MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007775	CTT	2	6	159034	159039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007775	TCTG	2	8	159103	159110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_007775	ATC	2	6	159112	159117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_007775	AAAGTT	2	12	159174	159185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_007775	GCG	2	6	159193	159198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_007775	TGGG	2	8	159256	159263	0 %	25 %	75 %	0 %	86604892
3507	NC_007775	TGG	2	6	159266	159271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604892
3508	NC_007775	GTG	2	6	159280	159285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604892
3509	NC_007775	CAGC	2	8	159355	159362	25 %	0 %	25 %	50 %	86604892
3510	NC_007775	AGC	2	6	159368	159373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604892
3511	NC_007775	GCC	2	6	159459	159464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604892
3512	NC_007775	GTT	2	6	159498	159503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604892
3513	NC_007775	CGC	2	6	159557	159562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604892
3514	NC_007775	AGG	2	6	159563	159568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604892
3515	NC_007775	CCA	2	6	159672	159677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604892
3516	NC_007775	GATC	2	8	159765	159772	25 %	25 %	25 %	25 %	86604892
3517	NC_007775	CGC	2	6	159784	159789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604892
3518	NC_007775	CCA	2	6	159794	159799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604892
3519	NC_007775	CAA	2	6	159810	159815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604892
3520	NC_007775	CGG	2	6	159837	159842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604892
3521	NC_007775	CT	3	6	159883	159888	0 %	50 %	0 %	50 %	86604892
3522	NC_007775	GGA	2	6	159909	159914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604892
3523	NC_007775	C	6	6	159953	159958	0 %	0 %	0 %	100 %	86604892
3524	NC_007775	GCA	2	6	159959	159964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604892
3525	NC_007775	AGA	2	6	160087	160092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604893
3526	NC_007775	CTT	2	6	160138	160143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604893
3527	NC_007775	C	7	7	160199	160205	0 %	0 %	0 %	100 %	86604893
3528	NC_007775	CTG	2	6	160220	160225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3529	NC_007775	AGG	2	6	160227	160232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604893
3530	NC_007775	ATGCTG	2	12	160277	160288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86604893
3531	NC_007775	AG	3	6	160309	160314	50 %	0 %	50 %	0 %	86604893
3532	NC_007775	GAC	2	6	160346	160351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3533	NC_007775	CTG	2	6	160368	160373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3534	NC_007775	GAC	2	6	160475	160480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3535	NC_007775	TCTGGA	2	12	160537	160548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86604893
3536	NC_007775	GCA	2	6	160563	160568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3537	NC_007775	CAT	2	6	160630	160635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604893
3538	NC_007775	GCG	2	6	160646	160651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3539	NC_007775	GGC	2	6	160693	160698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3540	NC_007775	AGGC	2	8	160709	160716	25 %	0 %	50 %	25 %	86604893
3541	NC_007775	CAC	2	6	160717	160722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604893
3542	NC_007775	CGG	2	6	160790	160795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3543	NC_007775	GGA	2	6	160849	160854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604893
3544	NC_007775	A	6	6	160995	161000	100 %	0 %	0 %	0 %	86604893
3545	NC_007775	CAA	2	6	161005	161010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604893
3546	NC_007775	CGA	2	6	161050	161055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3547	NC_007775	GGC	2	6	161179	161184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3548	NC_007775	TCA	2	6	161190	161195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604893
3549	NC_007775	CGC	2	6	161198	161203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604893
3550	NC_007775	GCA	2	6	161221	161226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3551	NC_007775	GGC	2	6	161320	161325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604893
3552	NC_007775	GCT	2	6	161380	161385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3553	NC_007775	GGT	2	6	161386	161391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604893
3554	NC_007775	CAG	2	6	161549	161554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604893
3555	NC_007775	GGT	3	9	161587	161595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604893
3556	NC_007775	GCC	2	6	161657	161662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604893
3557	NC_007775	AGG	2	6	161697	161702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604893
3558	NC_007775	AGGG	2	8	161715	161722	25 %	0 %	75 %	0 %	86604893
3559	NC_007775	TCA	2	6	161739	161744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604894
3560	NC_007775	GCA	2	6	161748	161753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3561	NC_007775	GCG	2	6	161766	161771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3562	NC_007775	ATC	2	6	161780	161785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604894
3563	NC_007775	ACC	2	6	161810	161815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3564	NC_007775	GAG	2	6	161848	161853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604894
3565	NC_007775	ACC	2	6	161870	161875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3566	NC_007775	GCG	2	6	161887	161892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3567	NC_007775	TCC	2	6	161933	161938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604894
3568	NC_007775	GTC	2	6	161940	161945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3569	NC_007775	GTG	2	6	162028	162033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604894
3570	NC_007775	GCG	2	6	162035	162040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3571	NC_007775	CCA	2	6	162045	162050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3572	NC_007775	TAG	2	6	162068	162073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3573	NC_007775	CGG	2	6	162074	162079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3574	NC_007775	AAGGT	2	10	162122	162131	40 %	20 %	40 %	0 %	86604894
3575	NC_007775	GCC	2	6	162133	162138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3576	NC_007775	GTA	2	6	162148	162153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
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3578	NC_007775	TGGCCT	2	12	162198	162209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3579	NC_007775	ACC	2	6	162230	162235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3580	NC_007775	GGGCAG	2	12	162250	162261	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	86604894
3581	NC_007775	TGG	2	6	162308	162313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604894
3582	NC_007775	CCA	2	6	162327	162332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3583	NC_007775	AGT	2	6	162354	162359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
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3585	NC_007775	ACC	2	6	162422	162427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604894
3586	NC_007775	GGC	2	6	162433	162438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3587	NC_007775	CGG	3	9	162443	162451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604894
3588	NC_007775	CTG	2	6	162568	162573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3589	NC_007775	CGC	2	6	162588	162593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3590	NC_007775	TCC	2	6	162620	162625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604894
3591	NC_007775	GCGTCG	2	12	162650	162661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86604894
3592	NC_007775	GCC	3	9	162862	162870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604894
3593	NC_007775	GAT	2	6	162874	162879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604894
3594	NC_007775	CGT	2	6	162882	162887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604894
3595	NC_007775	ACT	2	6	162955	162960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604895
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3603	NC_007775	GTC	2	6	163326	163331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3604	NC_007775	CCA	3	9	163349	163357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604895
3605	NC_007775	GCC	2	6	163362	163367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604895
3606	NC_007775	GCA	2	6	163382	163387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3607	NC_007775	GACCA	2	10	163438	163447	40 %	0 %	20 %	40 %	86604895
3608	NC_007775	G	8	8	163515	163522	0 %	0 %	100 %	0 %	86604895
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3611	NC_007775	CGT	2	6	163641	163646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604895
3612	NC_007775	GCCC	2	8	163667	163674	0 %	0 %	25 %	75 %	86604895
3613	NC_007775	TTC	2	6	163720	163725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604895
3614	NC_007775	CGC	2	6	163726	163731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604895
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3617	NC_007775	A	6	6	163901	163906	100 %	0 %	0 %	0 %	86604895
3618	NC_007775	TGA	2	6	163959	163964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_007775	TTG	2	6	163965	163970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_007775	GGC	2	6	164068	164073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007775	GGA	2	6	164105	164110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3997	NC_007775	TGA	2	6	181853	181858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604907
3998	NC_007775	GA	3	6	181866	181871	50 %	0 %	50 %	0 %	86604907
3999	NC_007775	TCGA	2	8	182045	182052	25 %	25 %	25 %	25 %	86604908
4000	NC_007775	CTG	2	6	182068	182073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604908

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