MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007775	CTTGC	2	10	43441	43450	0 %	40 %	20 %	40 %	86604776
1003	NC_007775	AGG	2	6	43541	43546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604776
1004	NC_007775	TGG	2	6	43581	43586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604776
1005	NC_007775	GCT	3	9	43704	43712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604776
1006	NC_007775	TCT	2	6	43732	43737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604776
1007	NC_007775	AGC	2	6	43787	43792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604776
1008	NC_007775	TGAGA	2	10	43856	43865	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007775	GCG	2	6	44002	44007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604777
1010	NC_007775	GCT	2	6	44041	44046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604777
1011	NC_007775	TTC	2	6	44075	44080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604777
1012	NC_007775	GAT	2	6	44110	44115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604777
1013	NC_007775	CTC	2	6	44126	44131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604777
1014	NC_007775	GC	3	6	44151	44156	0 %	0 %	50 %	50 %	86604777
1015	NC_007775	AGC	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604777
1016	NC_007775	TGG	2	6	44184	44189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604777
1017	NC_007775	AGC	2	6	44202	44207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604777
1018	NC_007775	CCT	2	6	44275	44280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604777
1019	NC_007775	GGA	2	6	44377	44382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604777
1020	NC_007775	TGG	2	6	44435	44440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604777
1021	NC_007775	G	6	6	44439	44444	0 %	0 %	100 %	0 %	86604777
1022	NC_007775	TGT	2	6	44506	44511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604777
1023	NC_007775	CAT	2	6	44563	44568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604777
1024	NC_007775	CT	3	6	44604	44609	0 %	50 %	0 %	50 %	86604777
1025	NC_007775	GCA	2	6	44692	44697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604777
1026	NC_007775	GCAAGC	2	12	44701	44712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604777
1027	NC_007775	C	6	6	44747	44752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1028	NC_007775	TCCC	2	8	44801	44808	0 %	25 %	0 %	75 %	86604778
1029	NC_007775	C	6	6	44806	44811	0 %	0 %	0 %	100 %	86604778
1030	NC_007775	CGG	2	6	44837	44842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604778
1031	NC_007775	CGG	2	6	44927	44932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604778
1032	NC_007775	CTT	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604778
1033	NC_007775	CAC	3	9	45048	45056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604778
1034	NC_007775	GCGG	2	8	45092	45099	0 %	0 %	75 %	25 %	86604778
1035	NC_007775	GTG	2	6	45141	45146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604778
1036	NC_007775	GC	3	6	45303	45308	0 %	0 %	50 %	50 %	86604778
1037	NC_007775	CCGC	2	8	45422	45429	0 %	0 %	25 %	75 %	86604778
1038	NC_007775	CG	3	6	45469	45474	0 %	0 %	50 %	50 %	86604778
1039	NC_007775	GA	3	6	45494	45499	50 %	0 %	50 %	0 %	86604778
1040	NC_007775	TTG	2	6	45550	45555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604778
1041	NC_007775	CCA	2	6	45599	45604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604778
1042	NC_007775	TGG	2	6	45652	45657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604778
1043	NC_007775	GGC	3	9	45681	45689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604778
1044	NC_007775	CCA	2	6	45692	45697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604778
1045	NC_007775	GCA	2	6	45708	45713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604778
1046	NC_007775	AG	3	6	45737	45742	50 %	0 %	50 %	0 %	86604778
1047	NC_007775	GCC	2	6	45781	45786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604778
1048	NC_007775	C	7	7	45803	45809	0 %	0 %	0 %	100 %	86604778
1049	NC_007775	AG	4	8	45810	45817	50 %	0 %	50 %	0 %	86604778
1050	NC_007775	GCAGA	2	10	45892	45901	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_007775	AGCTT	2	10	45986	45995	20 %	40 %	20 %	20 %	86604779
1052	NC_007775	GCC	2	6	46048	46053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604779
1053	NC_007775	GCC	2	6	46068	46073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604779
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1056	NC_007775	TGC	2	6	46260	46265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1057	NC_007775	AGC	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1058	NC_007775	GCA	2	6	46294	46299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1059	NC_007775	CGT	2	6	46303	46308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1060	NC_007775	CGG	2	6	46342	46347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604779
1061	NC_007775	GCAC	2	8	46386	46393	25 %	0 %	25 %	50 %	86604779
