MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007613	GAT	2	6	121857	121862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542721
2502	NC_007613	TCG	2	6	121881	121886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2503	NC_007613	CGT	2	6	121897	121902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2504	NC_007613	TGGC	2	8	121921	121928	0 %	25 %	50 %	25 %	82542721
2505	NC_007613	GCT	2	6	121938	121943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2506	NC_007613	GCAGAT	2	12	121948	121959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82542721
2507	NC_007613	TG	3	6	122015	122020	0 %	50 %	50 %	0 %	82542721
2508	NC_007613	CG	3	6	122040	122045	0 %	0 %	50 %	50 %	82542721
2509	NC_007613	CGA	2	6	122076	122081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2510	NC_007613	TGC	2	6	122124	122129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2511	NC_007613	CTG	2	6	122137	122142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542721
2512	NC_007613	CGC	2	6	122202	122207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542721
2513	NC_007613	GAA	2	6	122218	122223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542721
2514	NC_007613	CTA	2	6	122226	122231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542721
2515	NC_007613	GGT	2	6	122322	122327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542721
2516	NC_007613	GGC	2	6	122400	122405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542721
2517	NC_007613	GCG	2	6	122410	122415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542721
2518	NC_007613	CAAC	2	8	122508	122515	50 %	0 %	0 %	50 %	82542721
2519	NC_007613	TAA	2	6	122566	122571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542721
2520	NC_007613	T	6	6	122630	122635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_007613	AC	3	6	122736	122741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_007613	GAAA	2	8	122838	122845	75 %	0 %	25 %	0 %	161984991
2523	NC_007613	CTTG	2	8	122853	122860	0 %	50 %	25 %	25 %	161984991
2524	NC_007613	AGC	2	6	122874	122879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984991
2525	NC_007613	GCAC	2	8	122880	122887	25 %	0 %	25 %	50 %	161984991
2526	NC_007613	GGGCA	2	10	122915	122924	20 %	0 %	60 %	20 %	161984991
2527	NC_007613	TGGA	2	8	122938	122945	25 %	25 %	50 %	0 %	161984991
2528	NC_007613	ACT	2	6	123014	123019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984991
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2531	NC_007613	GGC	2	6	123072	123077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984991
2532	NC_007613	GCA	2	6	123093	123098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984991
2533	NC_007613	TAAA	2	8	123103	123110	75 %	25 %	0 %	0 %	161984991
2534	NC_007613	TAA	2	6	123167	123172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542723
2535	NC_007613	TTTC	2	8	123183	123190	0 %	75 %	0 %	25 %	82542723
2536	NC_007613	CAGCG	2	10	123193	123202	20 %	0 %	40 %	40 %	82542723
2537	NC_007613	CCA	2	6	123327	123332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542723
2538	NC_007613	TGG	2	6	123473	123478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542723
2539	NC_007613	CGC	2	6	123513	123518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542723
2540	NC_007613	ACC	2	6	123556	123561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542723
2541	NC_007613	GGTA	2	8	123579	123586	25 %	25 %	50 %	0 %	82542723
2542	NC_007613	TTC	2	6	123682	123687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542723
2543	NC_007613	GGCG	2	8	123732	123739	0 %	0 %	75 %	25 %	82542723
2544	NC_007613	ATT	2	6	123904	123909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542723
2545	NC_007613	CAGTTT	2	12	123919	123930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82542723
2546	NC_007613	T	6	6	123928	123933	0 %	100 %	0 %	0 %	82542723
2547	NC_007613	TCT	2	6	123944	123949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_007613	TAA	2	6	124028	124033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542724
2549	NC_007613	AAT	2	6	124069	124074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542724
2550	NC_007613	GA	3	6	124082	124087	50 %	0 %	50 %	0 %	82542724
2551	NC_007613	CGT	2	6	124098	124103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2552	NC_007613	CCG	2	6	124133	124138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542724
2553	NC_007613	CGC	2	6	124153	124158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542724
2554	NC_007613	CTT	2	6	124215	124220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542724
2555	NC_007613	CTG	2	6	124222	124227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2556	NC_007613	CGA	2	6	124251	124256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2557	NC_007613	CTGG	2	8	124369	124376	0 %	25 %	50 %	25 %	82542724
2558	NC_007613	TCG	2	6	124400	124405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2559	NC_007613	TCG	2	6	124427	124432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2560	NC_007613	ACGAC	2	10	124473	124482	40 %	0 %	20 %	40 %	82542724
