MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007678	TCG	2	6	24578	24583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816887
502	NC_007678	CCG	2	6	24704	24709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816887
503	NC_007678	GGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816887
504	NC_007678	GAT	2	6	24787	24792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816887
505	NC_007678	CTC	2	6	24798	24803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816887
506	NC_007678	AGCGG	2	10	24805	24814	20 %	0 %	60 %	20 %	83816887
507	NC_007678	GAA	2	6	24903	24908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816887
508	NC_007678	CAG	2	6	24910	24915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816887
509	NC_007678	ATGG	2	8	24950	24957	25 %	25 %	50 %	0 %	83816887
510	NC_007678	ACCT	2	8	24975	24982	25 %	25 %	0 %	50 %	83816871
511	NC_007678	ACCG	2	8	24994	25001	25 %	0 %	25 %	50 %	83816871
512	NC_007678	GAT	2	6	25070	25075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816871
513	NC_007678	TCTCT	2	10	25100	25109	0 %	60 %	0 %	40 %	83816871
514	NC_007678	CAG	2	6	25280	25285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816871
515	NC_007678	TA	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
516	NC_007678	AGGT	2	8	25492	25499	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
517	NC_007678	CCT	2	6	25547	25552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816871
518	NC_007678	CTT	2	6	25580	25585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
519	NC_007678	CAC	2	6	25644	25649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816871
520	NC_007678	GAC	2	6	25677	25682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816871
521	NC_007678	CGT	2	6	25771	25776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
522	NC_007678	TGT	2	6	25805	25810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83816871
523	NC_007678	TGGA	2	8	25817	25824	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
524	NC_007678	GTA	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816871
525	NC_007678	CTTG	2	8	25877	25884	0 %	50 %	25 %	25 %	83816871
526	NC_007678	GTA	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816871
527	NC_007678	CAGT	2	8	25943	25950	25 %	25 %	25 %	25 %	83816871
528	NC_007678	GAGCC	2	10	25951	25960	20 %	0 %	40 %	40 %	83816871
529	NC_007678	GGT	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816871
530	NC_007678	AGG	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816871
531	NC_007678	ACT	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
532	NC_007678	ACC	2	6	26145	26150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816871
533	NC_007678	TC	3	6	26252	26257	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
534	NC_007678	TTC	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
535	NC_007678	ATC	2	6	26367	26372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
536	NC_007678	CT	3	6	26525	26530	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
537	NC_007678	AGA	2	6	26607	26612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816871
538	NC_007678	TCT	2	6	26618	26623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
539	NC_007678	TGC	2	6	26682	26687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
540	NC_007678	CGT	2	6	26694	26699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
541	NC_007678	ATC	3	9	26746	26754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
542	NC_007678	TTC	2	6	26760	26765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
543	NC_007678	GA	3	6	26809	26814	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
544	NC_007678	T	6	6	26852	26857	0 %	100 %	0 %	0 %	83816871
545	NC_007678	GAA	2	6	26870	26875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816871
546	NC_007678	GTC	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
547	NC_007678	GA	3	6	26899	26904	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
548	NC_007678	GGAT	2	8	26905	26912	25 %	25 %	50 %	0 %	83816871
549	NC_007678	ACT	2	6	26923	26928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
550	NC_007678	GGA	2	6	26993	26998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816871
551	NC_007678	CCT	2	6	27040	27045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816871
552	NC_007678	CAA	2	6	27059	27064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816871
553	NC_007678	CA	3	6	27071	27076	50 %	0 %	0 %	50 %	83816871
554	NC_007678	GTA	2	6	27090	27095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816871
555	NC_007678	TCCC	2	8	27241	27248	0 %	25 %	0 %	75 %	83816871
556	NC_007678	CGA	2	6	27272	27277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816871
557	NC_007678	AT	3	6	27302	27307	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
558	NC_007678	CTC	2	6	27330	27335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816871
559	NC_007678	GT	3	6	27403	27408	0 %	50 %	50 %	0 %	83816871
560	NC_007678	CTT	2	6	27419	27424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
561	NC_007678	ATC	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
562	NC_007678	CCT	2	6	27509	27514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816871
563	NC_007678	TCC	2	6	27688	27693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816871
564	NC_007678	CGT	2	6	27701	27706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
565	NC_007678	CTT	2	6	27735	27740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816871
