MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 3133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	CCGGC	2	10	311	320	0 %	0 %	40 %	60 %	83815237
2	NC_007677	TCCAG	2	10	496	505	20 %	20 %	20 %	40 %	83815237
3	NC_007677	GCCCC	2	10	5157	5166	0 %	0 %	20 %	80 %	83814655
4	NC_007677	GTTCG	2	10	5185	5194	0 %	40 %	40 %	20 %	83814655
5	NC_007677	CCCAC	2	10	5711	5720	20 %	0 %	0 %	80 %	83814655
6	NC_007677	CAAGA	2	10	6623	6632	60 %	0 %	20 %	20 %	83814221
7	NC_007677	CTCGA	2	10	6702	6711	20 %	20 %	20 %	40 %	83814221
8	NC_007677	GGCCC	2	10	7751	7760	0 %	0 %	40 %	60 %	83815955
9	NC_007677	CTCGC	2	10	9704	9713	0 %	20 %	20 %	60 %	83816549
10	NC_007677	AAAAT	2	10	15852	15861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007677	CGACG	2	10	15925	15934	20 %	0 %	40 %	40 %	83816060
12	NC_007677	TCGCT	2	10	18490	18499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007677	GTCCT	2	10	18675	18684	0 %	40 %	20 %	40 %	83814512
14	NC_007677	TCGTT	2	10	20799	20808	0 %	60 %	20 %	20 %	83815798
15	NC_007677	GCCCG	2	10	26534	26543	0 %	0 %	40 %	60 %	83816180
16	NC_007677	CGCGC	2	10	27564	27573	0 %	0 %	40 %	60 %	83814400
17	NC_007677	GCCCG	2	10	27686	27695	0 %	0 %	40 %	60 %	83814400
18	NC_007677	GAGCG	2	10	29200	29209	20 %	0 %	60 %	20 %	83815961
19	NC_007677	CCCAT	2	10	36621	36630	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007677	GGCAA	2	10	38065	38074	40 %	0 %	40 %	20 %	83814585
21	NC_007677	CACCT	2	10	38878	38887	20 %	20 %	0 %	60 %	83814585
22	NC_007677	GCCGA	2	10	39693	39702	20 %	0 %	40 %	40 %	83816635
23	NC_007677	ACAGG	2	10	39822	39831	40 %	0 %	40 %	20 %	83816635
24	NC_007677	GCCTT	2	10	40927	40936	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007677	CGCCC	2	10	45093	45102	0 %	0 %	20 %	80 %	83816345
26	NC_007677	GCCCG	2	10	45820	45829	0 %	0 %	40 %	60 %	83814678
27	NC_007677	CGTTC	2	10	46167	46176	0 %	40 %	20 %	40 %	83816340
28	NC_007677	GCGCG	2	10	48176	48185	0 %	0 %	60 %	40 %	83815928
29	NC_007677	GGCCG	2	10	48701	48710	0 %	0 %	60 %	40 %	83815928
30	NC_007677	CAAAA	2	10	49357	49366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007677	CGGCG	2	10	49491	49500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007677	CCAGC	2	10	49635	49644	20 %	0 %	20 %	60 %	83814408
33	NC_007677	GCGCC	2	10	50238	50247	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_007677	TCCGC	2	10	50422	50431	0 %	20 %	20 %	60 %	83816022
35	NC_007677	CGCAG	2	10	50745	50754	20 %	0 %	40 %	40 %	83816022
36	NC_007677	AGACG	2	10	53160	53169	40 %	0 %	40 %	20 %	83815382
37	NC_007677	GCGCC	2	10	53439	53448	0 %	0 %	40 %	60 %	83815382
38	NC_007677	CGCCC	2	10	54088	54097	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
39	NC_007677	TACGC	2	10	54817	54826	20 %	20 %	20 %	40 %	83814393
40	NC_007677	GTGCG	2	10	54907	54916	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007677	GGCCG	2	10	55807	55816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007677	CGCGC	2	10	56030	56039	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007677	CCGGG	2	10	56591	56600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007677	GCGCC	2	10	57987	57996	0 %	0 %	40 %	60 %	83815019
45	NC_007677	CCGGC	2	10	58707	58716	0 %	0 %	40 %	60 %	83815019
46	NC_007677	GCCTC	2	10	59063	59072	0 %	20 %	20 %	60 %	83815019
47	NC_007677	TCGCG	2	10	60978	60987	0 %	20 %	40 %	40 %	83815935
48	NC_007677	GGGGC	2	10	61401	61410	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007677	CTCGT	2	10	62647	62656	0 %	40 %	20 %	40 %	83816849
50	NC_007677	TCGCG	2	10	62663	62672	0 %	20 %	40 %	40 %	83816849
51	NC_007677	ACCCG	2	10	65604	65613	20 %	0 %	20 %	60 %	83814652
52	NC_007677	CGGGG	2	10	65800	65809	0 %	0 %	80 %	20 %	83814652
53	NC_007677	TCGCG	2	10	67077	67086	0 %	20 %	40 %	40 %	83815682
54	NC_007677	ACGAG	2	10	68894	68903	40 %	0 %	40 %	20 %	83814071
55	NC_007677	GGGTC	2	10	71255	71264	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007677	GCCCC	2	10	71454	71463	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
