MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 3180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007775	GT	3	6	62	67	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007775	CG	3	6	2968	2973	0 %	0 %	50 %	50 %	86604736
3	NC_007775	AG	4	8	3135	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	86604736
4	NC_007775	AG	3	6	3144	3149	50 %	0 %	50 %	0 %	86604736
5	NC_007775	AG	3	6	4447	4452	50 %	0 %	50 %	0 %	86604737
6	NC_007775	CT	3	6	6151	6156	0 %	50 %	0 %	50 %	86604739
7	NC_007775	CT	3	6	7007	7012	0 %	50 %	0 %	50 %	86604740
8	NC_007775	GA	3	6	7176	7181	50 %	0 %	50 %	0 %	86604741
9	NC_007775	GA	3	6	8081	8086	50 %	0 %	50 %	0 %	86604741
10	NC_007775	TG	3	6	9163	9168	0 %	50 %	50 %	0 %	86604741
11	NC_007775	CG	4	8	9357	9364	0 %	0 %	50 %	50 %	86604741
12	NC_007775	TC	3	6	9967	9972	0 %	50 %	0 %	50 %	86604742
13	NC_007775	TC	3	6	10030	10035	0 %	50 %	0 %	50 %	86604742
14	NC_007775	TG	3	6	10040	10045	0 %	50 %	50 %	0 %	86604742
15	NC_007775	TC	4	8	11666	11673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007775	AG	4	8	11723	11730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007775	CA	3	6	11899	11904	50 %	0 %	0 %	50 %	86604744
18	NC_007775	GA	3	6	12592	12597	50 %	0 %	50 %	0 %	86604744
19	NC_007775	TC	3	6	13066	13071	0 %	50 %	0 %	50 %	86604744
20	NC_007775	TC	3	6	13383	13388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007775	CA	3	6	13628	13633	50 %	0 %	0 %	50 %	86604745
22	NC_007775	CT	3	6	13853	13858	0 %	50 %	0 %	50 %	86604745
23	NC_007775	AC	3	6	14130	14135	50 %	0 %	0 %	50 %	86604745
24	NC_007775	GA	3	6	14146	14151	50 %	0 %	50 %	0 %	86604745
25	NC_007775	CT	3	6	14264	14269	0 %	50 %	0 %	50 %	86604746
26	NC_007775	AG	3	6	15660	15665	50 %	0 %	50 %	0 %	86604748
27	NC_007775	GC	3	6	16170	16175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007775	GA	3	6	16655	16660	50 %	0 %	50 %	0 %	86604749
29	NC_007775	CT	4	8	17136	17143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007775	TC	3	6	17247	17252	0 %	50 %	0 %	50 %	86604750
31	NC_007775	CT	3	6	17496	17501	0 %	50 %	0 %	50 %	86604750
32	NC_007775	CA	3	6	18279	18284	50 %	0 %	0 %	50 %	86604751
33	NC_007775	GC	3	6	20504	20509	0 %	0 %	50 %	50 %	86604754
34	NC_007775	CA	3	6	21020	21025	50 %	0 %	0 %	50 %	86604755
35	NC_007775	GA	3	6	21422	21427	50 %	0 %	50 %	0 %	86604755
36	NC_007775	GA	3	6	22901	22906	50 %	0 %	50 %	0 %	86604757
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40	NC_007775	GC	3	6	29955	29960	0 %	0 %	50 %	50 %	86604763
41	NC_007775	CT	4	8	30632	30639	0 %	50 %	0 %	50 %	86604764
42	NC_007775	GC	3	6	30674	30679	0 %	0 %	50 %	50 %	86604764
43	NC_007775	GT	3	6	30707	30712	0 %	50 %	50 %	0 %	86604764
44	NC_007775	CG	3	6	33272	33277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007775	TC	3	6	33659	33664	0 %	50 %	0 %	50 %	86604767
46	NC_007775	GA	3	6	34546	34551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007775	CT	3	6	37887	37892	0 %	50 %	0 %	50 %	86604772
48	NC_007775	TC	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007775	TC	3	6	40350	40355	0 %	50 %	0 %	50 %	86604774
50	NC_007775	GA	3	6	40548	40553	50 %	0 %	50 %	0 %	86604774
51	NC_007775	AC	3	6	41011	41016	50 %	0 %	0 %	50 %	86604774
52	NC_007775	GC	3	6	44151	44156	0 %	0 %	50 %	50 %	86604777
