MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007775	CAG	3	9	66384	66392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604800
1502	NC_007775	GCA	2	6	66403	66408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604800
1503	NC_007775	GCT	2	6	66426	66431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604800
1504	NC_007775	TGG	2	6	66466	66471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604800
1505	NC_007775	TGG	2	6	66514	66519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604800
1506	NC_007775	CAG	2	6	66590	66595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604800
1507	NC_007775	CCG	2	6	66655	66660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604800
1508	NC_007775	CGA	2	6	66665	66670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604800
1509	NC_007775	CGGAT	2	10	66695	66704	20 %	20 %	40 %	20 %	86604800
1510	NC_007775	CTTG	2	8	66732	66739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_007775	TGT	2	6	66740	66745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007775	CGC	2	6	66868	66873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604801
1513	NC_007775	CAG	2	6	66888	66893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604801
1514	NC_007775	ACC	2	6	66930	66935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604801
1515	NC_007775	GCG	2	6	67012	67017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604801
1516	NC_007775	TCCG	2	8	67051	67058	0 %	25 %	25 %	50 %	86604801
1517	NC_007775	ATTTT	2	10	67063	67072	20 %	80 %	0 %	0 %	86604801
1518	NC_007775	CT	3	6	67158	67163	0 %	50 %	0 %	50 %	86604801
1519	NC_007775	CTG	2	6	67251	67256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604801
1520	NC_007775	GGGA	2	8	67259	67266	25 %	0 %	75 %	0 %	86604801
1521	NC_007775	TGG	2	6	67273	67278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604801
1522	NC_007775	AGC	2	6	67348	67353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604801
1523	NC_007775	CTG	2	6	67383	67388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604801
1524	NC_007775	TCC	2	6	67424	67429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604801
1525	NC_007775	GCG	2	6	67470	67475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604801
1526	NC_007775	CTG	2	6	67482	67487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604801
1527	NC_007775	CGC	2	6	67521	67526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604801
1528	NC_007775	CTC	2	6	67534	67539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604801
1529	NC_007775	GCC	2	6	67559	67564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604801
1530	NC_007775	AG	3	6	67613	67618	50 %	0 %	50 %	0 %	86604801
1531	NC_007775	GAG	2	6	67663	67668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007775	CAGA	2	8	67679	67686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_007775	GCC	2	6	67761	67766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_007775	AGC	2	6	67778	67783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_007775	TGC	2	6	67804	67809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_007775	TC	3	6	67843	67848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_007775	CAA	2	6	68022	68027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_007775	ACG	2	6	68074	68079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_007775	AGA	2	6	68102	68107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_007775	GGT	2	6	68108	68113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_007775	CAG	3	9	68163	68171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_007775	CCA	2	6	68188	68193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_007775	CTT	2	6	68194	68199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_007775	GCCA	2	8	68242	68249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_007775	GAT	2	6	68261	68266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_007775	C	7	7	68285	68291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1547	NC_007775	C	6	6	68318	68323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1548	NC_007775	ATG	2	6	68337	68342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_007775	GCAGG	2	10	68391	68400	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_007775	CTG	2	6	68545	68550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_007775	GAG	2	6	68576	68581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007775	TGT	2	6	68605	68610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604802
1553	NC_007775	GCC	2	6	68636	68641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604802
1554	NC_007775	TTTG	2	8	68674	68681	0 %	75 %	25 %	0 %	86604802
1555	NC_007775	GAG	2	6	68756	68761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604802
1556	NC_007775	AAGATG	2	12	68783	68794	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	86604802
1557	NC_007775	GCC	2	6	68859	68864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604802
1558	NC_007775	CTT	2	6	68881	68886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604802
1559	NC_007775	GAC	2	6	69143	69148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604802
1560	NC_007775	CTA	2	6	69157	69162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604802
1561	NC_007775	GAG	2	6	69164	69169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604802
1562	NC_007775	GGCACC	2	12	69251	69262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86604802
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1564	NC_007775	CCGCGC	2	12	69307	69318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604802
1565	NC_007775	GGC	2	6	69335	69340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604802
1566	NC_007775	TCCGCG	2	12	69379	69390	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	86604802
1567	NC_007775	GTG	2	6	69395	69400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604802
1568	NC_007775	TGG	2	6	69414	69419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604802
1569	NC_007775	GCG	2	6	69450	69455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604802
1570	NC_007775	GCC	2	6	69470	69475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604802
1571	NC_007775	TCG	2	6	69504	69509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604802
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1584	NC_007775	CAG	2	6	70102	70107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604803
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1588	NC_007775	TTGG	2	8	70223	70230	0 %	50 %	50 %	0 %	86604803
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1591	NC_007775	CTT	2	6	70321	70326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604803
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1593	NC_007775	GCTC	2	8	70422	70429	0 %	25 %	25 %	50 %	86604803
1594	NC_007775	TCC	2	6	70443	70448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604803
1595	NC_007775	TGGTGA	2	12	70492	70503	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	86604803
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1599	NC_007775	CTG	2	6	70724	70729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_007775	TAGCC	2	10	70744	70753	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1601	NC_007775	CTCGG	2	10	70816	70825	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1602	NC_007775	TCT	2	6	70840	70845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_007775	GCA	2	6	70867	70872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_007775	CTGCCG	2	12	70901	70912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_007775	CAG	2	6	71014	71019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_007775	CAG	2	6	71243	71248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604804
1609	NC_007775	TGCCC	2	10	71407	71416	0 %	20 %	20 %	60 %	86604804
1610	NC_007775	GA	3	6	71430	71435	50 %	0 %	50 %	0 %	86604804
1611	NC_007775	CGG	2	6	71439	71444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604804
1612	NC_007775	GGA	2	6	71446	71451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604804
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1614	NC_007775	C	6	6	71517	71522	0 %	0 %	0 %	100 %	86604804
1615	NC_007775	GAC	2	6	71639	71644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604804
1616	NC_007775	GC	3	6	71655	71660	0 %	0 %	50 %	50 %	86604804
1617	NC_007775	CGG	2	6	71698	71703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604804
1618	NC_007775	CGG	2	6	71706	71711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604804
1619	NC_007775	AG	3	6	71833	71838	50 %	0 %	50 %	0 %	86604804
1620	NC_007775	TGG	2	6	71895	71900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604804
1621	NC_007775	CTA	2	6	71902	71907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604804
1622	NC_007775	TTG	2	6	71922	71927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604804
1623	NC_007775	CTC	2	6	71939	71944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604804
1624	NC_007775	CTG	2	6	71978	71983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604804
1625	NC_007775	CAG	2	6	72139	72144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604804
1626	NC_007775	CAC	2	6	72163	72168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604804
1627	NC_007775	CTGG	2	8	72193	72200	0 %	25 %	50 %	25 %	86604804
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