57	NC_007677	CCGCC	2	10	72049	72058	0 %	0 %	20 %	80 %	83814830
58	NC_007677	CGACG	2	10	72239	72248	20 %	0 %	40 %	40 %	83814830
59	NC_007677	GCACC	2	10	72401	72410	20 %	0 %	20 %	60 %	83814830
60	NC_007677	CGGCG	2	10	72716	72725	0 %	0 %	60 %	40 %	83814830
61	NC_007677	ACGGG	2	10	75101	75110	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007677	GGCCA	2	10	76310	76319	20 %	0 %	40 %	40 %	83814430
63	NC_007677	GCGCC	2	10	76969	76978	0 %	0 %	40 %	60 %	83814430
64	NC_007677	GTATA	2	10	79443	79452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007677	GAAGG	2	10	81146	81155	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007677	GAATT	2	10	81578	81587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007677	GCTCC	2	10	82542	82551	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_007677	GCCGT	2	10	82968	82977	0 %	20 %	40 %	40 %	83815139
69	NC_007677	CCGGC	2	10	83611	83620	0 %	0 %	40 %	60 %	83815139
70	NC_007677	GAAGG	2	10	84431	84440	40 %	0 %	60 %	0 %	83815139
71	NC_007677	GTTTC	2	10	85112	85121	0 %	60 %	20 %	20 %	83815858
72	NC_007677	GGACG	2	10	86081	86090	20 %	0 %	60 %	20 %	83815858
73	NC_007677	CTCCG	2	10	86513	86522	0 %	20 %	20 %	60 %	83815858
74	NC_007677	ATCGA	2	10	87058	87067	40 %	20 %	20 %	20 %	83815858
75	NC_007677	GGCGC	2	10	87978	87987	0 %	0 %	60 %	40 %	83815394
76	NC_007677	GGGGC	2	10	88295	88304	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007677	GTGGG	2	10	88442	88451	0 %	20 %	80 %	0 %	161986637
78	NC_007677	CTCGT	2	10	89072	89081	0 %	40 %	20 %	40 %	161986637
79	NC_007677	CGGCG	2	10	89595	89604	0 %	0 %	60 %	40 %	161986637
80	NC_007677	GGGAC	2	10	90088	90097	20 %	0 %	60 %	20 %	83814146
81	NC_007677	AGCTG	2	10	90119	90128	20 %	20 %	40 %	20 %	83814146
82	NC_007677	CGGCG	2	10	92036	92045	0 %	0 %	60 %	40 %	161986629
83	NC_007677	GCGCC	2	10	92394	92403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_007677	CGGTC	2	10	92566	92575	0 %	20 %	40 %	40 %	83815544
85	NC_007677	GTGGA	2	10	92730	92739	20 %	20 %	60 %	0 %	83815544
86	NC_007677	TCGGG	2	10	94129	94138	0 %	20 %	60 %	20 %	83815544
87	NC_007677	CGGTG	2	10	95734	95743	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007677	GCAAA	2	10	96135	96144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007677	CTTCG	2	10	96956	96965	0 %	40 %	20 %	40 %	83814983
90	NC_007677	CGGCA	2	10	97892	97901	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007677	GGGCG	2	10	99895	99904	0 %	0 %	80 %	20 %	83816237
92	NC_007677	CGGGG	2	10	101345	101354	0 %	0 %	80 %	20 %	83814905
93	NC_007677	CCCGC	2	10	104831	104840	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
94	NC_007677	GCCGA	2	10	104934	104943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007677	GCTCA	2	10	105708	105717	20 %	20 %	20 %	40 %	83814131
96	NC_007677	GAGCG	2	10	106698	106707	20 %	0 %	60 %	20 %	83814131
97	NC_007677	ACCGA	2	10	107271	107280	40 %	0 %	20 %	40 %	83814131
98	NC_007677	CGCCC	2	10	109019	109028	0 %	0 %	20 %	80 %	83816514
99	NC_007677	TGCGG	2	10	109309	109318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007677	CAGTG	2	10	111114	111123	20 %	20 %	40 %	20 %	83815223
101	NC_007677	GCCGG	2	10	112579	112588	0 %	0 %	60 %	40 %	83816801
102	NC_007677	CCCGG	2	10	113881	113890	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_007677	GGACG	2	10	116733	116742	20 %	0 %	60 %	20 %	83816233
104	NC_007677	CGGGC	2	10	116929	116938	0 %	0 %	60 %	40 %	83816233
105	NC_007677	CCCAC	2	10	118136	118145	20 %	0 %	0 %	80 %	83814357
106	NC_007677	ACGCC	2	10	118220	118229	20 %	0 %	20 %	60 %	83814357
107	NC_007677	CAGCA	2	10	118951	118960	40 %	0 %	20 %	40 %	83814357
108	NC_007677	CGGAG	2	10	124487	124496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007677	CTTTC	2	10	124632	124641	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007677	GATCA	2	10	126158	126167	40 %	20 %	20 %	20 %	83816843
