MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007775	AAGTA	2	10	22323	22332	60 %	20 %	20 %	0 %	86604757
502	NC_007775	CAG	2	6	22345	22350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604757
503	NC_007775	C	6	6	22381	22386	0 %	0 %	0 %	100 %	86604757
504	NC_007775	GGC	2	6	22430	22435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604757
505	NC_007775	CCA	2	6	22440	22445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604757
506	NC_007775	ACC	3	9	22469	22477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604757
507	NC_007775	GGC	2	6	22561	22566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604757
508	NC_007775	CTT	2	6	22576	22581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604757
509	NC_007775	AGC	2	6	22589	22594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604757
510	NC_007775	CCT	2	6	22614	22619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604757
511	NC_007775	AGC	2	6	22857	22862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604757
512	NC_007775	CAC	2	6	22864	22869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604757
513	NC_007775	GA	3	6	22901	22906	50 %	0 %	50 %	0 %	86604757
514	NC_007775	CCA	2	6	22944	22949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604757
515	NC_007775	CAA	2	6	22962	22967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604757
516	NC_007775	GCC	2	6	22991	22996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604757
517	NC_007775	GCC	2	6	23087	23092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604757
518	NC_007775	CAA	2	6	23154	23159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604757
519	NC_007775	GAA	2	6	23186	23191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007775	GCT	2	6	23267	23272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_007775	GGC	2	6	23287	23292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007775	AAG	2	6	23378	23383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604758
523	NC_007775	CG	3	6	23442	23447	0 %	0 %	50 %	50 %	86604758
524	NC_007775	GCT	2	6	23496	23501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604758
525	NC_007775	GCCGC	2	10	23530	23539	0 %	0 %	40 %	60 %	86604758
526	NC_007775	AGG	2	6	23566	23571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604758
527	NC_007775	CCG	3	9	23661	23669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604758
528	NC_007775	CCG	2	6	23701	23706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604758
529	NC_007775	CGC	2	6	23763	23768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604758
530	NC_007775	A	6	6	23797	23802	100 %	0 %	0 %	0 %	86604758
531	NC_007775	AGG	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604758
532	NC_007775	TTC	2	6	23872	23877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604758
533	NC_007775	CCCG	2	8	23889	23896	0 %	0 %	25 %	75 %	86604758
534	NC_007775	GTTGAG	2	12	23944	23955	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	86604758
535	NC_007775	CCA	2	6	23964	23969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604758
536	NC_007775	GAG	2	6	24046	24051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604758
537	NC_007775	GCG	2	6	24064	24069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604758
538	NC_007775	TGG	2	6	24104	24109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604758
539	NC_007775	TCG	2	6	24116	24121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604758
540	NC_007775	CCT	2	6	24138	24143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604758
541	NC_007775	CGGT	2	8	24232	24239	0 %	25 %	50 %	25 %	86604758
542	NC_007775	CTG	2	6	24388	24393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604758
543	NC_007775	TGC	2	6	24425	24430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604758
544	NC_007775	GGCC	2	8	24466	24473	0 %	0 %	50 %	50 %	86604758
545	NC_007775	GCG	2	6	24483	24488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604758
546	NC_007775	CCA	2	6	24552	24557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604758
547	NC_007775	ACC	2	6	24590	24595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604758
548	NC_007775	CCCG	2	8	24600	24607	0 %	0 %	25 %	75 %	86604758
549	NC_007775	GCT	2	6	24714	24719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604758
550	NC_007775	GGT	2	6	24731	24736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007775	GCC	2	6	24796	24801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_007775	GGA	2	6	24902	24907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007775	CCG	2	6	24943	24948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
554	NC_007775	C	6	6	24988	24993	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
555	NC_007775	GGC	2	6	25030	25035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604759
556	NC_007775	CAC	2	6	25046	25051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604759
557	NC_007775	GCA	2	6	25065	25070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
558	NC_007775	A	6	6	25070	25075	100 %	0 %	0 %	0 %	86604759
559	NC_007775	CAG	3	9	25178	25186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
560	NC_007775	GCC	2	6	25203	25208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
561	NC_007775	CAG	2	6	25238	25243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
562	NC_007775	CCAGCC	2	12	25286	25297	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	86604759
563	NC_007775	AAGG	2	8	25416	25423	50 %	0 %	50 %	0 %	86604759
564	NC_007775	CCGC	2	8	25429	25436	0 %	0 %	25 %	75 %	86604759
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566	NC_007775	CAG	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
567	NC_007775	CGC	2	6	25512	25517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
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569	NC_007775	C	6	6	25552	25557	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
570	NC_007775	CAG	2	6	25577	25582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
571	NC_007775	CAG	2	6	25586	25591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
572	NC_007775	CAG	2	6	25604	25609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
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575	NC_007775	C	6	6	25648	25653	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
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581	NC_007775	GCA	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
582	NC_007775	GCA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
583	NC_007775	AGT	2	6	25924	25929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604759
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586	NC_007775	CAG	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
587	NC_007775	CAC	3	9	25979	25987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604759
588	NC_007775	CAG	2	6	25997	26002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
589	NC_007775	GCCA	2	8	26007	26014	25 %	0 %	25 %	50 %	86604759
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593	NC_007775	GCC	2	6	26118	26123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_007775	CAGC	2	8	26132	26139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_007775	G	6	6	26158	26163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007775	CGG	2	6	26165	26170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_007775	TCATCT	2	12	26278	26289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	86604760
599	NC_007775	CCAC	2	8	26297	26304	25 %	0 %	0 %	75 %	86604760
600	NC_007775	CAG	2	6	26331	26336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604760
601	NC_007775	CCGCA	2	10	26409	26418	20 %	0 %	20 %	60 %	86604760
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603	NC_007775	GGCA	2	8	26499	26506	25 %	0 %	50 %	25 %	86604760
604	NC_007775	AGT	2	6	26516	26521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604760
605	NC_007775	GAA	2	6	26571	26576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_007775	GAG	2	6	26594	26599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_007775	AGC	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_007775	TGC	2	6	26859	26864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604761
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610	NC_007775	TCG	2	6	26916	26921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604761
611	NC_007775	CAC	2	6	26968	26973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604761
612	NC_007775	C	6	6	26993	26998	0 %	0 %	0 %	100 %	86604761
613	NC_007775	ATC	2	6	27044	27049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604761
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615	NC_007775	CGA	2	6	27100	27105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604761
616	NC_007775	TCA	2	6	27170	27175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604762
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621	NC_007775	CAC	2	6	27312	27317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604762
622	NC_007775	CTT	2	6	27323	27328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604762
623	NC_007775	GCCT	2	8	27338	27345	0 %	25 %	25 %	50 %	86604762
624	NC_007775	ATC	2	6	27409	27414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604762
625	NC_007775	C	6	6	27464	27469	0 %	0 %	0 %	100 %	86604762
626	NC_007775	CGG	2	6	27558	27563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604762
627	NC_007775	CAG	3	9	27597	27605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
628	NC_007775	AGA	2	6	27733	27738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604762
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