MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_007613	GTG	2	6	168972	168977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984988
3503	NC_007613	TTG	2	6	168982	168987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984988
3504	NC_007613	ACA	2	6	169034	169039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984988
3505	NC_007613	TAA	2	6	169070	169075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161984988
3506	NC_007613	TGG	2	6	169078	169083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984988
3507	NC_007613	TGG	2	6	169105	169110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984988
3508	NC_007613	A	6	6	169151	169156	100 %	0 %	0 %	0 %	161984988
3509	NC_007613	AAC	2	6	169174	169179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984988
3510	NC_007613	CGGC	2	8	169202	169209	0 %	0 %	50 %	50 %	161984988
3511	NC_007613	ACG	2	6	169284	169289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984988
3512	NC_007613	TGG	3	9	169291	169299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984988
3513	NC_007613	GCT	2	6	169324	169329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984988
3514	NC_007613	TGC	2	6	169444	169449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984988
3515	NC_007613	GGC	2	6	169460	169465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984988
3516	NC_007613	GTT	2	6	169508	169513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984988
3517	NC_007613	TGA	2	6	169586	169591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984988
3518	NC_007613	TGC	2	6	169597	169602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984988
3519	NC_007613	GGC	2	6	169656	169661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_007613	ATT	2	6	169725	169730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542763
3521	NC_007613	GACT	2	8	169783	169790	25 %	25 %	25 %	25 %	82542763
3522	NC_007613	GTC	2	6	169804	169809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542763
3523	NC_007613	TCA	2	6	169868	169873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542763
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3525	NC_007613	CGA	2	6	169938	169943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542763
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3528	NC_007613	GCCC	2	8	170166	170173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3529	NC_007613	TTC	2	6	170202	170207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_007613	A	6	6	170234	170239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_007613	GGC	2	6	170303	170308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984987
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3533	NC_007613	ACCA	2	8	170424	170431	50 %	0 %	0 %	50 %	161984987
3534	NC_007613	CCG	2	6	170449	170454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984987
3535	NC_007613	TCA	2	6	170488	170493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984987
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3539	NC_007613	T	7	7	170698	170704	0 %	100 %	0 %	0 %	161984987
3540	NC_007613	G	6	6	170765	170770	0 %	0 %	100 %	0 %	161984987
3541	NC_007613	ATA	2	6	170813	170818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161984987
3542	NC_007613	CGC	2	6	170825	170830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984987
3543	NC_007613	TGC	2	6	170946	170951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984987
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3545	NC_007613	TCG	2	6	171044	171049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984987
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3548	NC_007613	ATC	2	6	171082	171087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_007613	A	8	8	171100	171107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_007613	CGT	2	6	171116	171121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_007613	GCA	2	6	171155	171160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542765
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3553	NC_007613	CCG	2	6	171278	171283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542765
3554	NC_007613	CTT	2	6	171371	171376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542765
3555	NC_007613	ACT	2	6	171394	171399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542765
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3560	NC_007613	TGG	2	6	171642	171647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542765
3561	NC_007613	CTT	2	6	171662	171667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542765
3562	NC_007613	TCG	2	6	171682	171687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542765
3563	NC_007613	AG	3	6	171768	171773	50 %	0 %	50 %	0 %	82542765
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3565	NC_007613	T	6	6	171821	171826	0 %	100 %	0 %	0 %	82542765
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3570	NC_007613	CTG	2	6	172047	172052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542766
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3573	NC_007613	CTCG	2	8	172109	172116	0 %	25 %	25 %	50 %	82542766
3574	NC_007613	CAG	2	6	172185	172190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542766
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3576	NC_007613	CGGT	2	8	172231	172238	0 %	25 %	50 %	25 %	82542766
3577	NC_007613	GTG	2	6	172441	172446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542766
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3583	NC_007613	TCG	2	6	172699	172704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542766
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3588	NC_007613	CTT	2	6	172928	172933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542766
3589	NC_007613	TGA	2	6	172946	172951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542766
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3593	NC_007613	CA	4	8	173184	173191	50 %	0 %	0 %	50 %	82542766
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3603	NC_007613	GCA	3	9	173675	173683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542766
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3607	NC_007613	CCGC	2	8	173888	173895	0 %	0 %	25 %	75 %	82542766
3608	NC_007613	AAG	2	6	173908	173913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542766
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3610	NC_007613	GCC	2	6	173994	173999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542766
3611	NC_007613	GTTCT	2	10	174063	174072	0 %	60 %	20 %	20 %	82542766
3612	NC_007613	CGC	2	6	174081	174086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542766
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3617	NC_007613	TCAA	2	8	174484	174491	50 %	25 %	0 %	25 %	82542766
3618	NC_007613	TCA	2	6	174580	174585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542766
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3621	NC_007613	CAC	2	6	174805	174810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542767
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3997	NC_007613	TC	3	6	194548	194553	0 %	50 %	0 %	50 %	82542783
3998	NC_007613	TTA	2	6	194565	194570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542783
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