1062	NC_007775	CAG	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1063	NC_007775	CGTC	2	8	46507	46514	0 %	25 %	25 %	50 %	86604779
1064	NC_007775	TCG	3	9	46563	46571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604779
1065	NC_007775	CCA	2	6	46633	46638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604779
1066	NC_007775	TCC	2	6	46680	46685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604779
1067	NC_007775	TC	3	6	46748	46753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_007775	TTG	2	6	46858	46863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007775	A	6	6	46867	46872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_007775	CT	3	6	46926	46931	0 %	50 %	0 %	50 %	86604780
1071	NC_007775	GGT	2	6	46935	46940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604780
1072	NC_007775	TTG	2	6	46993	46998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604780
1073	NC_007775	TCT	2	6	47035	47040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604780
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1080	NC_007775	CCCT	2	8	47347	47354	0 %	25 %	0 %	75 %	86604780
1081	NC_007775	GCC	2	6	47371	47376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604780
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1085	NC_007775	TGG	2	6	47538	47543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604780
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1088	NC_007775	GAT	2	6	47628	47633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604780
1089	NC_007775	TGG	2	6	47640	47645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604780
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1091	NC_007775	AGG	2	6	47769	47774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604780
1092	NC_007775	CGT	2	6	47781	47786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604780
1093	NC_007775	AG	3	6	47861	47866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_007775	CCCTCT	2	12	47931	47942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_007775	G	6	6	47963	47968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_007775	TGG	2	6	48095	48100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604781
1098	NC_007775	T	7	7	48107	48113	0 %	100 %	0 %	0 %	86604781
1099	NC_007775	TCCT	2	8	48139	48146	0 %	50 %	0 %	50 %	86604781
1100	NC_007775	ATG	2	6	48191	48196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604781
1101	NC_007775	ATC	2	6	48205	48210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604781
1102	NC_007775	GCTC	2	8	48225	48232	0 %	25 %	25 %	50 %	86604781
1103	NC_007775	GCA	2	6	48296	48301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604781
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1105	NC_007775	GC	3	6	48422	48427	0 %	0 %	50 %	50 %	86604781
1106	NC_007775	GCA	2	6	48434	48439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604781
1107	NC_007775	TCT	2	6	48440	48445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604781
1108	NC_007775	CTT	2	6	48447	48452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604781
1109	NC_007775	GTT	2	6	48493	48498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604781
1110	NC_007775	ACC	3	9	48500	48508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604781
1111	NC_007775	CTT	2	6	48531	48536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604781
1112	NC_007775	TGC	2	6	48619	48624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_007775	CAATC	2	10	48675	48684	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_007775	ATTGA	2	10	48702	48711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_007775	GA	3	6	48720	48725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_007775	CAA	2	6	48729	48734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_007775	AAGC	2	8	48806	48813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_007775	TGGC	2	8	48825	48832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_007775	CAG	2	6	48851	48856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_007775	TCAGC	2	10	48930	48939	20 %	20 %	20 %	40 %	86604782
1121	NC_007775	CGG	2	6	48998	49003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604782
1122	NC_007775	CCCAG	2	10	49019	49028	20 %	0 %	20 %	60 %	86604782
1123	NC_007775	TGGC	2	8	49040	49047	0 %	25 %	50 %	25 %	86604782
1124	NC_007775	GAA	2	6	49058	49063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604782
1125	NC_007775	GAG	2	6	49169	49174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604782
1126	NC_007775	AGC	2	6	49179	49184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604782
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1128	NC_007775	CAA	2	6	49367	49372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604782
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1130	NC_007775	GCA	2	6	49429	49434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604782
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