2561	NC_007613	GCA	2	6	124542	124547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2562	NC_007613	CGC	3	9	124557	124565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542724
2563	NC_007613	TCA	2	6	124617	124622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542724
2564	NC_007613	GATA	2	8	124629	124636	50 %	25 %	25 %	0 %	82542724
2565	NC_007613	TCG	2	6	124640	124645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
2566	NC_007613	GGT	2	6	124651	124656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542724
2567	NC_007613	TAC	2	6	124660	124665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542724
2568	NC_007613	T	8	8	124804	124811	0 %	100 %	0 %	0 %	82542724
2569	NC_007613	CCT	2	6	124828	124833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_007613	A	7	7	124848	124854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_007613	ATA	2	6	124864	124869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_007613	ATT	2	6	124923	124928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542725
2573	NC_007613	AATGCC	2	12	124990	125001	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82542725
2574	NC_007613	CGA	2	6	125102	125107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542725
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2577	NC_007613	GCGA	2	8	125314	125321	25 %	0 %	50 %	25 %	82542725
2578	NC_007613	CGA	2	6	125324	125329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542725
2579	NC_007613	ATT	2	6	125332	125337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542725
2580	NC_007613	CGT	2	6	125443	125448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542726
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2582	NC_007613	CTG	2	6	125653	125658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542726
2583	NC_007613	CGG	2	6	125663	125668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542726
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2586	NC_007613	ATT	2	6	125788	125793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542726
2587	NC_007613	TCCA	2	8	125855	125862	25 %	25 %	0 %	50 %	82542726
2588	NC_007613	GGCTG	2	10	125904	125913	0 %	20 %	60 %	20 %	82542726
2589	NC_007613	TGC	2	6	125948	125953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542726
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2591	NC_007613	A	6	6	125998	126003	100 %	0 %	0 %	0 %	82542726
2592	NC_007613	GATT	2	8	126021	126028	25 %	50 %	25 %	0 %	82542726
2593	NC_007613	TGA	2	6	126041	126046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542726
2594	NC_007613	CCG	3	9	126047	126055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542726
2595	NC_007613	GCT	2	6	126075	126080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542726
2596	NC_007613	CGCT	2	8	126160	126167	0 %	25 %	25 %	50 %	82542726
2597	NC_007613	CCA	2	6	126176	126181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542726
2598	NC_007613	GGT	2	6	126217	126222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542726
2599	NC_007613	GAGC	2	8	126246	126253	25 %	0 %	50 %	25 %	82542726
2600	NC_007613	TGG	2	6	126287	126292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542726
2601	NC_007613	ACA	2	6	126302	126307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542726
2602	NC_007613	GCCT	2	8	126443	126450	0 %	25 %	25 %	50 %	82542726
2603	NC_007613	ATG	2	6	126517	126522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542726
2604	NC_007613	GAT	2	6	126585	126590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542726
2605	NC_007613	CGG	2	6	126630	126635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542726
2606	NC_007613	CCA	2	6	126648	126653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542726
2607	NC_007613	GCG	3	9	126703	126711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542726
2608	NC_007613	ATG	2	6	126754	126759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542726
2609	NC_007613	CG	3	6	126832	126837	0 %	0 %	50 %	50 %	82542726
2610	NC_007613	ACG	2	6	126899	126904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542726
2611	NC_007613	CTG	2	6	126940	126945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542726
2612	NC_007613	GAT	2	6	126963	126968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542726
2613	NC_007613	TC	3	6	127016	127021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_007613	CAT	2	6	127042	127047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542727
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2618	NC_007613	GC	3	6	127221	127226	0 %	0 %	50 %	50 %	82542727
2619	NC_007613	GCG	2	6	127245	127250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542727
2620	NC_007613	CCG	2	6	127267	127272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542727
2621	NC_007613	GCCC	2	8	127282	127289	0 %	0 %	25 %	75 %	82542727
2622	NC_007613	GCG	2	6	127351	127356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542727
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