53	NC_007775	CT	3	6	44604	44609	0 %	50 %	0 %	50 %	86604777
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58	NC_007775	AG	4	8	45810	45817	50 %	0 %	50 %	0 %	86604778
59	NC_007775	TC	3	6	46748	46753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007775	CT	3	6	46926	46931	0 %	50 %	0 %	50 %	86604780
61	NC_007775	CG	3	6	47165	47170	0 %	0 %	50 %	50 %	86604780
62	NC_007775	AG	3	6	47861	47866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007775	GC	3	6	48422	48427	0 %	0 %	50 %	50 %	86604781
64	NC_007775	GA	3	6	48720	48725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007775	AG	3	6	50300	50305	50 %	0 %	50 %	0 %	86604783
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67	NC_007775	TC	3	6	52653	52658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007775	AG	3	6	52998	53003	50 %	0 %	50 %	0 %	86604787
69	NC_007775	AG	3	6	57007	57012	50 %	0 %	50 %	0 %	86604788
70	NC_007775	GC	3	6	57490	57495	0 %	0 %	50 %	50 %	86604789
71	NC_007775	GC	3	6	58464	58469	0 %	0 %	50 %	50 %	86604790
72	NC_007775	GA	3	6	59725	59730	50 %	0 %	50 %	0 %	86604792
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79	NC_007775	AG	3	6	64097	64102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007775	AT	3	6	65464	65469	50 %	50 %	0 %	0 %	86604799
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107	NC_007775	CT	3	6	91403	91408	0 %	50 %	0 %	50 %	86604824
108	NC_007775	GC	3	6	93062	93067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007775	GC	3	6	93502	93507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007775	CT	3	6	93549	93554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007775	CG	3	6	94654	94659	0 %	0 %	50 %	50 %	86604827
112	NC_007775	AG	3	6	95182	95187	50 %	0 %	50 %	0 %	86604827
113	NC_007775	CT	3	6	96273	96278	0 %	50 %	0 %	50 %	86604829
114	NC_007775	GA	3	6	96899	96904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007775	TC	4	8	98835	98842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007775	CT	3	6	99272	99277	0 %	50 %	0 %	50 %	86604833
117	NC_007775	TC	3	6	99633	99638	0 %	50 %	0 %	50 %	86604833
118	NC_007775	TG	3	6	100066	100071	0 %	50 %	50 %	0 %	86604833
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123	NC_007775	GA	3	6	103852	103857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007775	AG	3	6	103976	103981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_007775	TC	3	6	105973	105978	0 %	50 %	0 %	50 %	86604840
127	NC_007775	AG	3	6	106631	106636	50 %	0 %	50 %	0 %	86604841
128	NC_007775	AG	3	6	107890	107895	50 %	0 %	50 %	0 %	86604843
129	NC_007775	AG	3	6	109432	109437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_007775	AG	3	6	114078	114083	50 %	0 %	50 %	0 %	86604848
133	NC_007775	GA	3	6	114407	114412	50 %	0 %	50 %	0 %	86604848
134	NC_007775	AG	3	6	114625	114630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007775	GA	3	6	114655	114660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007775	TC	3	6	115793	115798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_007775	GA	3	6	117092	117097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_007775	TC	3	6	122074	122079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_007775	GA	5	10	127863	127872	50 %	0 %	50 %	0 %	86604862
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