
47	NC_007791	AAC	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159846
48	NC_007791	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007791	GAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007791	TAG	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007791	ATA	2	6	3109	3114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007791	TAA	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007791	CAT	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007791	TTC	2	6	3598	3603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159844
55	NC_007791	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159844
56	NC_007791	GAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159844
57	NC_007791	ACT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159844
58	NC_007791	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159844
59	NC_007791	TAA	2	6	3941	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159844
60	NC_007791	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159844
61	NC_007791	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159844
62	NC_007791	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159844
63	NC_007791	AGG	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007791	AAT	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.