566	NC_007678	AGG	2	6	27784	27789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816871
567	NC_007678	GAT	2	6	27891	27896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816871
568	NC_007678	ACT	2	6	27958	27963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816871
569	NC_007678	GTC	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
570	NC_007678	CAAG	2	8	28031	28038	50 %	0 %	25 %	25 %	83816871
571	NC_007678	TTGA	2	8	28077	28084	25 %	50 %	25 %	0 %	83816871
572	NC_007678	TCG	2	6	28088	28093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816871
573	NC_007678	ACCC	2	8	28182	28189	25 %	0 %	0 %	75 %	83816871
574	NC_007678	GTA	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007678	TCA	2	6	28249	28254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816888
576	NC_007678	CGGC	2	8	28281	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	83816888
577	NC_007678	CTT	2	6	28314	28319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816888
578	NC_007678	CTT	2	6	28358	28363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816888
579	NC_007678	ATC	2	6	28437	28442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816888
580	NC_007678	ATC	2	6	28452	28457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816888
581	NC_007678	CTT	2	6	28516	28521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
582	NC_007678	GAGC	2	8	28614	28621	25 %	0 %	50 %	25 %	83816889
583	NC_007678	TCC	2	6	28659	28664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816889
584	NC_007678	CGG	2	6	28706	28711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816889
585	NC_007678	CTA	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816889
586	NC_007678	ATC	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816889
587	NC_007678	GGC	2	6	28804	28809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816889
588	NC_007678	TCT	2	6	28815	28820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
589	NC_007678	TTC	2	6	28880	28885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
590	NC_007678	GCT	2	6	28899	28904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816889
591	NC_007678	CTC	2	6	28927	28932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816889
592	NC_007678	TAG	2	6	29091	29096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816889
593	NC_007678	ACTC	2	8	29277	29284	25 %	25 %	0 %	50 %	83816873
594	NC_007678	CGT	2	6	29350	29355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816873
595	NC_007678	CCG	2	6	29385	29390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816873
596	NC_007678	GCTTGC	2	12	29461	29472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816873
597	NC_007678	CGA	2	6	29509	29514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816873
598	NC_007678	GGT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816873
599	NC_007678	CGT	2	6	29604	29609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_007678	TGTC	2	8	29621	29628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_007678	GGT	2	6	29629	29634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007678	TGGAG	2	10	29673	29682	20 %	20 %	60 %	0 %	83816877
603	NC_007678	GCCA	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	83816877
604	NC_007678	GGC	2	6	29708	29713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816877
605	NC_007678	GTC	2	6	29728	29733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
606	NC_007678	TCG	2	6	29821	29826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
607	NC_007678	CGC	2	6	29930	29935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
608	NC_007678	GCA	2	6	29938	29943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
609	NC_007678	CGCGG	2	10	29951	29960	0 %	0 %	60 %	40 %	83816877
610	NC_007678	CCGC	2	8	30006	30013	0 %	0 %	25 %	75 %	83816877
611	NC_007678	CT	3	6	30016	30021	0 %	50 %	0 %	50 %	83816877
612	NC_007678	CGA	2	6	30082	30087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
613	NC_007678	CTT	2	6	30122	30127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816877
614	NC_007678	AGT	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816877
615	NC_007678	CGAG	2	8	30269	30276	25 %	0 %	50 %	25 %	83816877
616	NC_007678	CCA	2	6	30322	30327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816877
617	NC_007678	CGG	2	6	30353	30358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816877
618	NC_007678	TG	3	6	30366	30371	0 %	50 %	50 %	0 %	83816877
619	NC_007678	TGG	2	6	30373	30378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816877
620	NC_007678	GTC	2	6	30417	30422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
621	NC_007678	GC	3	6	30448	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	83816877
622	NC_007678	TCC	2	6	30484	30489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816877
623	NC_007678	GCC	2	6	30519	30524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
624	NC_007678	CGA	2	6	30578	30583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
625	NC_007678	TCG	2	6	30631	30636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
626	NC_007678	CCT	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816877
627	NC_007678	GGGTC	2	10	30689	30698	0 %	20 %	60 %	20 %	83816877
628	NC_007678	GCC	2	6	30745	30750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
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630	NC_007678	GAG	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816877
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