MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 63464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007759	GTCAT	2	10	202272	202281	20 %	40 %	20 %	20 %	85858038
4002	NC_007759	ATCC	2	8	202297	202304	25 %	25 %	0 %	50 %	85858038
4003	NC_007759	GAG	2	6	202352	202357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007759	GACA	2	8	202361	202368	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_007759	TCT	2	6	202421	202426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_007759	AGG	2	6	202430	202435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007759	CAG	2	6	202555	202560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858039
4008	NC_007759	ATGAAT	2	12	202613	202624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	85858039
4009	NC_007759	AGG	2	6	202730	202735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
4010	NC_007759	TTC	2	6	202756	202761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858039
4011	NC_007759	TGTCGA	2	12	202770	202781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858039
4012	NC_007759	GAA	2	6	202794	202799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858039
4013	NC_007759	CTG	2	6	202810	202815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858039
4014	NC_007759	TGC	2	6	202889	202894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858039
4015	NC_007759	TGA	2	6	202937	202942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858039
4016	NC_007759	GAT	2	6	202944	202949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858039
4017	NC_007759	GTG	2	6	202966	202971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85858039
4018	NC_007759	GCC	2	6	202972	202977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858039
4019	NC_007759	GGA	2	6	203013	203018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
4020	NC_007759	CTC	2	6	203091	203096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85858039
4021	NC_007759	TGG	2	6	203198	203203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85858039
4022	NC_007759	GAA	2	6	203257	203262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858039
4023	NC_007759	CGC	3	9	203277	203285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858039
4024	NC_007759	AGG	2	6	203288	203293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
4025	NC_007759	AAGA	2	8	203304	203311	75 %	0 %	25 %	0 %	85858039
4026	NC_007759	A	7	7	203326	203332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007759	AGGGCC	2	12	203364	203375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_007759	GAG	3	9	203528	203536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858040
4029	NC_007759	GTC	2	6	203575	203580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858040
4030	NC_007759	T	6	6	203612	203617	0 %	100 %	0 %	0 %	85858040
4031	NC_007759	ATTC	2	8	203652	203659	25 %	50 %	0 %	25 %	85858040
4032	NC_007759	GA	3	6	203714	203719	50 %	0 %	50 %	0 %	85858040
4033	NC_007759	CCAGAT	2	12	203741	203752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858040
4034	NC_007759	T	6	6	203759	203764	0 %	100 %	0 %	0 %	85858040
4035	NC_007759	GAT	2	6	203772	203777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858040
4036	NC_007759	TAA	2	6	203809	203814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85858040
4037	NC_007759	CTGG	2	8	203862	203869	0 %	25 %	50 %	25 %	85858040
4038	NC_007759	GAT	2	6	203910	203915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858040
4039	NC_007759	AAT	2	6	203934	203939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85858040
4040	NC_007759	T	8	8	203987	203994	0 %	100 %	0 %	0 %	85858040
4041	NC_007759	TGAC	2	8	204128	204135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_007759	TTC	2	6	204143	204148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007759	TTC	2	6	204235	204240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858041
4044	NC_007759	GTC	2	6	204242	204247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858041
4045	NC_007759	TCGT	2	8	204259	204266	0 %	50 %	25 %	25 %	85858041
4046	NC_007759	CAG	2	6	204333	204338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858041
4047	NC_007759	CGC	2	6	204358	204363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858041
4048	NC_007759	TGT	2	6	204377	204382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85858041
4049	NC_007759	TCA	2	6	204446	204451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858041
4050	NC_007759	CCG	2	6	204497	204502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858041
4051	NC_007759	CAT	2	6	204621	204626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858041
4052	NC_007759	C	7	7	204650	204656	0 %	0 %	0 %	100 %	85858041
4053	NC_007759	GAG	2	6	204791	204796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858041
4054	NC_007759	TTC	2	6	204857	204862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_007759	T	6	6	204879	204884	0 %	100 %	0 %	0 %	85858042
4056	NC_007759	TCT	2	6	204912	204917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858042
4057	NC_007759	CTG	2	6	204944	204949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858042
4058	NC_007759	TCCGT	2	10	205051	205060	0 %	40 %	20 %	40 %	85858042
4059	NC_007759	TGA	2	6	205248	205253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007759	CGG	2	6	205268	205273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_007759	T	6	6	205291	205296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_007759	GTT	2	6	205302	205307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007759	TTC	2	6	205346	205351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_007759	A	6	6	205390	205395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_007759	CCA	2	6	205444	205449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_007759	GC	3	6	205485	205490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_007759	GAA	2	6	205541	205546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858043