111	NC_007677	GGGCG	2	10	126751	126760	0 %	0 %	80 %	20 %	83816843
112	NC_007677	GGCTG	2	10	127093	127102	0 %	20 %	60 %	20 %	83816843
113	NC_007677	CAGCG	2	10	128090	128099	20 %	0 %	40 %	40 %	83814670
114	NC_007677	GCCGA	2	10	128982	128991	20 %	0 %	40 %	40 %	83814670
115	NC_007677	GCGAA	2	10	130366	130375	40 %	0 %	40 %	20 %	83815813
116	NC_007677	AGGAG	2	10	132141	132150	40 %	0 %	60 %	0 %	83816358
117	NC_007677	AAAAC	2	10	132896	132905	80 %	0 %	0 %	20 %	83814626
118	NC_007677	GGCAG	2	10	133759	133768	20 %	0 %	60 %	20 %	83814626
119	NC_007677	GGCGC	2	10	134549	134558	0 %	0 %	60 %	40 %	83816505
120	NC_007677	CGGTC	2	10	136184	136193	0 %	20 %	40 %	40 %	83814808
121	NC_007677	ACAGA	2	10	136325	136334	60 %	0 %	20 %	20 %	83814808
122	NC_007677	GCCGG	2	10	136809	136818	0 %	0 %	60 %	40 %	83814808
123	NC_007677	CGACG	2	10	137109	137118	20 %	0 %	40 %	40 %	83814808
124	NC_007677	GCGTC	2	10	140154	140163	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007677	CGACG	2	10	141613	141622	20 %	0 %	40 %	40 %	83815585
126	NC_007677	GCGCC	2	10	142399	142408	0 %	0 %	40 %	60 %	83815585
127	NC_007677	CGGGC	2	10	143006	143015	0 %	0 %	60 %	40 %	83815585
128	NC_007677	CGGCC	2	10	143932	143941	0 %	0 %	40 %	60 %	83815585
129	NC_007677	ACTGG	2	10	144027	144036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007677	TGCCC	2	10	145076	145085	0 %	20 %	20 %	60 %	83814934
131	NC_007677	ACGCG	2	10	146666	146675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007677	CGATT	2	10	147160	147169	20 %	40 %	20 %	20 %	83814475
133	NC_007677	CTGGT	2	10	149918	149927	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007677	GCAGT	2	10	151044	151053	20 %	20 %	40 %	20 %	83815760
135	NC_007677	CGGAT	2	10	152282	152291	20 %	20 %	40 %	20 %	83816200
136	NC_007677	CGTCC	2	10	152374	152383	0 %	20 %	20 %	60 %	83816200
137	NC_007677	GACCG	2	10	152429	152438	20 %	0 %	40 %	40 %	83816200
138	NC_007677	CGTCT	2	10	153112	153121	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007677	CGACA	2	10	153489	153498	40 %	0 %	20 %	40 %	83814604
140	NC_007677	GGACG	2	10	154613	154622	20 %	0 %	60 %	20 %	83814604
141	NC_007677	GACCT	2	10	155395	155404	20 %	20 %	20 %	40 %	83814604
142	NC_007677	CCGTC	2	10	155700	155709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_007677	CCGGG	2	10	155836	155845	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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150	NC_007677	ATTGA	2	10	162619	162628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007677	GGACG	2	10	163076	163085	20 %	0 %	60 %	20 %	83816090
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241	NC_007677	TATAG	2	10	241361	241370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_007677	ACCGA	2	10	244740	244749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
247	NC_007677	CGGCG	2	10	245378	245387	0 %	0 %	60 %	40 %	83815826
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255	NC_007677	TGTCG	2	10	251943	251952	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_007677	CGGGG	3	15	252961	252975	0 %	0 %	80 %	20 %	83814913
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259	NC_007677	GCCTC	2	10	261456	261465	0 %	20 %	20 %	60 %	83815044
260	NC_007677	AAGGC	2	10	262034	262043	40 %	0 %	40 %	20 %	83815044
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262	NC_007677	CTCTT	2	10	263292	263301	0 %	60 %	0 %	40 %	83815044
263	NC_007677	CTCCC	2	10	263710	263719	0 %	20 %	0 %	80 %	83815044
264	NC_007677	AGAGC	2	10	263974	263983	40 %	0 %	40 %	20 %	83815044
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271	NC_007677	TGGGC	2	10	274001	274010	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
272	NC_007677	TCTCC	2	10	275735	275744	0 %	40 %	0 %	60 %	83815865
273	NC_007677	ACCCC	2	10	275980	275989	20 %	0 %	0 %	80 %	83815309
274	NC_007677	GGGAC	2	10	276536	276545	20 %	0 %	60 %	20 %	83814576
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