4068	NC_007759	A	9	9	205545	205553	100 %	0 %	0 %	0 %	85858043
4069	NC_007759	GAT	2	6	205622	205627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858043
4070	NC_007759	ATC	2	6	205634	205639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858043
4071	NC_007759	TC	3	6	205703	205708	0 %	50 %	0 %	50 %	85858043
4072	NC_007759	GGAA	2	8	205731	205738	50 %	0 %	50 %	0 %	85858043
4073	NC_007759	CTG	2	6	205835	205840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858043
4074	NC_007759	CAG	3	9	205931	205939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858043
4075	NC_007759	GCGG	2	8	206021	206028	0 %	0 %	75 %	25 %	85858043
4076	NC_007759	CTT	2	6	206060	206065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858043
4077	NC_007759	CTG	2	6	206165	206170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858043
4078	NC_007759	GGC	2	6	206191	206196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858043
4079	NC_007759	GGC	2	6	206224	206229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858043
4080	NC_007759	TGA	2	6	206298	206303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858043
4081	NC_007759	CAGG	2	8	206337	206344	25 %	0 %	50 %	25 %	85858043
4082	NC_007759	GGA	2	6	206408	206413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858043
4083	NC_007759	AGA	2	6	206443	206448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858043
4084	NC_007759	CGA	2	6	206476	206481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858043
4085	NC_007759	GCC	3	9	206534	206542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858043
4086	NC_007759	A	6	6	206595	206600	100 %	0 %	0 %	0 %	85858043
4087	NC_007759	TCC	2	6	206722	206727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85858043
4088	NC_007759	CGAA	2	8	206731	206738	50 %	0 %	25 %	25 %	85858043
4089	NC_007759	CCGC	2	8	206785	206792	0 %	0 %	25 %	75 %	85858043
4090	NC_007759	GCC	2	6	206815	206820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858043
4091	NC_007759	AGA	2	6	206836	206841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858043
4092	NC_007759	ATCG	2	8	206843	206850	25 %	25 %	25 %	25 %	85858043
4093	NC_007759	CGT	2	6	207036	207041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858044
4094	NC_007759	ATT	2	6	207055	207060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85858044
4095	NC_007759	GCC	2	6	207085	207090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858044
4096	NC_007759	C	6	6	207144	207149	0 %	0 %	0 %	100 %	85858044
4097	NC_007759	AGGC	2	8	207298	207305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_007759	GAT	2	6	207323	207328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_007759	ATCGA	2	10	207504	207513	40 %	20 %	20 %	20 %	85858045
4100	NC_007759	CCT	2	6	207599	207604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85858045
4101	NC_007759	GCC	2	6	207639	207644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858045
4102	NC_007759	TCG	2	6	207733	207738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858045
4103	NC_007759	GGC	2	6	207751	207756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858045
4104	NC_007759	CGGC	2	8	207804	207811	0 %	0 %	50 %	50 %	85858046
4105	NC_007759	CCG	2	6	207844	207849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858046
4106	NC_007759	TCGAT	2	10	207857	207866	20 %	40 %	20 %	20 %	85858046
4107	NC_007759	TGC	2	6	207871	207876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858046
4108	NC_007759	TTC	2	6	207919	207924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858046
4109	NC_007759	GCC	2	6	207994	207999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858046
4110	NC_007759	GAA	2	6	208003	208008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858046
4111	NC_007759	GAA	2	6	208029	208034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858046
4112	NC_007759	ATC	2	6	208036	208041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858046
4113	NC_007759	CTG	2	6	208060	208065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858046
4114	NC_007759	TCG	2	6	208141	208146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858046
4115	NC_007759	CGGCG	2	10	208154	208163	0 %	0 %	60 %	40 %	85858046
4116	NC_007759	GAC	2	6	208180	208185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858046
4117	NC_007759	ATGGA	2	10	208210	208219	40 %	20 %	40 %	0 %	85858046
4118	NC_007759	GGA	2	6	208230	208235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858046
4119	NC_007759	GAA	2	6	208291	208296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858046
4120	NC_007759	GTC	2	6	208446	208451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858047
4121	NC_007759	CT	3	6	208508	208513	0 %	50 %	0 %	50 %	85858047
4122	NC_007759	TTG	2	6	208564	208569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85858047
4123	NC_007759	CGC	2	6	208655	208660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858047
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4125	NC_007759	CCTC	2	8	208684	208691	0 %	25 %	0 %	75 %	85858047
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4242	NC_007759	A	6	6	214691	214696	100 %	0 %	0 %	0 %	85858053
4243	NC_007759	TGATG	2	10	214756	214765	20 %	40 %	40 %	0 %	85858053
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4245	NC_007759	A	6	6	214865	214870	100 %	0 %	0 %	0 %	85858053
4246	NC_007759	AAG	2	6	214979	214984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858053
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4248	NC_007759	G	9	9	215036	215044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_007759	GAC	2	6	221207	221212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4498	NC_007759	GTC	2	6	226864	226869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858064
4499	NC_007759	CTTT	2	8	226884	226891	0 %	75 %	0 %	25 %	85858064
4500	NC_007759	T	6	6	226889	226894	0 %	100 %	0 %	0 %	85858064

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